Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GRIN2B_0001600
Sequence Length
2099 nt
GC Content
0.5693
UUCCAGAGACCUAAUGACUUCUCACCCCCUUUCCGCUUUGGGACCGUGCCCAACGGCAGCACAGAGAGAAAUAUUCGCAAUAACUAUGCAGAAAUGCAUGCCUACAUGGGAAAGUUCAACCAGAGGGGUGUAGAUGAUGCAUUGCUCUCCCUGAAAACAGGGAAACUGGAUGCCUUCAUCUAUGAUGCAGCAGUGCUGAACUAUAUGGCAGGCAGAGAUGAAGGCUGCAAGCUGGUGACCAUUGGCAGUGGGAAGGUCUUUGCUUCCACUGGCUAUGGCAUUGCCAUCCAAAAAGAUUCUGGGUGGAAGCGCCAGGUGGACCUUGCUAUCCUGCAGCUCUUUGGAGAUGGGGAGAUGGAAGAACUGGAAGCUCUCUGGCUCACUGGCAUUUGUCACAAUGAGAAGAAUGAGGUCAUGAGCAGCCAGCUGGACAUUGACAACAUGGCAGGGGUCUUCUACAUGUUGGGGGCGGCCAUGGCUCUCAGCCUCAUCACCUUCAUCUGCGAACACCUUUUCUAUUGGCAGUUCCGACAUUGCUUUAUGGGUGUCUGUUCUGGCAAGCCUGGCAUGGUCUUCUCCAUCAGCAGAGGUAUCUACAGCUGCAUCCAUGGGGUGGCGAUCGAGGAGCGCCAGUCUGUAAUGAACUCCCCCACCGCAACCAUGAACAACACACACUCCAACAUCCUGCGCCUGCUGCGCACGGCCAAGAACAUGGCUAACCUGUCUGGUGUGAAUGGCUCACCGCAGAGCGCCCUGGACUUCAUCCGACGGGAGUCAUCCGUCUAUGACAUCUCAGAGCACCGCCGCAGCUUCACGCAUUCUGACUGCAAAUCCUACAACAACCCGCCCUGUGAGGAGAACCUCUUCAGUGACUACAUCAGUGAGGUAGAGAGAACGUUCGGGAACCUGCAGCUGAAGGACAGCAACGUGUACCAAGAUCACUACCACCAUCACCACCGGCCCCAUAGUAUUGGCAGUGCCAGCUCCAUCGAUGGGCUCUACGACUGUGACAACCCACCCUUCACCACCCAGUCCAGGUCCAUCAGCAAGAAGCCCCUGGACAUCGGCCUCCCCUCCUCCAAGCACAGCCAGCUCAGUGACCUGUACGGCAAAUUCUCCUUCAAGAGCGACCGCUACAGUGGCCACGACGACUUGAUCCGCUCCGAUGUCUCUGACAUCUCAACCCACACCGUCACCUAUGGGAACAUCGAGGGCAAUGCCGCCAAGAGGCGUAAGCAGCAAUAUAAGGACAGCCUGAAGAAGCGGCCUGCCUCGGCCAAGUCCCGCAGGGAGUUUGACGAGAUCGAGCUGGCCUACCGUCGCCGACCGCCCCGCUCCCCUGACCACAAGCGCUACUUCAGGGACAAGGAAGGGCUACGGGACUUCUACCUGGACCAGUUCCGAACAAAGGAGAACUCACCCCACUGGGAGCACGUAGACCUGACCGACAUCUACAAGGAGCGGAGUGAUGACUUUAAGCGCGACUCCGUCAGCGGAGGAGGGCCCUGUACCAACAGGUCUCACAUCAAGCACGGGACGGGCGACAAACACGGCGUGGUCAGCGGGGUACCUGCACCUUGGGAGAAGAACCUGACCAACGUGGAGUGGGAGGACCGGUCCGGGGGCAACUUCUGCCGCAGCUGUCCCUCCAAGCUGCACAACUACUCCACGACGGUGACGGGUCAGAACUCGGGCAGGCAGGCGUGCAUCCGGUGUGAGGCUUGCAAGAAAGCAGGCAACCUGUAUGACAUCAGUGAGGACAACUCCCUGCAGGAACUGGACCAGCCGGCUGCCCCAGUGGCGGUGACGUCAAACGCCUCCACCACUAAGUACCCUCAGAGCCCGACUAAUUCCAAGGCCCAGAAGAAGAACCGGAACAAACUGCGCCGGCAGCACUCCUACGACACCUUCGUGGACCUGCAGAAGGAAGAAGCCGCCCUGGCCCCGCGCAGCGUAAGCCUGAAAGACAAGGGCCGAUUCAUGGAUGGGAGCCCCUACGCCCACAUGUUUGAGAUGUCAGCUGGCGAGAGCACCUUUGCCAACAACAAGUCCUCAGUGCCCACUGCCGGACAUCACCACCACAACAACCCCGGCGGCGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-732.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -767.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 507.32
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((...........................))))))))(((((((....))))((((.(((.((.......((((.....(((((....(((((.(((.(.(((..........))))))).))))).....)))))(((((((((((....))))))...((.(.((((((((((.((.(((...(((.....))).....)))..)).))))))))))).)).(((.((((((..((.(((((((..((.....(((((((.(.(((.((((.((.(((((((.........))))))).)).))))))).)..(((.(((((((.((.(((....))).)).)).))))))))...)))))))...))..))))))).)).((.(((...))).))......)))))).))).((((((((.(((((...(((((((((((((.((((((((((...((((((((...((((...)))).......((((.(((((((((...((((((.(((.(((..(.((((((........)))))).)..))).)))(((......))).((((((....((((..((....))..))))...((((((((((......((((....((((((((..((........))..)))............................((((...(((((((..(((((......))))).(((.....))).......((((......))))((.(((((..((((..((((((.....)))))).))))..)).))).))...).))))))....))))....)))))....))))........)))))))))).)))))).(((((((.(((.....))).))))).)))))))).))))((...))