Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GIGYF2_0008800
Sequence Length
2329 nt
GC Content
0.4835
GCUCCGAGCUCUGUCCAGUGGUGGGAGUAUUACAUCCCCUCCUCUUUCUCCAGCAUUGCCGAAGUAUAAAUUAGCAGAUUAUCGUUACGGCAGAGAAGAAAUGUUAGCACUUUUCCUUAAAGACAACAAGAUACCUUCAGACCUUCUGGAUAAAGAAUUUCUGCCUAUCCUCCAGGAGGAACCCCUUCCACCAUUGGCUCUGGUACCCUUUACAGAAGAAGAACAGAGAAACUUUUCCAUGUCUGUAAAUAGUGCUGCUGUCCUGCGAUUGACAGGACGAGGAGGAGGAGGAACAGUGGUGGGGGCUCCUAGAGGUCGAAGUUCUUCAAGAGGGCGAGGCAGAGGCAGAGGUGAAUGUGGUUUCUACCAAAGAAGUUUUGAUGAAGUAGAGGGUGUUUUUGGUCGAGGAGGUGGCAGAGAAAUGCAUAGAUCGCAGAGCUGGGAGGAAAGGGGUGACAGACGUUUUGAAAAACCAGGACGAAAAGAUGUAGGGAGACCAAAUUUUGAGGAAGGUGGACCAACAUCAGUAGGGAGAAAGCAUGAAUUUAUACGCUCAGAAAGUGAAAAUUGGCGCAUCUUUAGAGAGGAACAAAAUGGAGAAGAUGAAGAUGGAGGUUGGCGACUAGCUGGAUCAAGGAGGGAUGGAGAGAGGUGGCGACCUCACAGUCCUGAUGGCCCUCGUUCUGCAGGCUGGCGGGAACACAUGGAACGACGUCGGAGGUUUGAGUUUGAUUUUCGAGAUAGAGAUGAUGAACGGGGUUACCGAAGGGUUCGCUCUGGCAGUGGGAGCAUAGAUGAUGACAGGGAUAGCUUGCCCGAAUGGUGCUUAGAGGAUGCUGAAGAAGAAAUGGGUACAUUUGACUCAUCUGGAGCAUUCCUUUCUCUAAAAAAAGUACAGAAAGAGCCUAUUCCAGAAGAGCAGGAGAUGGACUUCCGGCCUGUGGACGAAGGGGAGGAGUGCUCUGACUCUGAGGGUAGCCAUAAUGAAGAGGCCAAAGAACCCGAUAAGACAAAUAAGAAAGAAGGAGAGAAAACAGAUAGAGUAGGAGUUGAAGCUAGUGAGGAAACUCCCCAGACCUCAUCAUCAUCUGCUAGACCAGGUACUCCUUCAGACCAUCAGUCUCAGGAAGCAUCACAGUUUGAGAGGAAAGAUGAACCAAAAACUGAGCAAACGGAAAAAGCUGAAGAGGAGACUCGGAUGGAAAAUAGUCUACCAGCCAAAGUGCCCAGCAGAGGGGAUGAAAUGGUUGCUGAUGUCCAGCAGCCCCUGUCGCAGAUUCCUUCAGAUACAGCCUCUCCUCUUCUCAUACUUCCACCUCCUGUUCCCAAUCCUAGUCCUACUCUCCGGCCAGUUGAAACACCAGUUGUAGGUGCUCCUGGUAUGGGCAGUGUUUCCACAGAACCUGAUGAUGAAGAAGGUCUCAAACAUUUGGAGCAGCAAGCUGAGAAAAUGGUGGCUUAUCUCCAAGACAGUGCACUAGAUGAUGAAAGAUUGGCAUCAAAACUGCAAGAGCACAGAGCUAAAGGAGUGUCGAUUCCAUUGAUGCAUGAAGCAAUGCAGAAGUGGUAUUACAAAGAUCCUCAGGGAGAAAUUCAAGGUCCCUUCAAUAAUCAGGAGAUGGCAGAAUGGUUUCAGGCGGGCUAUUUUACUAUGUCUUUAUUGGUGAAGAGAGCGUGUGAUGAAAGCUUCCAACCUCUUGGCGAUAUCAUGAAAAUGUGGGGAAGGGUUCCCUUUUCUCCAGGUCCAGCUCCCCCUCCUCAUAUGGGAGAGCUGGACCAGGAACGACUGACCAGGCAGCAAGAACUCACAGCCUUAUACCAGAUGCAGCACCUGCAGUACCAGCAGUUUUUAAUACAACAACAAUAUGCACAGGUUUUGGCCCAACAGCAGAAAGCAGCACUGUCUUCCCAGCAGCAGCAGCAGUUGGCACUUCUUCUUCAACAGUUUCAGACCUUGAAGAUGAGAAUAUCUGAUCAGAACAUCAUUCCCUCAGUAACUAGGUCUGUGUCCGUGCCAGAUACUGGCUCUAUCUGGGAGCUUCAGCCAACAGCUUCACAGCCUACAGUUUGGGAAGGUGGUAGUGUAUGGGAUCUUCCUCUGGACACCACGACACCAGGCCCUGCCCUGGAACAGCUUCAGCAGCUAGAGAAGGCCAAAGCUGCAAAGCUAGAGCAAGAGAGAAGAGAGGCAGAAAUGAGGGCAAAACGGGAAGAGGAAGAGCGAAAGAGGCAGGAAGAACUCCGAAGACAACAGGAGGAAAUUCUUCGGCGACAGCAGGAAGAAGAAAGGAAAAGGCGAGAGGAAGAAGAACUUGCCCGAAGGAAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-707.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -750.10
