Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_GIGYF2_0018200

Sequence Length

624 nt

GC Content

0.4696

CUGAGAAAAUGGUGGCUUAUCUCCAAGACAGUGCACUAGAUGAUGAAAGAUUGGCAUCAAAACUGCAAGAGCACAGAGCUAAAGGAGUGUCGAUUCCAUUGAUGCAUGAAGCAAUGCAGAAGUGGUAUUACAAAGAUCCUCAGGGAGAAAUUCAAGGUCCCUUCAAUAAUCAGGAGAUGGCAGAAUGGUUUCAGGCGGGCUAUUUUACUAUGUCUUUAUUGGUGAAGAGAGCGUGUGAUGAAAGCUUCCAACCUCUUGGCGAUAUCAUGAAAAUGUGGGGAAGGGUUCCCUUUUCUCCAGGUCCAGCUCCCCCUCCUCAUAUGGGAGAGCUGGACCAGGAACGACUGACCAGGCAGCAAGAACUCACAGCCUUAUACCAGAUGCAGCACCUGCAGUACCAGCAGUUUUUAAUACAACAACAAUAUGCACAGGUUUUGGCCCAACAGCAGAAAGCAGCACUGUCUUCCCAGCAGCAGCAGCAGUUGGCACUUCUUCUUCAACAGUUUCAGACCUUGAAGAUGAGAAUAUCUGAUCAGAACAUCAUUCCCUCAGUAACUAGGUCUGUGUCCGUGCCAGAUACUGGCUCUAUCUGGGAGCUUCAGCCAACAGCUUCACAGCCUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-183.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -194.52

Frequency: 0.0000

Diversity: 186.56

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((..(((((((.((.(((...((((((((((....((((..((....))..))))((((((((...(((.....)))...((...((((.((((.....(((((......)))))...((((((((.(.((((......(((((....(((.(.((.(((((.((((.((((.((((.((((((((((.....)))))))))).)))).)))).)))).))))).)).)...)))......)))))....)))).).)))))))).......((((((((((....))))))))))((((((((((.(((.........))).)))))))))).))))))))...))((((..............)))).........(((((...)))))......))))))))......................(.((((.((......)).)))).).)))))))))).(((((.((....)).)))))...(((.(((((((..(((...))).))))))).))).......))).))..)))))))..)))))(...((((.(((((......(((((((.......)))))))(((((.........))))))))))))))..)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((..(((((((.((.({(...{(((((((((....,,(({{(......}..))))|{{{((((...{((.....}||..,(((.,((,({(.(((((..(((((......)))))..))))).}}},}...,.}})}.,(((({....,,,.{,||}|{(({.{({{.((((.((((.((((((((((,....}))))))))}.)))).)))}.)))),))))),|}|}.|||||,,....}}})}..,}}}}}}}...,.,||{....,}}{(((((((((...,))))))))),((((((((((.(((.........))).)))))))))).||},,..|{{.,,((((.,............)))).....,,,.(((((...)))))......)}}))))}................,},...||||||,||......)).,,,,,).)))))))))}.(((((.((....)).)))))...{{{.(((((({..{{{...})).))))))).}}|,......})).})..)))))))..)))))(...{(((.(((({...,.{((((...}}}}}.||.,}},)|||||..,},...,)}})}))))))))}..)