Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECTD1_0007800
Sequence Length
1453 nt
GC Content
0.4329
AUUCUGAGACGCCCAUCCCUGCAACGUCGAGCUGGCUCCCGCUCUGAUGUAACGCAUCAUGCUGUUACCUCGCAGCUACCACAGGUACCUGCUGGAGCAGGGAGCCGACCUAUUGGGGAGCAGGAAGAAGAAGAGUACGAAACUAAAGGAGGACGCCGGAGAACAUGGGAUGAUGAUUAUGUGCUAAAGAGACAGUUUUCUGCAUUGGUUCCUGCUUUUGAUCCUAGACCUGGUCGUACUAAUGUCCAGCAGACAACUGAUCUAGAAAUACCACCCCCAGGGACCCCUCAUUCAGAGCUCUUGGAAGAAGUCGAAUGUACUCCGUCACCUCGAUUAGCUCUCACUUUGAAAGUAACAGGUCUUGGAACGACUCGUGAAGUUGAAUUACCACUCACCAAUUUCAGAUCAACCAUCUUUUACUAUGUACAAAAAUUGCUUCAAUUGUCCUGUAAUGGCAAUGUGAAAUCAGAUAAACUUAGGCGUAUUUGGGAGCCCACAUACACAAUCAUGUACAGAGAAAUGAAGGAUUCUGAUAAAGAAAAGGAAAAUGGAAAAAUGGGUUGCUGGUCUAUAGAGCAUGUGGAGCAGUACCUUGGCACUGAUGAAUUACCAAAGAAUGACUUGAUAACCUACCUGCAGAAGAAUGCAGACGCUGCUUUCCUGCGCCACUGGAAAUUAACUGGCACUAAUAAAAGUAUUAGGAAAAACAGAAAUUGUUCUCAGCUCAUAGCUGCAUAUAAGGAUUUUUGUGAGCAUGGAACAAAGUCUGGGUUAAACCAGGGGGCCAUUUCUACUCUUCAAAGUAGUGAUAUUCUUAAUUUAACAAAAGAACAACCUCAGGCCAAAGCAGGCAAUGGACAGAACUCUUGUGGAGUAGAAGAUGUCCUUCAGCUUCUGCGUAUUCUAUAUAUAGUUGCAAGUGACCCUUAUUCAAGAAUAUCCCAGGAAGAUGGUGAUGAACAGCCUCAGUUUACUUUUCCACCAGAUGAAUUCACUAGCAAAAAAAUUACAACAAAAAUAUUACAGCAGAUUGAGGAACCAUUGGCACUGGCAAGUGGGGCUCUGCCAGACUGGUGUGAACAAUUAACCAGCAAAUGUCCUUUUCUAAUACCAUUUGAAACUAGACAGCUUUAUUUCACAUGUACAGCAUUUGGCGCCUCAAGAGCAAUAGUAUGGUUACAGAACCGACGUGAAGCCACUGUGGAGCGAACGAGAACCACAAGCAGUGUUAGGCGAGAUGACCCUGGAGAGUUUCGAGUUGGUCGUCUCAAGCAUGAAAGAGUAAAAGUUCCACGUGGCGAGUCACUGAUGGAAUGGGCUGAGAAUGUCAUGCAAAUACAUGCAGAUCGGAAAUCAGUUCUUGAGGUAAUCUCAUAUAAAAUUAGAUUUAGGGAACAGGAAUGACACUUAGGGAACCAGCCCAAUGUGUAUCUUCACUGCAUUAAAAACUGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-381.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -410.21
Frequency: 0.0000
Diversity: 342.05
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((.......(((((..(.((((..(((((((((((((((.((((((((...))).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))).....)))).).))))).......(((((..((..((((..((((....(((((.((((.((((((.(.....((((..((((.....))))..)))).((((((((....((...(((((.((((.(((....))).))))(((....))).)))))......))....))))))))).)))))).((..(((....)))..))..)))).)))))...))))..)))).))..)))))...........)))))))))(((((.....))))).......((((((((.((((..((((...((((((((((.((((((...((((.((((((((.((......)))))).)))).................((((.(((....))).)))).))))..)))))).))...))))))))..)))).........)))).))).....)))))(((((.((((((.....)))))).)))))((((((..(((((((((((((.(((..(.(((((.((((.((..((.((((..(((((((.(((((......))((((.(........).)))).((((((....))))))......((((..(((((((..((((((((.(.(......).)...))))))))..)))))))..))))(((...))).(((((.((((((((((((.((((((..((...(((((..........)))))...((....(((......)))...)).))..))).))).))))))).))))).)))))))).))))))).)))).))..))))))))))).)..)))..((((((((((((((......))).)))..(((..(((((((((...(((((.(((.(((.(((........................((((((..((...((((((..(((...((.(((((((((...))).)))))).(((((...........)))))....................(((.(((((.((((....))))))))).)))....))...)))..))))))..))..))))))((((....))))........(((((.(((((((..........(((.....)))....(((((((((((((.((.....)).))..)))))))))..))..............))))))))))))))))))))).))))))))))))))..)))..((((......))))(((.....))).)))))))))))))).))).......))))..))))))..((((((..((((...(((......)))...))))...))).)))(((........)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((((.,,....(((((..(.((((,.(((((((((((((((.((((((({...})).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))).....))))},.))))).......(((({..{,..((((..((((..{.(((((.((((.,(((.........{{((...{(({,,,,||}|||||,,.((((((((....,{,,.({{{{.{(((.(((....))).))))|||....))).)))))......,,....}})))}}}.,|{,|||.||,.{||,,,.,}}.}))..)))).))))).,.))))..)))),))}.}}}}}....,.....,}}})))}}}.{{{{,,((((((((............,}}}))))}}|||..(((((((((.((.(((,((...,,{,{((((,((,{(({{{,,,||,,||{||,..,{{{{{,..{....}.{|||,|||....})),)),}.},.},,),))))}}}}}.)))))}}}|,|}}},.}),}}}}},...}}}......{(({{((((.((((((.....)))))).)))))))|,{{..,{,{{{{{(((({.{((..(.(((((.((({,((..((.((((..(((((((.((((,,,,,,,|,((((.,,.......,,)))).((((({....)))))),.,...((((..(((((({,,((((((((.{.,......).,...)))))))).,)))))))..))))(({...})).{((((,{{((((((((((.((((((..((...{((((..........))))}...{(....(((......)))...)).))..))).))).)))))))))),})})))})))).))))))).)))).}}..))))))))))).}..}}}..{{{{{{{{{{((((......))).))|{.{((..(((((((({...(((((.(((.(({.(((,,......................((((((..((...((((((..(((...((.(((((({({...})).)))))).(((((.,,,.....,.))))),...((({..{{({.,,....,,,,)}}}...)))}|||,|||,,,,.,,)},.,))...)))..))))))..))..))))))((((....))))...}}},.(((((.(((((((..........{((.....))),,..{{(((((((((((.((,...,)).))..)))))))))..}}.,......,,....))))))))))))}}})))))).))))))))))))))..)))},{(((......))))|{|.....}}}.)))))))})))}}},}}},......,,}},,}|}}}}..((((({..((((.,.(((......))).,.))))...))).))),,,........))}
Back