Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_GRIN2B_0003000

Sequence Length

375 nt

GC Content

0.4693

GUGGGGAAGUGGAAAGACAAGUCCCUGCAGAUGAAGUACUAUGUGUGGCCCCGAAUGUGUCCAGAGACUGAAGAGCAGGAGGAUGACCAUCUGAGCAUUGUGACCCUGGAGGAGGCACCAUUUGUCAUUGUGGAAAGUGUGGACCCUCUGAGUGGAACCUGCAUGAGGAACACAGUCCCCUGCCAAAAACGCAUAGUCACUGAGAAUAAAACAGACGAGGAGCCGGGUUACAUCAAAAAAUGCUGCAAGGGGUUCUGUAUUGACAUCCUUAAGAAAAUUUCUAAAUCUGUGAAGUUCACCUAUGACCUUUACCUGGUUACCAAUGGCAAGCAUGGGAAGAAAAUCAAUGGAACCUGGAAUGGUAUGAUUGGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-87.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -95.37

Frequency: 0.0000

Diversity: 103.65

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((..((......))..))))(((((..........(((((((((((((..(((.(((((.(((((....(((((.((((.....(((.((((..((..((((...(((((..((((...((......))....))))..))))).)).)).)).))).).)))......)))))))))..........))))).))).)).....)))..)).)).))))...))))).........)))))((((((((......)).)))))).....((((((.........)))))))))((.(((((.......)))))(((.((.....))))).........((((.(.(((......))).).))))...))

Thermodynamic Ensemble Prediction

{((((((.{(,{,...{{{,,{((((((((..........{((((((((((((..(((,(((((.(((((..,.(((((.((((.....(((.,(((..((..(((((({((.{.{{{{(({{.{(,...,}}.}))})))...))))).}).)}.)).))).}.)))......))))))))),.........))))).))).)}.....)))..)).)).))))...))))).........))))}|)))}||,}}}.}}.)),))))},.....,{(((|.,,,{.{{||||,||}},,.|||{|,}},|..)))).((,,((.....)))}),.......,((((.{.(((......))).).))))},.)}