Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GIGYF2_0025100
Sequence Length
709 nt
GC Content
0.4810
GCUGGUCUUGAACUCCUGACUUCAGGUGAUCUUCUUGCCUUGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAACCGCCACGCCCGGCCCUAAAAUUAUUUUCUAUUUGUGAAUGUAAAAUUAGUGGCUAUAAAACCAUGUUGUCUGCAAUAGAAUACAUUCGCAAGGAUGGAAGUUCCGGUUGUUGUCCUGUCAGGAGGGCAGAACAGUGAGGAGGCUGCAGUAUAGACUAGGUAAAAGAUACCAGUGACUUGGAAUAGGGUUUUGGUAGUGGGGAUGAAAAGGAGUUAGAUGGAUUUCAGAAAUGUAGGGGAUAGAAUUAACUGGACAAGAAGAGUGGAAAGGUCUCAGGCUUGGGGACCAGGAUGGAUGGAUGGUGUUGCCAUUUGCUGUGAAAUGAUAAGCAGUGGAACAUGGCACAGGCUGAGGGGAAUUGAGUGUUGACUGGGUUGAGUUUGAAAUGUCUGUGGGACAUCAUGAAGAGCGUGAGACCCCGCACAGUGAGAGGCAGGUGGUAACCUUACUGUACCCUUGGUAGGAUUCUCUCUUUCCCUCAGAGCCUUCCAGCCCUGGUGAAAACAACAUGACAGUAAAACCUAACUUUUAGGACUGUCCUUUAGAAUUGGUGCCUGAAGCCAGACGCGGUGACUCACGCCUGUAAUCCCAGAUCUUUGGGAGGCUGAGGCGGGUGGAUCGCUUGAGGUCAGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-272.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -285.81
Frequency: 0.0000
Diversity: 132.72
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...........)(((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((..((((((((((((((((((..((((.(((((.((.((((((((...(((((((((((((((((......((((........))))((((....))))....))))))))))..)))))))(((((((((.(((((((......)))))))..((((......))))........(((.((((.....)))))))))).))))))..))))))))..)).))).......((((((.....))))))..........(((((.......(((..........)))......))))).(((((.(((((((((.((((.((....(((.((((((((((((..........))))))))...)))))))..((((((((((..(((.(((.(((((((................(((((...(((((.....)))))...)))))((((((((.(...........)))))))))))))..)))..))).)))..))))))))))..)).))))..))))))...........((((((....(((((...)))))))))))..............))).)))))...)).))))..))))))))))))))))))..)))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.{.........)(((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((..(((((((((((((((((({((((((({(({(((((({........(((((((((((((((((...,,.{((({.,,,...,,,}}},},},}),,},...)))))))))),.}))))))|((((((((.(((((((......))))))}..((((......))))........(((.((((.....)))))))}))}}))))))))))).,)),.)))),,.......{{((((.....}|||||.......,..|||||....,},|))...,......,||......{{||,.(((((.(((((((((.((((.((,{,(((((,(((((((((((......,,.,))))))))}}})|)},}|{{((((((((((..(((.(((.(((((((.............,,,(((((...(((((.....)))))...)))))|(((((((.,,,......,..})))))))}))))..)))..))).)))..))))))))),.})),))))..)))))}...........((((((....(((({...})))))))))),,.......,}},.))).))))),}})}))))...))))))))))))))))))..)))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))
Back