Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECTD1_0007600
Sequence Length
1503 nt
GC Content
0.4371
AUUCUGAGACGCCCAUCCCUGCAACGUCGAGCUGGCUCCCGCUCUGAUGUAACGCAUCAUGCUGUUACCUCGCAGCUACCACAGGUACCUGCUGGAGCAGGGAGCCGACCUAUUGGGGAGCAGGAAGAAGAAGAGUACGAAACUAAAGGAGGACGCCGGAGAACAUGGGAUGAUGAUUAUGUGCUAAAGAGACAGUUUUCUGCAUUGGUUCCUGCUUUUGAUCCUAGACCUGGUCGUACUAAUGUCCAGCAGACAACUGAUCUAGAAAUACCACCCCCAGGGACCCCUCAUUCAGAGCUCUUGGAAGAAGUCGAAUGUACUCCGUCACCUCGAUUAGCUCUCACUUUGAAAGUAACAGGUCUUGGAACGACUCGUGAAGUUGAAUUACCACUCACCAAUUUCAGAUCAACCAUCUUUUACUAUGUACAAAAAUUGCUUCAAUUGUCCUGUAAUGGCAAUGUGAAAUCAGAUAAACUUAGGCGUAUUUGGGAGCCCACAUACACAAUCAUGUACAGAGAAAUGAAGGAUUCUGAUAAAGAAAAGGAAAAUGGAAAAAUGGGUUGCUGGUCUAUAGAGCAUGUGGAGCAGUACCUUGGCACUGAUGAAUUACCAAAGAAUGACUUGAUAACCUACCUGCAGAAGAAUGCAGACGCUGCUUUCCUGCGCCACUGGAAAUUAACUGGCACUAAUAAAAGUAUUAGGAAAAACAGAAAUUGUUCUCAGCUCAUAGCUGCAUAUAAGGAUUUUUGUGAGCAUGGAACAAAGUCUGGGUUAAACCAGGGGGCCAUUUCUACUCUUCAAAGUAGUGAUAUUCUUAAUUUAACAAAAGAACAACCUCAGGCCAAAGCAGGCAAUGGACAGAACUCUUGUGGAGUAGAAGAUGUCCUUCAGCUUCUGCGUAUUCUAUAUAUAGUUGCAAGUGACCCUUAUUCAAGAAUAUCCCAGGAAGAUGGUGAUGAACAGCCUCAGUUUACUUUUCCACCAGAUGAAUUCACUAGCAAAAAAAUUACAACAAAAAUAUUACAGCAGAUUGAGGAACCAUUGGCACUGGCAAGUGGGGCUCUGCCAGACUGGUGUGAACAAUUAACCAGCAAAUGUCCUUUUCUAAUACCAUUUGAAACUAGACAGCUUUAUUUCACAUGUACAGCAUUUGGCGCCUCAAGAGCAAUAGUAUGGUUACAGAACCGACGUGAAGCCACUGUGGAGCGAACGAGAACCACAAGCAGUGUUAGGCGAGAUGACCCUGGAGAGUUUCGAGUUGGUCGUCUCAAGCAUGAAAGAGUAAAAGUUCCACGUGGCGAGUCACUGAUGGAAUGGGCUGAGAAUGUCAUGCAAAUACAUGCAGAUCGGAAAUCAGUUCUUGAGGUUGAAUUUUUAGGAGAAGAAGGAACUGGCUUGGGACCCACAUUAGAGUUUUAUGCUCUGGUGGCAGCAGAAUUCCAGAGAACUGACUUGGGAGCUUGGCUUUGUGAUGAUAAUUUUCCAGAUGAUGAAUCUCGUCAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-406.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -436.06
Frequency: 0.0000
Diversity: 404.79
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((.((.....(((..(((((.((((((((((((((((((((((.((((((((...))).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))..(((..(((((((((((((.....((.(((.((((((...((......))..((.((((((........)))))).))........)))))).))).))..)))))))).......(((((.((((.(((....))).))))(((....))).))))).........))))))))..(((....((((..((((.((((..((((((.((........))..)))))).(((.(((...))).)))..((((((((((...((.((.((((((((.............))))))))))))..(((((((((.((.(((.((..((((.(((((.((.((.((((((((..(((((...(((((((..(....)..))))))).....)))))......)))).)))))).)).))))))))).))))).)).))))))...)))......((((.((((.((((((.....)))))).))))))))................)))).....)))))).........((((((((..(((((((.(((((......))((((.(........).)))).((((((....))))))......((((..(((((((..((((((((.(.(......).)...))))))))..)))))))..))))(((...))).(((((.((((((((((((.((((((..((...(((((..........)))))...((....(((......)))...)).))..))).))).))))))).))))).)))))))).))))))).)))).......(((.(((((.(.((((.(((.....(((((((......))).))))..(((((((((.......(((((.(((.(((.(((........................((((((..((...((((((..(((...((.(((((((((...))).)))))).(((((...........)))))....................(((.(((((.((((....))))))))).)))....))...)))..))))))..))..))))))((((....))))........(((((.(((((((..........(((.....)))....(((((((((((((.((.....)).))..)))))))))..))..............))))))))))))))))))))).))))).(((((((...((((.((((......)))))).))....))))))))))))))))...........))).))))...).))))).)))...(((((((((.....)))))))))...))))..))))))))..))))...))))))))))).)))))..))).....))))))((((((...)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((,((....{(((...((((.((((((((((((((((((((((.((((((({...})).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))..(({..{((((.({{(({,,,..,((((({.({,{((({.((((({{,,{..((.((((((........)))))}.}}...,.}.,.))))))),,.})}}))}}))))}}}..}}(((({.((((.(((....))).))))(((....))).))))).........))))))))..{{(....((((..((({,((({,.{((({,.,|,..||||..||||}|.||,{((.(({...})).))),,|||||{.|||}.,||}||,((((((((.......,.,..,}}}||||}||||..(((((((((.({.(((,((...,,{,{((((,((,{(({{{,,,||},||,||,,.,{{{{{,..,....}.{|||,|||....})),))}}.},.},,),))))}}}},.)))))}}||{|}},..})}},,}},...}}}......((({{((((.((((((.....)))))).)))))))}{{{...,.........))}|.,...,|||||.{,,..,,.{(({({{{..{{(((({.{{{{|,||||||}((((.{{,......,,}))).((((({....))))))......((((..(((((({,,((((((((.{.,......).,...)))))))).,)))))))..))))({{...,)),|((((,{(((((((((((.((((((..({...{((((..........))))}...{(....(((......)))...)).})..))).))).)))))))))),})})))})}}).})}))}}.}}}}..,..,,|||,|||||.|.{|||.|||..,..,{{((({,,,...))),}}}|..(({{((((({,,....(((((.(((.(({,(((,,......................((((((..((...((((((..(((...((.(((((({({...})).)))))).(((((,,,,.....,,))))),...((((..{(((.,,....,,,,)))}...)))}|||.|||,,,,.,,}},.,))...)))..))))))..))..))))))((((....))))...}}},.(((((.(((((((..........{((.....))),,..{{(((((((((((.((,...,)).))..)))))))))..}}.,......,,....)))))))))))),,})))))).))))).|||||||,..||||,((((......))))}},)}....))}})}}|))}))}}}..,,,,,.,,,))}.,))),,,),))))),))}|,,(((((((((.....)))))))))},.}},}..})))))))..))))...))))))))))).)))))}}),,...,,))))))((((((...)))))).
Back