Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_GRIN2B_0001100

Sequence Length

317 nt

GC Content

0.3975

GUUUCACAUAGGCAGGAAGCAAGGAGGAUAGUGAAGCAUCUAGGUGGAGGUGGAACUCUUACUGAGAAAAACAUGAAGUAGUAAAAUCACCCUUUCUUUGAUAUAAAUGCAUUUAGAAGUCAAUGAGGGCACUUACAGCUGUGUUUCCCUUCACUAACUUUUCAUCUCUUGCAUUCUUUACUUCUCUUUCUCAAUUUAUUCAUCUUGAGGUAUACUUAUCCUGAGUUGACUCUGAGCAGCCCAUCCUCAAAACACAAACAAUGUUAGGAUGAGAAGUUGAGUGAGCACAGAGCUCGAACACGUGCAUGGUACUUAAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-65.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -73.32

Frequency: 0.0000

Diversity: 88.11

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((...))((((..(((((((((((((((((((((((..(((.(((((((......))).)))).))).((((((..(((.((((.....(((((...(((((.((((....))))...))))).)))))...)))).)))))))))..))))))))....))).)).))))).)))))..)).......((((((((.((((((((((((....((..((..(((....))).))..)).....))))).((((.......)))).)))))))))))))))(((((.....))))).....((((...))))...))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((.,,,|,,,{,.(((({(((((((((,((((((((..(((,({{((((......)))},})},})}.((((((..(((.((((.....(((((...(((((.({(,....,))}...))))).)))))...)))).)))))))))..)))))))).,,}))}.}),))))).)))))..}},,,,.,.((((((((.((((((((((((,...{{,.,,.,||{,...))},||{.|,.....})))).,,,,.......}}))}))))))))))))))),((((.....))))}.....{{||...)}))...,)