Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECTD1_0006700
Sequence Length
1370 nt
GC Content
0.4117
GAUUUUUGUGAGCAUGGAACAAAGUCUGGGUUAAACCAGGGGGCCAUUUCUACUCUUCAAAGUAGUGAUAUUCUUAAUUUAACAAAAGAACAACCUCAGGCCAAAGCAGGCAAUGGACAGAACUCUUGUGGAGUAGAAGAUGUCCUUCAGCUUCUGCGUAUUCUAUAUAUAGUUGCAAGUGACCCUUAUUCAAGAAUAUCCCAGGAAGAUGGUGAUGAACAGCCUCAGUUUACUUUUCCACCAGAUGAAUUCACUAGCAAAAAAAUUACAACAAAAAUAUUACAGCAGAUUGAGGAACCAUUGGCACUGGCAAGUGGGGCUCUGCCAGACUGGUGUGAACAAUUAACCAGCAAAUGUCCUUUUCUAAUACCAUUUGAAACUAGACAGCUUUAUUUCACAUGUACAGCAUUUGGCGCCUCAAGAGCAAUAGUAUGGUUACAGAACCGACGUGAAGCCACUGUGGAGCGAACGAGAACCACAAGCAGUGUUAGGCGAGAUGACCCUGGAGAGUUUCGAGUUGGUCGUCUCAAGCAUGAAAGAGUAAAAGUUCCACGUGGCGAGUCACUGAUGGAAUGGGCUGAGAAUGUCAUGCAAAUACAUGCAGAUCGGAAAUCAGUUCUUGAGGUUGAAUUUUUAGGAGAAGAAGGAACUGGCUUGGGACCCACAUUAGAGUUUUAUGCUCUGGUGGCAGCAGAAUUCCAGAGAACUGACUUGGGAGCUUGGCUUUGUGAUGAUAAUUUUCCAGAUGAUGAAUCUCGUCACGUUGAUCUUGGAGGUGGAUUGAAACCUCCUGGAUAUUAUGUGCAGAGGUCAUGUGGACUGUUCACAGCACCAUUUCCACAGGAUAGUGAUGAGCUUGAAAGGAUCACGAAACUGUUUCAUUUCCUUGGAAUUUUCUUGGCCAAAUGCAUUCAAGACAAUAGACUUGUGGACUUACCUAUUUCUAAACCUUUUUUUAAACUUAUGUGUAUGGGUGACAUUAAAAGCAAUAUGAGUAAACUGAUUUAUGAGUCACGAGGUGAUAGAGACUUACACUGUACUGAAAGUCAGUCUGAAGCUUCUACAGAAGAAGGUCAUGAUUCACUCUCGGUAGGAAGCUUUGAAGAGGAUUCAAAAUCAGAAUUUAUUCUUGAUCCCCCUAAACCAAAACCCCCAGCUUGGUUUAAUGGAAUUUUGACUUGGGAAGACUUUGAAUUAGUAAACCCACACAGAGCCAGAUUUUUAAAAGAAAUUAAAGACCUUGCUAUCAAGAGGCGCCAAAUUUUAAGCAACAAAGGUCUUUCUGAAGAUGAGAAGAACACAAAAUUACAGGAACUAGUGCUGAAGAAUCCAUCAGGUUCUGGGCCUCCACUUAGCAUAGAGGAUUUAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-356.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -384.27
Frequency: 0.0000
Diversity: 471.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((..((.(((((......((((......))))((.(((.......(((((((((((((((....((((.(((.............(((((.((((((.((((((...(((((..(((((...)))))......)))))....))..))))(((..(((....))).)))..((((.((((..(((((..(((((..(((.(((((((.(((((((.(((((((((...(((((.(((.(((.(((........................((((((..((...((((((..(((...((.(((((((((...))).)))))).(((((...........)))))....................(((.(((((.((((....))))))))).)))....))...)))..))))))..))..))))))((((....))))........(((((.(((((((..........(((.....)))....(((((((((((((.((.....)).))..)))))))))..))..............))))))))))))))))))))).))))))))))))))..(((((((((((..((.((...((.((..(((((((((......(((((((..((.....(((.......))).....)).(((((((((.....))))))))).....)))))))..))))))))).)).)).)).))..))))).))))))....((((.(((((....(((..(((((..((((.((((((........)))))).))))...)))))..)))))))).)))))))))))...))))))))))...)))))........))))))))).))))((((..((((((......))))))))))))))))...................((((((((((......(((((.((...(((((.....((((((....))))))......)))))...)).)))))......))))))))))..)))))))).))))....)))).((((((.(((.(((((((..(((((.....))))).))).)))).))).))))))....)))))))))))(((((.......)))))...(((((((.((..((((((((..........))))))))..))..........((((...(((.......)))...)))).....(((.((.(((((((......))))))).)).))))))))))))).))...))))).)).)))))))))(((((....(((..(((.............(((..((((..((((........))))...)))).)))...)))..)))...)))....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,{{{(({{(..,,,.{{|,,{{((((......))}|(((({{{((((((((((.((((({,,({...{((((..........))))}...{(....(((......)))...)).}}..))).))).)))))))}}},}),))},|,{{.,{{||(((,...,,},.}||{{||..((((.{{{,.{((({{..{((((..((((({{((((.((({{{{.{{{{{{{{|,,.||{|{.{{{.{{|,{{|||,.,,..................{{{{{{..{(,,.{{({((..(((,,.((.{{{{({{{|,,.})}.))))}}.(((((,,{,.....,.}}}||{...{(((..{(((.,,....,,,,)}}}...}}}}|||,|||,,,,.,,)},.,)),,,|||,,||||}}..}}..}}||}|((((....)))),,,||||.(((((.(((((((..........{((.....))),,..{{(((((((((((.((,...,)).))..)))))))))..}}.,......,,....))))))))))))..,))))}}.}}}}},|||||||}..(((({((((,{..{{,||,..{||,...|||||{((({{{{,,..,{{{{|.,,.,,,,,,{{,.{{{{{{{{{...||,(((((((((.....)))))))))..|||{|{{||||{}}|||||||.|||||.|}.||{.}||||,|}}}}}....((((.(((({...{(((..(((((..((((.((((((........)))))).))))...)))))..)))))))).))))}}))))).,.)))))}}|||,,,||}}}.,..,...}}}}}}}|}.}}}},,||.,|{((((......))))}}|,||{||||,....,,..}))))}...},},}))))}},,||||,{||}{{{{,,,{{{{......{{{{,{{{{,}||}}}},,,,....,},...,.(((({{{(((((((.((((((.{.,,{{,.{{{{{.{{|.|.,|.{(((((.{{|.|{((((({.(((((.....})}}}.}}}.}})}.})),))}))),})))))))}.,,.})))))))))))))..})))))),,},,.,,..{{{{{{{{....,,,,,.))))))),.})),,}||||.,,((((...(((.......)))...))))..}}})}}}}|.|||||,,..,,,,))}}})}}}}|||||,,..|||||,||},,,.....||......||||{((((.....,.}}}},..,......,,.|}|}},},.,}}))},,{{{|{|.,.,))))))))))))),.,,}}))}.,)})).})}}))
Back