Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GIGYF2_0014100
Sequence Length
2300 nt
GC Content
0.4948
GAAAGAAGAAUGGAUAUUAUUGCAUGUACUCACCAGUUCUUUUGCUGGGUCAGCCUUUAUGCCAAGGGAGACCAAAUUUUGAGGAAGGUGGACCAACAUCAGUAGGGAGAAAGCAUGAAUUUAUACGCUCAGAAAGUGAAAAUUGGCGCAUCUUUAGAGAGGAACAAAAUGGAGAAGAUGAAGAUGGAGGUUGGCGACUAGCUGGAUCAAGGAGGGAUGGAGAGAGGUGGCGACCUCACAGUCCUGAUGGCCCUCGUUCUGCAGGCUGGCGGGAACACAUGGAACGACGUCGGAGGUUUGAGUUUGAUUUUCGAGAUAGAGAUGAUGAACGGGGUUACCGAAGGGUUCGCUCUGGCAGUGGGAGCAUAGAUGAUGACAGGGAUAGCUUGCCCGAAUGGUGCUUAGAGGAUGCUGAAGAAGAAAUGGGUACAUUUGACUCAUCUGGAGCAUUCCUUUCUCUAAAAAAAGUACAGAAAGAGCCUAUUCCAGAAGAGCAGGAGAUGGACUUCCGGCCUGUGGACGAAGGGGAGGAGUGCUCUGACUCUGAGGGUAGCCAUAAUGAAGAGGCCAAAGAACCCGAUAAGACAAAUAAGAAAGAAGGAGAGAAAACAGAUAGAGUAGGAGUUGAAGCUAGUGAGGAAACUCCCCAGACCUCAUCAUCAUCUGCUAGACCAGGUACUCCUUCAGACCAUCAGUCUCAGGAAGCAUCACAGUUUGAGAGGAAAGAUGAACCAAAAACUGAGCAAACGGAAAAAGCUGAAGAGGAGACUCGGAUGGAAAAUAGUCUACCAGCCAAAGUGCCCAGCAGAGGGGAUGAAAUGGUUGCUGAUGUCCAGCAGCCCCUGUCGCAGAUUCCUUCAGAUACAGCCUCUCCUCUUCUCAUACUUCCACCUCCUGUUCCCAAUCCUAGUCCUACUCUCCGGCCAGUUGAAACACCAGUUGUAGGUGCUCCUGGUAUGGGCAGUGUUUCCACAGAACCUGAUGAUGAAGAAGGUCUCAAACAUUUGGAGCAGCAAGCUGAGAAAAUGGUGGCUUAUCUCCAAGACAGUGCACUAGAUGAUGAAAGAUUGGCAUCAAAACUGCAAGAGCACAGAGCUAAAGGAGUGUCGAUUCCAUUGAUGCAUGAAGCAAUGCAGAAGUGGUAUUACAAAGAUCCUCAGGGAGAAAUUCAAGGUCCCUUCAAUAAUCAGGAGAUGGCAGAAUGGUUUCAGGCGGGCUAUUUUACUAUGUCUUUAUUGGUGAAGAGAGCGUGUGAUGAAAGCUUCCAACCUCUUGGCGAUAUCAUGAAAAUGUGGGGAAGGGUUCCCUUUUCUCCAGGUCCAGCUCCCCCUCCUCAUAUGGGAGAGCUGGACCAGGAACGACUGACCAGGCAGCAAGAACUCACAGCCUUAUACCAGAUGCAGCACCUGCAGUACCAGCAGUUUUUAAUACAACAACAAUAUGCACAGGUUUUGGCCCAACAGCAGAAAGCAGCACUGUCUUCCCAGCAGCAGCAGCAGUUGGCACUUCUUCUUCAACAGUUUCAGACCUUGAAGAUGAGAAUAUCUGAUCAGAACAUCAUUCCCUCAGUAACUAGGUCUGUGUCCGUGCCAGAUACUGGCUCUAUCUGGGAGCUUCAGCCAACAGCUUCACAGCCUACAGUUUGGGAAGGUGGUAGUGUAUGGGAUCUUCCUCUGGACACCACGACACCAGGCCCUGCCCUGGAACAGCUUCAGCAGCUAGAGAAGGCCAAAGCUGCAAAGCUAGAGCAAGAGAGAAGAGAGGCAGAAAUGAGGGCAAAACGGGAAGAGGAAGAGCGAAAGAGGCAGGAAGAACUCCGAAGACAACAGGAGGAAAUUCUUCGGCGACAGCAGGAAGAAGAAAGGAAAAGGCGAGAGGAAGAAGAACUUGCCCGAAGGAAACAGGAAGAGGCUCUGCGUCGCCAGCGGGAGCAAGAAAUUGCAUUAAGGCGACAGCGAGAAGAGGAAGAAAGACAGCAGCAAGAAGAAGCUCUUAGAAGACUGGAAGAGAGGAGAAGAGAAGAGGAAGAAAGGCGGAAGCAGGAAGAAUUGUUACGCAAACAGGAAGAGGAGGCUGCAAAAUGGGCCCGGGAAGAAGAAGAAGCCCAGCGUCGAUUAGAGGAGAACCGGCUGCGGAUGGAAGAGGAGGCAGCCAGACUCCGGCAUGAGGAAGAAGAACGGAAGAGAAAGGAGCUGGAGGUCCAGCGGCAGAAGGAGUUAAUGCGCCAGAGGCAGCAGCAGCAAGAGGCUCUCCGGAGGUUGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAGCUGGCGCAGAUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-682.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -728.10
Frequency: 0.0000
Diversity: 584.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((...(((.(......).)))....)).....))((((..(((.((((((((((.((((..((....))..........(((((((..((((..(((.(...(((..................)))....).)))...))))..))))))).((((((.......(((((((..((..(((((.((((((.(((((.(((.(..((.(((((..(((..(((((....)))))....)))......))))).)).).))).((((.((((..((.(((.......(((((((((.......)))))))))..((((((((((((..(((((((((....)))..(((((.......)))))...........((((.....))))..((((((.((((((.......((.....))...))))))))))))(((((((((...(.(((((((.(((..........((((.(((((((.((((......(((((...(((....))).))))).........)))).)).)))))...)))).((((.(((..........)))......)))).............)))..))))))).)....))))).)))).((((((....(....)....))))))...)))))).))))))))).)))..))).))..)))))))).(((((((((((....(((......(((((...((................))...))))).......)))......))))))..)))))....)))))..))))))...((.(((......))).)).....((((((((.....)))))))).))))).))..)).))))).......))))))(((((((....(((((.((((((.((((..(((((((((....(((((..(.((((((........((((((((((((((((((((((((((..((((...((((((..(.....)..)))).))..