Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_GIGYF2_0008700

Sequence Length

491 nt

GC Content

0.4766

GCUCCGAGCUCUGUCCAGUGGUGGGAGUAUUACAUCCCCUCCUCUUUCUCCAGCAUUGCCGAAGUAUAAAUUAGCAGAUUAUCGUUACGGCAGAGAAGAAAUGUUAGCACUUUUCCUUAAAGACAACAAGAUACCUUCAGACCUUCUGGAUAAAGAAUUUCUGCCUAUCCUCCAGGAGGAACCCCUUCCACCAUUGGCUCUGGUACCCUUUACAGAAGAAGAACAGAGAAACUUUUCCAUGUCUGUAAAUAGUGCUGCUGUCCUGCGAUUGACAGGACGAGGAGGAGGAGGAACAGUGGUGGGGGCUCCUAGAGGUCGAAGUUCUUCAAGAGGGCGAGGCAGAGGCAGAGGUGAAUGUGGUUUCUACCAAAGAAGUUUUGAUGAAGUAGAGGGUGUUUUUGGUCGAGGAGGUGGCAGAGAAAUGCAUAGAUCGCAGAGCUGGGAGGAAAGGGGUGACAGACGUUUUGAAAAACCAGGACGAAAAGAUGUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-152.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -162.26

Frequency: 0.0000

Diversity: 85.59

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((.(.(.((....)).).).)))))..((((((..(.((((((((((((((.((((.((..(((...((((((..((.((...........)).))..))))))((((..(((((...(((...(((((((((((.....((((......))))(((((((((.(((((...(((((((..((((((((((((.(((((((((..((((((((....(((.((.....)).)))....))))))))..)))))..((((((((....).))))))).......))))...))))))))))))(((...)))......)))))))..)))))..)))))))))(((((.(.....((((....))))....).)))))........)))))))))))..))))))))))))(((......))))))..)))))).)))))..))))))))).).....(((((((......)))))))....)))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((.(.(.((....)).).).))))).,((((((..(.((((((((((((((.((({,((..(((...{(((((..{{.((.{,......}.}).}}..)))))}((((..(((((...(((...(((((((((((..{{,((((......}},,{((((((((.,((((.{{(((,,.({((..(((((((((.{((((((((..((((((((....(((.((.....)).)))....))))))))..))))).{((((((({....}.)))))),,}.....}}))...))))))))))))|}}}}.)))|.....||||||}..))))),.))))))))}|||||,|.....((((....))))....}.})))}.....,,.)))))))))))..))))))))))))(((......))))))..)))))).))))),,))))))))).).....(((((((......)))))))....)))))),