Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GIGYF2_0015000
Sequence Length
1107 nt
GC Content
0.4770
GGAGACCAAAUUUUGAGGAAGGUGGACCAACAUCAGUAGGGAGAAAGCAUGAAUUUAUACGCUCAGAAAGUGAAAAUUGGCGCAUCUUUAGAGAGGAACAAAAUGGAGAAGAUGAAGAUGGAGGUUGGCGACUAGCUGGAUCAAGGAGGGAUGGAGAGAGGUGGCGACCUCACAGUCCUGAUGGCCCUCGUUCUGCAGGCUGGCGGGAACACAUGGAACGACGUCGGAGGUUUGAGUUUGAUUUUCGAGAUAGAGAUGAUGAACGGGGUUACCGAAGGGUUCGCUCUGGCAGUGGGAGCAUAGAUGAUGACAGGGAUAGCUUGCCCGAAUGGUGCUUAGAGGAUGCUGAAGAAGAAAUGGGUACAUUUGACUCAUCUGGAGCAUUCCUUUCUCUAAAAAAAGUACAGAAAGAGCCUAUUCCAGAAGAGCAGGAGAUGGACUUCCGGCCUGUGGACGAAGGGGAGGAGUGCUCUGACUCUGAGGGUAGCCAUAAUGAAGAGGCCAAAGAACCCGAUAAGACAAAUAAGAAAGAAGGAGAGAAAACAGAUAGAGUAGGAGUUGAAGCUAGUGAGGAAACUCCCCAGACCUCAUCAUCAUCUGCUAGACCAGGUACUCCUUCAGACCAUCAGUCUCAGGAAGCAUCACAGUUUGAGAGGAAAGAUGAACCAAAAACUGAGCAAACGGAAAAAGCUGAAGAGGAGACUCGGAUGGAAAAUAGUCUACCAGCCAAAGUGCCCAGCAGAGGGGAUGAAAUGGUUGCUGAUGUCCAGCAGCCCCUGUCGCAGAUUCCUUCAGAUACAGCCUCUCCUCUUCUCAUACUUCCACCUCCUGUUCCCAAUCCUAGUCCUACUCUCCGGCCAGUUGAAACACCAGUUGUAGGUGCUCCUGGUAUGGGCAGUGUUUCCACAGAACCUGAUGAUGAAGAAGGUCUCAAACAUUUGGAGCAGCAAGCUGAGAAAAUGGUGGCUUAUCUCCAAGACAGUGCACUAGAUGAUGAAAGAUUGGCAUCAAAACUGCAAGAGCACAGAGCUAAAGGAGUGUCGAUUCCAUUGAUGCAUGAAGCAAUGCAGAAGUGGUAUUACAAAGAUCCUCAGGGAGAAAUUCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-301.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -326.82
Frequency: 0.0000
Diversity: 292.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(....)(.(((((((((((.((((......)))).........................((((.....))))..(((((((((.(((((((............((((((..........(((((.(((.((((((.(((....((((((..(((((.(((((....)))))....(((((..((((..(.....)..))))..)))))...............(((((((((.......)))))))))....((((.((.((..((((((...((((((.(((((((.......))))).....((.((((((((.((((((..(((.....(((((((.(((((((..(((.((((((....))))....)).)))..)))))))((((((.((.......)).))))))..(((..((((..((.((.((((......)))).)))).))))...)))((((((((((.(((..(((...(((((..((.((((.((((.........((.....................))...................((((((....(....)....)))))).....)))).)))).)))))))))).)))))))))))))....((((..(((....((((......))))....)))..)))).........)))))))..)))...))))))..(((....)))((.((((......)))))).((((..((.(((......))).))....))))(((((.....)))))..)))))))))))).))))))......)))))))).)).))))....)))))))))))....)))...))))))))).)))))(((((.(........(((((...(.((((((..((.(((((..(.(((.(((((...))).))..))).)..))).)).))....)))))).).))))).......).)))))..)))))).....((((.((((.(((((.........)))))...))...)).))))....))))))).)))))))))(((((..(((((......)))))..)))))...........)))))).....)))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(....}(...{((((((((.((((......)))).,,..{{{{{,{{{.....,,,...{{{(,....,}}}..(((((((,({((((({,............,,,,||,}}}}....,(((((.(((.((((((.(((,.,.((((((..{{{{,.(((((....)))))...,}}((((((((((((({{({(((((((((.(({,,(.,.{{((((..({(((,,,((((..,{((||.,,}},)},,..}))}..}},,)},.})).)))....||||,|(((((.(((((({{({{...,...,.{{((,....}}}}}}}.....|||||,,{{(((((((..(((.{{,{(({{{.|,,,..}}))})))..)))))))||||{{,{......,,},.}}},}).,)))))))))}}.}}}}......}}..)),))))))))))))))},))|(((((((((.(((..(((..{(((.({{.,..,,,.|,||}......}}}}.....,...............|,,,............,,,{,(((({(,,..,...,|{{,.}}}}}}...,.))))}))})},}))}))},,.))))))))))))}...))))))){(((({,..{{......|})))))}((,,..{{{,..,.....,}}{((...........)))((((((((((.,.((.((({......}})}))}.,,...,{{(,,.,},{{|||{{{{,...((((((((.....)))))))).,,{|,.,.,|})))))).,.....}..))))))))))}}}}..)))).)))))),.,,)))...))))))))).)))))|||||}|}....|,,(((({...(.((((((..((.(((({..{.((({{{{({...}}}.})..}}),...)))})).})....)))))).).}))))......,},)})))}.))))),..,,.,({(.,{,{.(((((......,..)))))...||}|...,||,,...,))},,),,})}}}|||,(((((..(((((......)))))..))))).,}}.,.....)))))))}|.....})}..)
Back