Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GRIN2B_0005200
Sequence Length
665 nt
GC Content
0.4045
UUUUAGUCUCCAUUCUGAUGAGCUUUGAAAAUGUGGACAAACACAUUAGUUAUACUACAUGAUACUCAGUUUAUAGUUUAUGAGAUAUAAAUUUUGUGUUCUGCCCUAUACACCUUACAUUUUGAAGAUAAAAUGAAAUAAAAUAUAUGGAAGAUUUUAGGGCAGUACCGUGGCAAACAGACACUUUAGGUGAGGGAAAUAAGGAGUAGUGAUAGGGAAUGACAGAGUCAAUGACAACUGUUUUGUCCUUGGCAUUAGGACUAAUGAAAAUGGCUUGAGCAGAAGGUAGGAAGGAAAAUAGAAAGGUAGAAGUUACAGUAGGAGCAGGCAAAAGGAUUCAAGAUCCAACUUUAAUGCUCCAAGAAUGGGGAAGAAAAGGGUAUGCUGAGUAAAGGGUCAGGAUCUGGAAAUAGACAUGUUGAUCAGGGUGUAGCAUGGUAGCUAAAACGUGCAUCACAUUCUGGAUCUUAUUCUUCCUUAGAUGACAUGCAAAAAUAUUCUUACUGUGGAGUCUAUUGCUAUGAUUCUUUCCUUUCUAAAUUGCUUCUUUGGGGGCCAGGCACGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGAGGCGGAGGCAGGCAGAUCACCCUAAGUAAGGAGUUCGAGACCAUUCUGGCCAACAUGGUGAAACCCCGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-178.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -189.70
Frequency: 0.0000
Diversity: 131.29
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(((.........)))..))))))(((.((...((((((....(((((((.(((((.(((........)))))))))).)))))....))))))((((((((.....((..(((..........................)))..))....))))))))(((((((.....((((((((...)))).........((...(((((.((((((..(((((.(((...)))..)))))...)))))).)))))...)).......(((((((((((...(((.(((((((((.((((...((((((..((((((((((((.........(((((...)))))..((((....(((((....)))))....)))).((((((((((..((((((.((((((((((.......((((.(((((.(...((((......))))...).)).))))))))))))))))))))))).)))))....))))).......))))))))))))..)))))).))))..))))))))).)))....(.(((.(((((((((((.......))))((.(((((((..(((..((.((....))))))).)))))))))...))))))).))).)))))))).)))))))).....)))))))....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.(((,{,....,})))..))))))(((.((...((((((..,.(((((((.(((((.(((........)))))))))).))))).,..))))))((((((((.....((,.((({{{.....,....,....,.......)})..}}....))))))))(((((((.....((({((((...}))).........((...(((((.{(((((..(((((.(((...)))..)))))...)))))}.)))))...))......,(((((((((((...(({.(((((((((.((((...((((((..((((((((((((,,.......(((((...)))))..{{{{..},||||,....|||||,{,,|}||,(({(,(((({..{{{{{|,||{((((({{.......,{{,,(((((,(,,,((((,,,...}}}}...),)),})}))))))))))))))}))))),))))}....}}}}).......})))))))))))..)))))).))))..))))))))).)))....{.(((,{((((((((((.......)))){(.(((((((..(((,.((.(,....,}))))).)))))))}}...)))}))}.})).,))))))).)))))))).....)))))))....)))))
Back