((((((..........(((((((...(((.(((((.(((((.......((((.....(((((.........)))))....))))..(((.....)))..((((.(((.(((.(((((..(((((......)))))..))))).))))))....))))...)))))...(((.(.((.(((((.((((.((((.((((.((((((((((.....)))))))))).)))).)))).)))).))))).)).)...)))...))))).)))...)))))))..........))))))(((((((((....))))))))).((((((((((.(((.........))).)))))))))).))))..)))).))((((..............))))))))))))..).))))))))))).(((.(((.....................)))...)))...((((((..........(((((..(.((((((((((.((....)).))))...((((((((((.((.(...(((((((......((((......((((......))))....))))......)))))))...).))(((((...)))))(((.((((((((((((.(((.....((((.(.((((...((((((....(((((.((.((.((((...)))).)).)))))))....))))))((((((((.(....(((((.((((((............))))))...((....))...........))))).....).))))))....))..................)))).)))))..((((..........))))....((((((.((....))..))))))..........((((((...........)))))).................)))(((((((((((....((.((((....)))).))..)))))).)).))).........................)))))))))))))))((.......)).......))))))))))....(((..(((((......))))).))).....)))))).)..)))))....)))))).(((............)))....)))))).).)))))...))))).)))))))).))))))(((((.......))).)).)))))......)))))))......(((((....))))))))).)))).(((..((((((...))).)))..)))......(((....)))(((((.((....)).))))).......)))))).)))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,...,....{((.{......}.||}..,|||.|({.{{(((((((((((((.,((((,.....}}||..,.}}...,,||,.{|..(((({{{,.,{{{{,{{,.,{{,,..{{.{.,,{{{.,.{((({{,...}},.,,,||{|.,|{|||||...{{{((......(((((.((((((.((({{(((((((.{(((((((...(({....(((((.....(((((....))))).}.})))}..}..((((((((({(((((((((.(({,,(.,.({((((..({(((,.,((((..,{((||.,,}},)},,..}))}..)},,)),.})).)))....||||,|(((((.(((((({{({{...,...,.{{((,....}}}}}},.....|}|||,,{{(((((((..(((.{{,{(({{{.|,,,..}}))})))..)))))))||||{{,{......,,},,,}},}),,)))))))))}}.}}}}......}}..)),))))))))))))))},)))..,...,(((((.{(((({.((((.(((.,........)))......)))).....................,.........}...}))))).))))),,,)))))))(((....)))}))}}}))))))).)))))).))...)))..,..))))),...{{{{{,|((((,,..{{{......|||||.,,,,,}}}}}}..})},...))}}})..,|,{.....})),..{{{,,,,))},|}|}|......})))))).,|||..|{.|||,,,,,,))),})....,||||||||,,,,.))||}|||.(((,((({{{{{(((((,,......(((,(.(((((((..,.(((((.((((((.((((..(((((((((,...((((({{({(({{{,..,....,{(((((((((({((((((((((((((,.((((..,(,{(((..(.....}..))))}},..,{{(((,.,,......(((({({...{((.(({{(.{({((,,{...,((({.,.,.(((((......,..)))))...,))},..{((.....)))..{(((.{((.(((.(((((..(((((......)))))..))))).}))}},....)))),.,||||,...{({.(.((.(((((.((((.((((.((((.((((((((((.....)))))))))).)))).)))).)))).))))).)).).},,}},..}}})).))}...))))))).....,,,..,,)))|(((((((((...,))))))))),((((((((((.(((.........))).)))))))))).))))..)))).)){(((.,..........,.))))})))))))..}.))))))))))}.(((.(((..{,.............,}..)))...))).,}||||,...........(((((.,(.((((((((((.((....)).))))...((((((((((..{.,.,,(((((((.,....((((......((({......})))....))))....,.)))))))...,.|.(((((...))))),{{.((((((((((((.,((....,((((.{.((((...{(((((....(((((.((.((.((({...}))).)).)))))))....)))))|((((((((.,....(((((.((((((........,...))))))...((....))...........))))).,...}.))))))....})}..........,|....,}))).,}},,..((((..........))))....((((((.((....))..))))))..........((((((...........)))))).................}}}|{{((((((((....{(.((((....)))).))..)))))).)),,}.................,........)))))))))))))))|}},....},)},,,,,.))))))))))....(((..(((((......))))).))).....)))))).}.,)))))..,,|}||||.(((............))).}.})),)))...)))))...))))).)))))))).)))))){{(((.......))).}}.)))))......))))))),.})).{||||,,,.))}))}}),)}}}))))}..}))|,|}}.))).||.{|}||,.,,|,{{{.,..}}}{||{|.||.,|.||.}|||}.......))))},))},..,..,
Back