Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_GRIN2B_0005600
Sequence Length
1455 nt
GC Content
0.4460
UGAAGAGAGGCGUCUGUACACAGGGCAGUUGCAGGCAGUAGCCCAGGGUCAUUGUACUUAGGUUCAUGUGAGCAGAGGGAAGUUUUCGUGUAGAGAAGAAAACUGUUUCCAUGAAUAUUAUUUCAAUUGAAAACGCUUCAUUGAAUGUUAUUUUUAAGCACUUCAGUUUCUUAAUCAUUAUAAACUGGGGUCUUCACUUCUCAACAGUGACAGCUUAUUUGCUGUUUUUGGGAGGCAGGGAAGGAAUUUCCAUGCUGUAAUAAGCCAGCCUAGCUGAUUUCCUAAACAGCUCUCAGAGGCAGCUGCGGUUUCAGUCACCUAGGAAGCUGAGGAUAAAAUGGAUUUAGCGAUGGGAGAUCUGUUCCUCUUCCUCCCGAUCUUCCAUUGUUUUUGGUUGCAUCUCUAGCGUUAAGUCCGAGCGCCAGCUGAGCAUCCCCAAUUCCUUGGCUUGCCUUUUCAGCUUUUCUCCAAACAUUCCUUCCGUGGGCUCUUGCUCCUGGCCAGGCCACGCUGUUCUCAUUCCCCAAUAUGUUUUGUGCCUCACUUGUUUUCUGACUUAAGGCAGCCUCAUUUUUGUAUUUUGGCUCCUUUCCUCAGAUACCCUCGGUGCUCUUUAGUCCAGCUCAAAAGCUGCUUCCUAAUAAAGGCAUCUCCAGGACCCAAGGCCAGGGCAGUCCCUGUGCCCUUGUCUUUAUACUGCCUUAGCCCUCUCUGCGGCCCUGACAGUCCUGUGUUGGGGAGUGUGUGUGCUUUUCUGUGCAGGGGUGUCAGGUCCUUGUGGCUGAAUUCUGACUCCUUAUCACACUUUACAGUGACUCACAGAUGGACACACAAUAAGGACAUGUUGGUUCAUUGGACUUUUGAGGACAGAGGGAUAGAAGCUGGUGUGUGAAGUCGUAAGUCAAGUUUUCAGCUUUCAACAUUUAAUUUAAGGUGGGAGAGUUGCAGACAUCCUGAUUGUACUCCCUUUAUCUGAUUUUGGAGAAUUCUGCCCAUGGAUUCUGGCCUGGCCUGCAGCUGUGUCCGGCAUGUCAGGGAGGAGCUCCAUUUGGCCUCAGUGGGGCAUGGACAAGGAGGCACUGACUGUACCGGCCUGUCCCCCUUGCCAUUCCUAUGGCGAUGGUGGACAUGGUCACUCAGGCCUGAUAUAUGUGCUAUUCUAGCAGGGUCAAGAGGCUGGAUUCAGAGAGAGCAGCUACUUGCUUUCAAAAACACUAUGAAAUGUGAAGGGUGACCAAAUUGCAACUAUAUUAUUACUGUUACAGGAAAAGAUUCACAAACAGUUCUCAUUUUUUUUUUUUUUUACUAAUUCUAAUUUCUUUUCUGCAUAUUAAGAAAAACCACAAAGUUAACGUUAUAUAUUUCUUUGCAAUAUCACCUUUUUAUUUUCUUGUGUUGUUAUACGGUCAUGUGCCCUAUAAUGACAGUGGUUCUGUAAGAUCAUAAUACUGUAUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-450.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -477.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 342.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(.((((.((.((((.((....((((((((((((..(((.((((((((..((....((((((((.((.((.((((((((((((((..........)))))))((((....(((((.((((.((((.(((.....))))))))))).)))))..))))((((((((((.(........).))))))))))((((((.......(((.((((((......)))))).)))(((((((((.((((((((((((((((......)))((((...))))...((((...(((((.((..(((..((((......))))..)))..)))))))))))....)))))...((((((((((((((................))))))))))))))...((.(((.((.((.(((((.......))))).))..))))).))..))))))))..)))))))))(((((((((.(((............(((((.((...(((...))).)).)))))(((((((((.((((((((((((((((((((......((..(((((...((((.((((...............))))))))...))))).))....)))))...((((..(((((....)))))....))))..((((((.....(((((....((((((((....))))).)))...))))).....)))))).((((.....).)))(((((((......)))))))...(((((((.(...((((((.(((((.((((((...............)))))).)))..((((........)))))))))))).).)))))))...))))))))))))......)))....)))))))))..))).)))))))))...))))))..((((((((.((((.((((((((..(((((......))))).)))))))).))))....))))).))))))))))..)).))..))))....))))..))..)))))))).)))))))))))))))(((((((...(((..((((....((....))))))..))).)).)))))..((.(((((((((((((..(((((((((((.(((((((....))))))).)).))))).))))..((.(((((......(.(((((...))))).)......))))).))......((((((((....))))))))...(((((...((((...(((((((((....(((((((..........((((((....(((....)))...))))))...................................((((((........))))))...........................))))))).)))))))))...))))..)))))....)))))))).)))))))....)))))))).)))).).)(((((......)).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..{.((((.((.((((.{,....((((((((((((..{((.((((((((..,,..,....|{{({{(.{|((((((((((((((((........,.))))))),||}}}..((({(.{{,{((((,{(((.....)))))))))}}.}))}}..{{(,((((((((((..,,.....,).))))))))))}}|,,({{{,{,.,||,|{({({......||||||,|||{|{{|({(({{((((,{{|||,,(((......))){{((..,||||.,|||||...|||||,||,,|||},||(({{{{{{||,,{{||,{{|{(((((((({.....|||,...{(((((((((((((.,..............)))))))))))))}...((.(((.((.((.(((((.......))))).))..))))).)))}),,)))))}}))),)))...{(((((((.(((............(((((,({...(({...))).)),)))))(((((((((.(((((((((((((((((({{.,....{,..(((((...((((.((((...............))))))))...))))).}}....))))}...,{{{..(((((....))))),,,,||||,,{((({{.....((({{..{{((({((((,,..}}}}}.))),}.))))}.....}}}}}}.{{{,.....).))|{{{{{{{..,,,.))))))))}}(((((((.(,..((((((.(((((.((((((.{{....}}..,...}))))).)))..{(((........)))}}})))))).),)))))))...))))))))))))......)))....)))))))))..))).)))))))))}}..)))))}}))}{{{{{.((((.((((((((..(((((......))))).)))))))).))))....))})).,.|}}}},,..,|,.....,)))),.,}))})}))}})))))))).))}))))))))))))(((({{(...(((..((({..|,||....)})}})..))),)).)))))..((.(((((((((((((..(((((((((((.(((((((....))))))).)).))))).))))..{(.{((((..,...(.(((((...))))).),,,...))))),),......((((((({....})))))))...(((((...((((,,.(((((((((....(((((((..,,,,.,..(({(((,..{(((,,,,,,,...,},}}}........,,,,,,.....................((((((........)))))}........},}},,},.,,},},....))))))).))))))))),,,)))}..)))))....)))))))).)))))))....,})))))).)))).}.)(((((......)).)))
Back