Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GIGYF2_0018900
Sequence Length
468 nt
GC Content
0.4850
GUCCCUUCAAUAAUCAGGAGAUGGCAGAAUGGUUUCAGGCGGGCUAUUUUACUAUGUCUUUAUUGGUGAAGAGAGCGUGUGAUGAAAGCUUCCAACCUCUUGGCGAUAUCAUGAAAAUGUGGGGAAGGGUUCCCUUUUCUCCAGGUCCAGCUCCCCCUCCUCAUAUGGGAGAGCUGGACCAGGAACGACUGACCAGGCAGCAAGAACUCACAGCCUUAUACCAGAUGCAGCACCUGCAGUACCAGCAGUUUUUAAUACAACAACAAUAUGCACAGGUUUUGGCCCAACAGCAGAAAGCAGCACUGUCUUCCCAGCAGCAGCAGCAGUUGGCACUUCUUCUUCAACAGUUUCAGACCUUGAAGAUGAGAAUAUCUGAUCAGAACAUCAUUCCCUCAGUAACUAGGUCUGUGUCCGUGCCAGAUACUGGCUCUAUCUGGGAGCUUCAGCCAACAGCUUCACAGCCUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-131.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -140.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 113.87
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..(((((.((((.((((.((((.((((((((((.....)))))))))).)))).)))).)))).))))).((((.(((..((((.(((((((.((....))......(((....)))((((((((((....))))))))))((((((((((.(((.........))).))))))))))((((((..(((...((((..............)))).........(((((...)))))....)))..))))))................((.(((..(((((((..(((.((((.......((((.....(((((.((....)).)))))...(((.(((((((..(((...))).))))))).)))......((((......))))......)))).......)))))))..).))))))..)))))......)))))))))))....)))))))....))(....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,.(((((.((((.((((.((((.((((((((((.....)))))))))).)))).)))).)))).))))).||{(.((({.(({{((((((((.((....))......{{{....}}}((((((((((...,))))))))))((((((((((.(((.........))).)))))))))).(({{(..({(,,,((((.,............)))).....,,,.(((((...||||},...|,||,}}|}},...............,||.{{(,,{{{{({,..,{.||{{{..||.,,,|}},....(((((.((....)).)))))...{((.(((((((..({{...}}}.))))))).})}.....,(((,..,,..,,,,,,,.,}))}.....,))))})))),,|.|||||}..)))))......)))))))))))....,,,))}}...,)){.,,,}
Back