Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GIGYF2_0010800
Sequence Length
1999 nt
GC Content
0.4787
AUACCUUCAGACCUUCUGGAUAAAGAAUUUCUGCCUAUCCUCCAGGAGGAACCCCUUCCACCAUUGGCUCUGGUACCCUUUACAGAAGAAGAACAGAGAAACUUUUCCAUGUCUGUAAAUAGUGCUGCUGUCCUGCGAUUGACAGGACGAGGAGGAGGAGGAACAGUGGUGGGGGCUCCUAGAGGUCGAAGUUCUUCAAGAGGGCGAGGCAGAGGCAGAGGUGAAUGUGGUUUCUACCAAAGAAGUUUUGAUGAAGUAGAGGGUGUUUUUGGUCGAGGAGGUGGCAGAGAAAUGCAUAGAUCGCAGAGCUGGGAGGAAAGGGGUGACAGACGUUUUGAAAAACCAGGACGAAAAGAUGUAGGAAAGAAGAAUGGAUAUUAUUGCAUGUACUCACCAGUUCUUUUGCUGGGUCAGCCUUUAUGCCAAGGGAGACCAAAUUUUGAGGAAGGUGGACCAACAUCAGUAGGGAGAAAGCAUGAAUUUAUACGCUCAGAAAGUGAAAAUUGGCGCAUCUUUAGAGAGGAACAAAAUGGAGAAGAUGAAGAUGGAGGUUGGCGACUAGCUGGAUCAAGGAGGGAUGGAGAGAGGUGGCGACCUCACAGUCCUGAUGGCCCUCGUUCUGCAGGCUGGCGGGAACACAUGGAACGACGUCGGAGGUUUGAGUUUGAUUUUCGAGAUAGAGAUGAUGAACGGGGUUACCGAAGGGUUCGCUCUGGCAGUGGGAGCAUAGAUGAUGACAGGGAUAGCUUGCCCGAAUGGUGCUUAGAGGAUGCUGAAGAAGAAAUGGGUACAUUUGACUCAUCUGGAGCAUUCCUUUCUCUAAAAAAAGUACAGAAAGAGCCUAUUCCAGAAGAGCAGGAGAUGGACUUCCGGCCUGUGGACGAAGGGGAGGAGUGCUCUGACUCUGAGGGUAGCCAUAAUGAAGAGGCCAAAGAACCCGAUAAGACAAAUAAGAAAGAAGGAGAGAAAACAGAUAGAGUAGGAGUUGCUAGUGAGGAAACUCCCCAGACCUCAUCAUCAUCUGCUAGACCAGGUACUCCUUCAGACCAUCAGUCUCAGGAAGCAUCACAGUUUGAGAGGAAAGAUGAACCAAAAACUGAGCAAACGGAAAAAGCUGAAGAGGAGACUCGGAUGGAAAAUAGUCUACCAGCCAAAGUGCCCAGCAGAGGGGAUGAAAUGGUUGCUGAUGUCCAGCAGCCCCUGUCGCAGAUUCCUUCAGAUACAGCCUCUCCUCUUCUCAUACUUCCACCUCCUGUUCCCAAUCCUAGUCCUACUCUCCGGCCAGUUGAAACACCAGUUGUAGGUGCUCCUGGUAUGGGCAGUGUUUCCACAGAACCUGAUGAUGAAGAAGGUCUCAAACAUUUGGAGCAGCAAGCUGAGAAAAUGGUGGCUUAUCUCCAAGACAGUGCACUAGAUGAUGAAAGAUUGGCAUCAAAACUGCAAGAGCACAGAGCUAAAGGAGUGUCGAUUCCAUUGAUGCAUGAAGCAAUGCAGAAGUGGUAUUACAAAGAUCCUCAGGGAGAAAUUCAAGGUCCCUUCAAUAAUCAGGAGAUGGCAGAAUGGUUUCAGGCGGGCUAUUUUACUAUGUCUUUAUUGGUGAAGAGAGCGUGUGAUGAAAGCUUCCAACCUCUUGGCGAUAUCAUGAAAAUGUGGGGAAGGGUUCCCUUUUCUCCAGGUCCAGCUCCCCCUCCUCAUAUGGGAGAGCUGGACCAGGAACGACUGACCAGGCAGCAAGAACUCACAGCCUUAUACCAGAUGCAGCACCUGCAGUACCAGCAGUUUUUAAUACAACAACAAUAUGCACAGGUUUUGGCCCAACAGCAGAAAGCAGCACUGUCUUCCCAGCAGCAGCAGCAGUUGGCACUUCUUCUUCAACAGUUUCAGACCUUGAAGAUGAGAAUAUCUGAUCAGAACAUCAUUCCCUCAGUAACUAGGUCUGUGUCCGUGCCAGAUACUGGCUCUAUCUGGGAGCUUCAGCCAACAGCUUCACAGCCUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-602.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -642.61
Frequency: 0.0000
Diversity: 632.94
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....((((((((((......)))..((((((((.(((((...(((((((..((((((((((((.(((((((((..((((((((....(((.((.....)).)))....))))))))..)))))..((((((((....).))))))).......))))...))))))))))))(((...)))......)))))))..)))))..))))))))((.((((.(((((((((....)))).....((((((((.(.(((....((.(((..(((((((((((((.(((.....(((.......((...((((((((((.((.(((((....(((((((......)))))))...(.((((((...................)))))).)..)))))((((((((((((.(((((((((....((((((((...((.........))..((((......)))).((.(((((....((.....((((((((((..........(((((((((.(((((((............((((((..........(((((.(((.((((((.(((....((((((..(((((.(((((....)))))....(((((..((((..(.....)..))))..)))))...............(((((((((.......)))))))))....((((.((.((..((((((...((((((.(((((((.......))))).....((.((((((((.((((((..(((.....(((((((.(((((((..(((.((((((....))))....)).)))..)))))))((((((.((.......)).))))))..(((..((((..((.((.