Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GPR137C_0001200
Sequence Length
2126 nt
GC Content
0.3057
CUUCUAGCCUGAGAGAAGGUCCCAUCCAUGGGGCAGCCAAAACUGGAAGAGAAAUCCACUGUUUUACUGGCUUGAAAAAUCAGAAGAUAAAAUUGUAGUCACUACUGCAGAUGUAAAGUGAGUAGGAAAUCUCAGGAAGAAGAUACCAGAUAGAAGAAGACCCAUACUCUUAUUAUAAAGUCUGUCAAAAUUUUAUCUGAUACCUGAACUACACAUGUGAAAGACAGGCUCCAAACAGCACAGUUAAAGAUAAAGAAAUUUAACUGAGAUUUCAGCUGACCAACGUAUGGGGGACAGAGUUUGGGAUUUCAGUUCAGCCAAGUUAAUUGUUUGCUAAAAUAAUUAAAAAUCAACAUCUUUCAGAACAUAAUAGCAGAAUCCAGACUCUAAAAUAUGUCACUCACAAUGUCCAGGUCAAGGUUACAAAUAUAUGAAGAAACAGGAAAUACAUACUCAAGAGCAAAAACCAAAACUCAAAAGGCAAUGAAGACAACCCCACCACCACCAAGAUAACCUAAAUUUUGGAUUUAUCAGACAAAGCAUUUAUAAUAUGCUCAAGGGCUUGAAGGAAAAUACACUUGGAUAAAUAAAUAGGAAAUCUCAAGAGAAAUAAAAACUAUUAAAAAAACCAAAUGGAAAUUCUAGAAUUUAAAAAUAUAGUAUUUAAAAUAAAUGUCACUAGUUGUGCUUAACAGCAGCAUAUUGGAGAUGAAGGAAGAGUCAGUUCACUUAAAGAUAAAUCAAUAAAAAGUAUCCAAUCUAAAGAACAGAGGAAAGUGGGGAAAGCCUGUAAUAAAACAGACAGAAGCUCAGGAGUCUAAUUAUGUGUAAUUAUCAUCCCCAAAGGGAAAGAGGAAGAACAUGAAGUUGGAAAAAAUAUUUGAAAAAAUAAUGACCUAAACUUUCCAAUUUUGGUGAAAGACAUAAAUUAUAAAUUUAUGUCUUUCAAGCUUAGCAAACCCAAUCAGGAUAAAUAUGAAGAAAAUUUUGUCUAGGGUCAUUACAGUUAAAGUGCUGCAAACUAAAAAGAAUAAGAAAAUCUUGAAAACAGAGAAAAAUAAAUUAUAGAAUUACAUAAAGGGACAUCAAUGUAAAUGAUGACUCACUUCUCAUCAGAAAUAAUGAAGGCCAGAAGACACGGAAACGGUAUUUUUUAAAUGCCAAAAGAAAAAAGCUGUCAACUCUGAAAUACAAAUCCAGUGAAGAUAUUAUUAAAGAACAGUGGAGAAAUAAAAACAUUUCCAGAAAAAAGAAAACUAAGGGGAUUACUUACCAGCAUACCUAACACUGUAAGAAAUGCCAAGAAAAUUCUACAGACUGAAAAGAAAUAAAACCAGCUUGAAUUUCAGCUCUUCAAGAAGGAAUGAAGAACAUGAGAAAUAGUAAAUAUGUGGGUAAAUAUGAUUUUUAACUUCUUUAAAAUAUGAUUAUGCAAAACAAAAAUCACGUAAUAUUGUGAGGUUUACAUAUGUAUACGUAAUAUAUAAUUCUCUGUGUAUUAUAUAUAACAACCAUAGCAUAAAGGAGAGGUUGUAAAUGGAUCUAUACAGUUGCAAAGUUCUAACAUUUAUAUCAAAUGAUAGGAUAUUAACUACUAUCUAGACUGUGAGAAGUUAAGGAUAUAUUUUAUAAUCCCUAGAGCAAUGGUUCUCAAAUUUUUUGGCCUCAAGACCCCAUCACACUCCUAAAAAUUAUUGAUGAUGCCAGAGAGCUUUUGUUUGUGUAUAUUAUAUCUAUUAAUACAAAUCAUACUAUAAAUAAAAAAUUAAGAGAUUAUAAAAAUAUCCAUUUAUUAAUUUAUUUAAAAUAAAUCCAUUACAUUCUAACAAAUAACAUGUUUUAUAAAAAAAUUUUUAUAAAACAAAAUAAUACUGAGAAGAUUGGCAUUGUUUUACAUUUUGCAAAUCUCUUUAAUAUCUGACUUAAUAGAAGACAGCUAGAUUUUUAUGUCUGCUUCUGCAUUCAAUCUAUUGUGGUAUGUUGUUUAGGUUGAAGCAUAUGAAGAAAAUCCAUCCUCACACAUAUAUAUAGUUGGAAAUGGAGGAGAAUUUUAAUAGACUUUUCAGAUAAUUGUGGAUAUCUUCUUUAAUACUACACCAAAACUCAGAAGUGGAGGUUUCUUAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-414.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -457.06
Frequency: 0.0000
Diversity: 631.81
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..(((((((....((((((....))))))(((((((((((((.......))))..))))...)))))......(((....)))....((.((.(((((..(((....))).))))).)).))..))))))).))))).....(((..((((((((.(((((...(((((..(((((((((.((((((((.(((....(((((.((.(...(((.....(((((((..........((((((((..........))))))))..........(((((.((((.((((((((((((((((((..(((.(((........((((((((((....)))))))))).........(((...))).......))).)))))))))))).......)))).))).))))))...))))).((((.........(((...................)))........)))).....(((........)))......((((((......((((((.......))))))((((((((........(((((.((((((((((((....)))).((((....((.((((.......(((((......................))))).......)))).))....))))..............(((((((((...)))))...))))(((((.....))))).)))))))).)))))((((((.......))).)))...))))))))...........(((..(((.......))))))..))))))..)))))))......)))....).)).)))))..((((((((((((((.......((((....))))..(((((.(.....(((((((((((............................)))))))))))..