Frequency: 0.0000
Diversity: 634.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...))).((((((...(((((((((((..((((((.(((((.....(((((.((((.((..(((...((((((..((.((...........)).))..))))))((((..(((((...(((...(((((((((((.....((((......))))(((((((((.(((((...(((((((..((((((((((((.(((((((((..((((((((....(((.((.....)).)))....))))))))..)))))..((((((((....).))))))).......))))...))))))))))))(((...)))......)))))))..)))))..)))))))))(((((.(.....((((....))))....).)))))........)))))))))))..))))))))))))(((......))))))..)))))).))))))))))..)))))).....(((((((......)))))))....(((((.((...(((.............)))...)).))))).....(((((..((.(.(((((...((((.....)))).))))).).)).))))).(((((((.......(((((.(.((.(..((((((...(((((..((.((((....(((((..(((..(((((....)))))....)))......))))))))).)).((((((.((((..((.(((.......(((((((((.......)))))))))..((((((((((((..(((((((((....)))..(((((.......)))))...........((((.....))))..((((((.((((((.......((.....))...))))))))))))(((((((((...(.(((((((.(((..........((((.(((((((.((((......(((((...(((....))).))))).........)))).)).)))))...)))).((((.(((..........)))......)))).............)))..))))))).)....))))).)))).((((((....(....)....))))))...)))))).))))))))).)))..))).))..)))).....(((((((((((....(((......(((((...((................))...))))).......)))......))))))..)))))...........))))))...((.(((......))).)).....((((((((.....))))))))...))))).....))))))..).)).).)))))))))))))))))))))))(((((((.....((((..((((.((.((((((((((.....((((.......))))...(((((((((((((((....))).(((.(((.(((.((((((((((...(((...((..((.((..((((.(((.((((((((((.((((((((((.(((((...((((..((....))..))))((((((((...(((.....)))...((...((((.((((.....(((((......)))))...((((((((.(.((((......(((((....(((.(.((.(((((.((((.((((.((((.((((((((((.....)))))))))).)))).)))).)))).))))).)).)...)))......)))))....)))).).)))))))).......((((((((((....))))))))))((((((((((.(((.........))).)))))))))).))))))))...))((((..............)))).........(((((...)))))......))))))))................)))))..))))))).........)))))))..)))))).))).)))).)).))..)))))))).))))))).))).))).)))((((((......((((......((((......))))....))))......)))))).))))))))))))..)))))).....(((((((((.........)))))).)))......((((((....(((((.((.((.((((...)))).)).)))))))....))))))..((((((.(....(((((.((((((............))))))...((....))...........))))).....).))))))...)))).))))))..)).))....)))))))....((((..........))))....