Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GIGYF2_0019600
Sequence Length
1152 nt
GC Content
0.4462
CUCCUCCCCAACAGGGAAACGGAAUCCUUCAGUAGCAUUCCAGCAGAUGUAGAAUGAAGACCAACAUCUUAUCCUGGCCUACCUACGAGGUCCUGCAAUGCCUGGCACCUUACCUUUCUAAGCUCAUUUCAGAGCUUUUACCUUUAUCUGCUAGGCUUCAACACAGUUGACCUCUUUGACUUUCUUUGCUUCCUCUAGUUAGAAUAAACAUUCCCCUCUCUUCCACUUCAUUUGCCUCUUGCCUUCUCAUUCAUAAAGUUUCUAAAUUUGAGGUUUGCCUUAAAAUAAAUGUUACCAGUGCUUCACAAUAUUUUUAGGGCUUAAAAAAAUUAGUUACUGGUAUUUUAAUUAAAAAAUGGAACCAUGGCCGGGCACAUUGGCUCACUUCUGUAAUCCUGGUGUGGGAGGGAUUUGGGAGGCCAGAGUUAGAGGAUUGCUUGAGCCCAGGAGUUUAAAAUCACCCUGGACAACGAAGUGAGACCUGUCUCUACAAAUAGUAAUGAAAUAAUAAUGAUAAAAAACUAGCCGGGUAUGGUGGCAAUCAGUGGCAGAGAUGGGAUGAUCACUUGAGCCUAGGAAGUUGAGGCUGCAGUGAGCUGUGAUUGCACCGCUGCACUGCAGCUUGGGCAACAGAGUGAGACCCUGUCUCAAAAAAAAAUAAUAAAAGGAACCGUAAUGCUAGUAGUGAUCUUUCUAGGGCUCUGACACUGGGGUACUGUUGGCAGGGAAACCCUUCUUCCUCUUGGGCUGCUCUUGGACCCUCUCAGUAGUGUUCCUUUUGGAGGUCUUUCACCUGUACCUCAUUUUUUCUUCUCCAGGUUGGACUGUCUGGUGACGGGCUGUAGUUAAAAGUUACCAUAAACCUUUUUUUUUCUUUUUAAAGAGAUGGAGUCUCGCCAUGUUGCCCAGGUCAGUCUCAAACUCCUGGGCUCAGGUGGUCCUCCCACCUUGGCCUUUCAAAGUGCUGGAUUUUAGGCAUGAGCCACUGCACCCAGCCAAUAAACCUUUAGUGUGGACACUGCAUUUCUACAGUAAAGUCACCAUUGACUUAUUCAUCAAUUGUAUAUUGAGGGCCUGUGCCAGGCCUCGUAGUAGGUUCUUAGGAGAUGAAGAUGAGCAAGACCUAGCCUCUGUAGUCAAGGGAGUGUGUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-370.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -391.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 319.05
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((...(.((((((....(((((.((.....)).))))).(((((((.((...((((((((...........))).........(((((((((....((((((((............((((((......))))))...........)))))))).......)))..))))))(((((((...............)))))))...............)))))..)).))))))).((((((.((.((.(((((....((((((..(((((((....)))))))........((((((((((....(((.((((((.....)))))).))))).))))))))...............((((((.((((.(((..((.(((((((..((((.(((((.........((.(.(((((((((((((.((..(((((((((((((((((((((((((........(((((.(((((..(((((((((((((((..(((.((....((((......................((((((((((((...(((((.(((((.(((((.(((((((..(((...((..(((.((((((((((((((.(((....))).))).))))))))))).))).......((((((...))))))....................)).....)))...))))))).)))))...))))).)))))((((.(((..(((((.....(((...........))))))))..)))))))............(((....)))(((((...(((((...................))))).)))))(((((....)))))...........))))))))..))))))))....)).)))..)))))))).)))))))..))))).)))))........)))))))))))))))))))))))))..)).))))))))))))).).))))))).))))..))))))).))..))).))))......(((((.((((((.........)))))).)))))..((.(((((........))))).)).(((((.(((((((...)))))).).)))))))))))))))))))))))).))))))))......)))))).)....)))))(.....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((,(({....)))....(({,{.((,,,..,|,|||}}...,|||||....}}}}}..,.,|||||,.((((((((((,,(((((((.((((({..((((((((............((((((......))))))...........)))))))).(((((...))))).....,{{{,,,{{,..{{{......))),)))}............(((((.(((((....(((((....,,,......,,......,........(((((((....))))))}........(((((((({{....(((.((((((,...,)))))).)))))}}))))))).,|,........,,}}},((((({,(({({{.....((((((((((.({..(((.((.((({...{(((((..(.(((..((((.......,.))))..)))|..)))))}....}))))).)))..)))))))))).))||{{,,({{.....}}}..},.....................}))|),)))))})))))..))))).))))}(((((.((((((((((((((((({.{(((((((((((((((((.(((....))).))).)))))),((((((((((((..(((((((.(((((((..,((({,..,,.((((((....,,..,|{{{,,{({{,,|{{,|||,{{{{(((((.((((((...,{..{(((((((({.,{,,({,{{....{{({((((...(({...}}},))}))),,,}}....)))))..}))).))))).,..},.........}})))))))))){{{{{,,,.}}}}}}}}.}}}......))))),,....)))))).,},,.)))))...))))))).)))))))..)))))))))))).,))))))),})))))))))))))))))).)))))....(((({{{{{{.{.(((((......(((....))).......)))))}.......(((((.((((((.........)))))).))))),.{,.{{{||........}}}}}.)}...}))))))))..)),})))))))))))))))),..}))))|||,.|||,|.{(........}}}}))},.},}..)))))(.....)
Back