(((((((((((((((...))))))))))))))).((...))..((((.....(((((((............))))))).)))).....((((......))))......................((((.......))))..........................((.(.(((.(((...((((((........))))))...))).))).).))...(((((.(((((.(((((((...)))))))..........(((((((...((((.........((((.((.................)).))))(((((......)))))))))...........((((((((((........(((..........(((((((((((((((.....((((.(((..((((((.........((((((....((((((.((((((........)))))).).)))))...))).......)))..........)))))).((((((((...((((..((((((....(((..(((((......)))))..))).....)))))).((((((((((......))))))))))..........))))...))))))))(((.(((((.(((((.(((...........((((((.(((((.....))))).)))))).((((((.((..(......)..)).))))))((((((.((((((((((.(((((((....)))))....(((((((((.(((..............................))).))))))))).(((((((((((((((((...............))).)))).)))))))))).....)).))))))))))))))))...................))).)))))))))).)))...........((((((((((((....))))))))))))........)))))))..)))))))).)))))))...))).))))))))))...((((......)))).)))))))...))))).))))).(((((((.(((((((((...............))))))))))))...))))......).))))).....))))))))))))))...)))..)))))))).)))))))))...))))).)))))...))))))))........(((...(((....)))...))).))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({.,(((((.....((((((....)))))){(((({{{({(((.,.....||||,.||||{.,|||}|{,....,||,...}},....,(,((,({{{{,}|||,,.,|},.|||||,|}.||.{|||||||.,},}}.,..|{{{{,((((((((.{{(((...(({{{..{{(((((((.{((((({|,|||,..,((((..,{.,...,|||...,{||||((,,...,|||.((((((((..........)))))))),,,||||,,{(((((.((((.{{(({(((((((((((((,{((,.(({,.......((((((((((....)))))))))).........,{|...,))........},.))))))))))))}......}))).))),},))))...))))}.}}}..,,.{{{{,{{.......,{,,........{((,.({((...,,,,....{,,....{{,..||.......((((((.....,((((((.......))))))|(((((((........(((((.{(((((((({{{....}}},.{({{....({.((((.......{((((....,.,,....,,........))))}.......)))}.))....})))....,,,.......,,||{||||...,,,,,,,,.||,(((((.....)))))})))))))).})))){{{{{{.......))).)))...))))))))...........{((..{({.......})}))}..))))))...}}||((,,,,..||||{{{{{{||||.{|||((({{((,(((((..{,.{{.((((....))))..}}..,...}}}}|,|||||||,,...|||||....,,,||,{{{{{{....,,,|||,,,,)}}(((((((((((((((...))))))))))))))).{{...}}...,,,.....(((((((..,.........))))))).))))}}}},((((......))))...............,,,....||||,......}}}}........,,......,|,,||...{{{.{{(({.|,,...}}}}}|))).,}}.})}}}}.......||,|||||||{{{|,..,,...,(((((((...}))))))..........,{{({({...{(({.........{{{{,{{..,,|..,..,..,,,.}}.||||((,,,......,))))}},............,..((({(((,.{{({{.({{{,.......{((({{((({{.,,,,.....||||}|||.{{{...,..........,,|{{....{(((({.((((((........)))))).,.))))}...,}}...}}}}}.}}}}|{{{{,,{{{{{{{((((((,....{{{{..((((({....,{{..(((((......)))))..})}.....}))}}}.{({(((((((,.....}}})}))))),}}}.{{{{{|,|,.{.,,,.}},},}}}|||..{(((,({({.,.{({,,....((((((.(((((.....))))).)))))).,|,,|,,||...,,}}}})}}))}))))))||||||}||{,,|||||}||{((((....)))))....|||||||||}|||.,,...,,{{,................}},))}.}})}},)))}}|||||||||,{,||||}}......,.,,,...,.,||||,||||}}},,...,,,||,||||}}}|||||}},,...,,,,..,,,,,.|{{{||||,,|||,,,,.{|||...........((((((((((((....))))))))))))........,,,))))..}))),}))}))))),}...},,.})))))))})}},|||,..,...}}}}{|||||||{{{{.....,)}))}||||||{.{{{{{{{||,}},}}},}},.,}})}))))},})),,.,)},}....,.,.|||||.,.,,}}}},...}})),...)))))})))))))).)))))))))...))))}.}))))...)))))))).........,.....}}}})...))))))({{....,})
Back