(((((((((.(((((((...(((.........)))................(((((((......)))..).))).........(((((((.((..(((((.(...................)))))).))))))))).(((.(((((((((((((..(((((((((((((..........((((((((.(((.((((((((((...((((......)))).).))).))))).)..)))...((((((.((.(((((((((((...)))))).................((.(((((...((((((.((..(((((....((((.....................))))......))))).)))))))).....))))).)))))))..)))))).)))))))))).....((((((....((((..((((.(((((.....(((((.((((..(((...((..((((((((.(.((((((..(((...((((((........).)))))....))).))))))).))))).)))..))....)))....)))).(((((....))))).)))))......))))).))))..)))).((((....))))(((((...........))))).)))))).......((((((((((((((...))))).....((........))))))).)))))))).)))))).)))))))))))))...))))))....))))))).))..))))))).......(((((((.((((..(((((.(((.((((((.(((((.((.((.((((((.....((((((......))))))..((((........(((.(((.....))).))))))).))))))...)))).)))))..(((((.((.(.(((...))).).)).))))).............))))))....)))...)))))............(((.....((((....))))...))).....)))).)))))))...)))))..))))..))))))))((((((...((((....).)))...)....)))))....))))..)))))))))))..)))...)))))...)))))))))))))..)))))...))))..........))))).))))...(((((((....................))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((....,,.{..............,....))))))))(((((((....)))}((((.(((.((....,{,{((,.....(((((....|||||,(({.,.{((,.........}}}||}},|||||..,..))))){{{{{((((((....)))))}...{(.{.((((((((((.{(.(((,,.(((.....)))...,.)))..)).))))))))))}.)}.(((.((((((..((.(((((((..((.....(((((((,{,(({.((((.(,.(((((((.........))))))).,).))))}}),)..(((.(((((((.((.(((....))).)).)).))))))))...}))))))...))..))))))).)},((.(({...,)).)},.....)))))).))).((((((({{(((((..{(((((((((((((.((((({((((...((((((((...((((...)))).......((((.(((((({{{...{,{{{,.,{(,(((,.(.({{{{{.{,....||)))}}.|,,|||,}},(((,,,,,{|||,{{{(((....((((..({....))..))))...((((((((((.{...,{(((,.,,{({{{,{,..{|..,,,,..},.,}},.,,,}|......................((((,..{{{|||||.(((((......})))}..,|}|}||||||||,.,,((((....,,))}}((.(((((..((((..((((({.....}))))).))))..)).))).))...},,||}|},,,.}}},,,,,)})))|...}}}}.,......}}))}))))),)))}},,{{(((((.(((.....))).))))).))}}}},,.}}}){{,..,.(((((((({.(((((((..,({(,........,,}................||{,{{{..,...|||,.}.))),||,.....(((((((.{{..((((({(....................))))).})))))))).{{,{({{((((((((((..(((((((((((((..........((((((((.(((.(((((((((,...((((......)))).,.))).))))).),.)))...{,{{{(.{{,{{{{,((((((...))))))...........,{{{,{((.(((((...(((({{{((..(((((....((((,....................))))......))))).)))))))).....))))).)))}}}}.,))))}).}})))))))).....((((((..,{((((,,((((,(((({.......{({.{{|,,||{,...((..((((((((.(.((((((..{((...((((((........).)))))...,)}}.))))))).))))).)))..))....})}...,)})))|((((,.,{,|,...,||}|.,||||})}}}.))))..)})){((((....))))){{{{...........)))}).)))))).......((((((((((((((,,.}}}}},,,,,|{........}))))))},))))))).)))))).)))))))))))))..,))})))}}..))))))).)}..))))))).......{((((((.((((.,(((((.(({.((((((.(((((.((.((.((((((.....((((((......))))))..(((({.......{{(.(((.....))).))))))).))))))...)))).)))))..{((((.((.(.(({...})),).)).))))}..,..........))))))....}))...))))).,.,,.....,|((|.|...{{|{.,,,)}}}...}}|..,|.)))).)))))))..,)))))..))))..)))))))}((((({...((((....)}}))...)....)))))....))))..}))))))))))..)))...))))),}.))))))))))))),}))))}...})))..........))))).))))...(((((((....................))))))))))
Back