Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GIGYF2_0018500
Sequence Length
380 nt
GC Content
0.4763
GUGGGAUUACAGGCAUGAGCCAUUGCGCCGAGCCAAGAGAUCCCACCCCAUCUUUAAAAAGAAAAAAAAGAGACAAAUUCUUGCUAUGUUGACCAGGCUGGUUUUGAACUCCUGGCCGUAAGUGGUACUCCCUGUCUUUCCUCUGCCACCUUGGCCUCCCAAAGAGGGAUUAUAGGUGUGAGCCACUGCACCUGGCCAAAAAAUUUUAUUAAUUACAUUUUUAAAUAGUCAUAUAAGGGGCUGGGCGUGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCUCAGCACUUUGGGAGUCUGAGGCGGGAGGAUCACUUGAGUCCAAGAGUUCGAGACCAGCCUGGGCAACACAGUGAGACCCUGUCUCUACAAAUAAUAAAAAAGCCAGGCAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-175.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -178.82
Frequency: 0.0020
Diversity: 24.87
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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