((((......)))).)))).))))...)))((((((((((.(((..(((...(((((..((.((((.((((.........((.....................))...................((((((.((.....)).)))))).....)))).)))).)))))))))).)))))))))))))....((((..(((....((((......))))....)))..)))).........)))))))..)))...))))))..(((....)))((.((((......)))))).((((..((.(((......))).))....))))(((((.....)))))..)))))))))))).))))))......)))))))).)).))))....)))))))))))....)))...))))))))).)))))(((((.(........(((((...(.((((((..((.(((((..(.(((.(((((...))).))..))).)..))).)).))....)))))).).))))).......).)))))..)))))).....((((.((((.(((((.........)))))...))...)).))))....))))))).)))))))))(((((..(((((......)))))..))))).........((.(((...(((....))).))))).(((((.((((.((((.((((.((((((((((.....)))))))))).)))).)))).)))).))))).))))))))))))....))))).)))))))))).....(((....)))((((((((((....))))))))))((((((((((.(((.........))).))))))))))))).....)))))).))))).)))))))....(((....(((.(.((((....((((.......))))....................))))).)))...)))......((........)).)).)))))))))).)).)))....))).))))))))).............))))..))).)).....))).).))))))))..))))))))).))....))))))).....(.(((((...))))).))))(((((.(((..(((.....)))....))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,,((({{(,,{{||,,....}},,{((((((({.,((((.,,((({{,(({{,,{((((((((.((((({({(..((((((((....(((.{(.....)).)))....)))))))}..))}||.{((((((({....}.)))))),,}.,,..,,))...)))))))))))}|||},.}))},,...|}})))}..))))),.})})))))||||{||||,,,|{{{{,,,,||||,,,,,.{||||.....,},)))}}}})||}||||,({((||{((|(||||...,(({(,({{{,,,,.((((((,((({((((,((({...(((((((......)))))))...,.{(((({...,,.....,,.....,.})}))).}..,,.||((({{{{{,|||}|||||,||||,..,,((((({.|,|,.....{{{{{{{{((,(..{{{{|,||.,{,((((,...((.{.,{{((,{{((((,....,}}}.}||||,|{||.||||||..,..........{((,(({{{|,.....(((((.(((.((((((.(((,.,.((((((,.{{({,.(((((....)))))...,}}((((((((((((({{({(((((((((.(({,,(.,.{{((((..({(((,,,((((..,{((||.,,}},)},,..})}}..}},,)},.})}.)))....||||,|(((((.(((((({{({{...,...,.{{((,....}}}}}}}.....|||||,,{{(((((((..(((.{{,{(({{{.|,,,..}}))})))..)))))))||||{{,{......,,},.}}},}).,)))))))))}}.}}}}......}}..)),))))))))))))))},))|(((((((((.(((..(((..{(((,({{.,.,,,,.{,||}......,}||.....................|,,,........,,,.,,,,.((((((.({....,|}.,}))))...,.)))),))}},,})))))}},.))))))))))))}...))))))){(((({,..{{......|})))))}((,,..{{{,..,.....,}}{((...........)))((((((((((,,.((.((({......}})}))}.,,...,{{(,,.,},{{|||{|{{,...((((((((.....)))))))).,,{|,.,.,|}}))))).,.....}..))))))))))}}}}..)))).)))))),.,,)))...))))))))).)))))(((((||,.......||{{(((((((((((((((((((((({((,,((((.,{(,,(((..{,....}..}}))}}},.,|{{{{||||,,.,..||||,{,...{|{,||||{.|||||}.,...,(((,,,,{.(((((......,..)))))...,)}}...,||,,...}))..|||{,|||,{{|.(((((..(((((......)))))..))))).}}},,.....}||}...||||,..,|{,.{.{{.(((((.((((.((((.((((.((((((((((.....)))))))))).)))).)))).)))).))))).)),),)}})),..,,}))})),..,))))))).....|,,..,,}))|(((((((((...,))))))))),((((((((((.(((.........))).)))))))))).)))}..,))).)),|||}}..,,,,,,..,.)))}}}))))))..}.))))))))))}.{{{.(((.,{,,,...........,,..)))...))).}})))).....{{.....,}.}}.}}}))))))))||.|{.,,.}}.))))},,),)))))}}}}}.,}}}}}...)}))),,(((.{{{...))).))),,,,,.,},}))))))}))..,,,))))))))),.{,{((((...)))}}.|}}}{{{||,{{{,.,||,....}))}}..})))..}))
Back