Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GRIN2B_0004300
Sequence Length
407 nt
GC Content
0.5012
GUCCUCCUACUGGACAUGUCCCUGGACGAUGGAGAUUCUAAGAUCCAGAAUCAGCUCAAGAAACUUCAAAGCCCCAUCAUUCUUCUUUACUGUACCAAGGAAGAAGCCACCUACAUCUUUGAAGUGGCCAACUCAGUAGGGCUGACUGGCUAUGGCUACACGUGGAUCGUGCCCAGUCUGGUGGCAGGGGAUACAGACACAGUGCCUGCGGAGUUCCCCACUGGGCUCAUCUCUGUAUCAUAUGAUGAAUGGGACUAUGGCCUCCCCGCCAGAGUGAGAGAUGGAAUUGCCAUAAUCACCACUGCUGCUUCUGACAUGCUGUCUGAGCACAGCUUCAUCCCUGAGCCCAAAAGCAGUUGUUACAACACCCACGAGAAGAGAAUCUACCAGUCCAAUAUGCUAAAUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-118.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -124.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 97.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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