((((((.((....))..))))))..........((((((...........))))))....)))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...))).((((((..(((.(.((((,{{.((((((((((((((((((((((.(((((((..{((,,.{({{{{..||.{{.||.,,,,,,.,,.....|||||.({(({{(((((...({(...{((((((((((..,,,{(((,.....,,,,{((((((((.,((((.,,((({{,(({{,,{((((((((.((((({({(..((((((((....(((.{(.....)).)))....)))))))}..))}||.{((((((({....}.)))))),,}.,,..,,))...)))))))))))}|||},.}})|,,...|||)))}..))))),.}))))))),|||||}|,....{({{.,,.}))}.,..}.||||}.....,,.))))))))))),,)))}})))))}){({......)}),}}..)))))}.)))}}}})))))))).},,,,..(((((((......)))))))....(((((.((...(((...,,.....,..)))...)).))))).||,,|||,,,,|,.....|||.,,|((((((....,.....{(((..(((((((...,{{((.,....(((((.{(((((.((({{(((((((.{(((((((...((,....{(({(.,...(((((....))))).}.})))}..}..((((((((({(((((((((.(({,,(.,.({((((..({(((,.,((((..,{((||.,,}},)},,..}))}..}},,)),.})).)))....||||,|(((((.(((((({{({{...,...,.{{((,....}}}}}},.....|}|||,,{{(((((((..(((.{{,{(({{{.|,,,..}}))})))..)))))))||||{{,{......,,},,,}},}),,)))))))))}}.}}}}......}}..)),))))))))))))))},))).,,,,.,(((((.{(((({.((((.(((.,........)))......)))).....................,.........}...}))))}.})))}|,,)))))))(((....)))}))}}}))))))).)))))).))...))),,,.,))))),...{,,,|.|{(((|,,.,{{......})))},},,.)))))))..)))}...))))))...|,,.....||||..{{{,,,,))}((.(((,......}))})),,}}....|||,},)).))))))))).,,,((((((((.....))))))))(((.((((...(((((({.......,((({{(((((({{{.,.(((((.{.((((((((((,.,.{{.(((((.(((((.{((((((.....((((.......))))...(((((((((((((((....))).{((.(((.(((.((((((({{{...,.,..{((..((.((..((((.(({.((((((((((.((((((((((.(((({...{,((,{(.....,}..)))){(((((((...(((.....)))..,(((.,((,({(.(((((..(((((......)))))..))))).|}},}...,,}}}}.,(((({....,,,.,.||}||(({.{{{{.((((.((((.((((((((((,....}))))))))).)))).)))}.)))),))))).|}|}.||}||,,....)}})}..,|}}}}}}...,,,||{....,}}{(((((((({...})))))))))}((((((((((.(((.........))).)))))))))).|},.,..||,.,,((((.,............)))).....,,,.(((((...)))))......)))))))}................)))))..))))))).........)))))))..)))))).))).)))).)).))..)))))))}.))))))).))).))),)}(((((((......((((......((((......))))....))))......)))))))))))))))))))..})))))},...(((((((((.........}))))).))){{{,..,,,|||,...(((((.((.((.((((...)))).)).)))))))....|||||}...|,}}}))...(((((..((((((........,...)))))).))))).,.}}..)))))..,)).)))})...},.)))...})))))),).))))),).))}))))),}}}.....((((..........))))....((((((.((....))..))))))},))))))...)))).))).......)))).))))..))}.,)))
Back