Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_HECTD1_0012600

Sequence Length

2486 nt

GC Content

0.4513

GUCAACUGCAACUUGGCCUCUUGAUCCACCAAAGGAUGAGAAACAAGGGUGGAGACAUGUGAGAAUUAAACAGAUGGGGAAAAAUGCCAGUGGACAAACACACUACCUCUCAUUAUCUGGAUUCGAACUUUAUGGCACUGUAAAUGGAGUAUGUGAAGAUCAGCUAGGGAAAGCAGCUAAAGAAGCAGAAGCUAAUCUUAGACGGCAGAGACGUCUAGUACGUUCCCAGGUUCUGAAAUACAUGGUUCCAGGAGCUCGUGUUAUCAGAGGCCUGGAUUGGAAAUGGCGAGAUCAGGAUGGCAGCCCACAGGGAGAAGGCACUGUCACAGGAGAACUACACAAUGGCUGGAUUGAUGUCACCUGGGAUGCUGGUGGCUCAAACUCUUACCGUAUGGGCGCAGAAGGAAAAUUUGACCUCAAGCUUGCACCAGGGUACGACCCUGAUACAGUGGCAUCACCCAAACCUGUUUCAUCCACUGUUUCAGGCACAACGCAAUCAUGGAGCAGCUUGGUGAAAAACAACUGUCCAGACAAGACAUCUGCUGCUGCAGGCUCCUCAAGUAGAAAAGGAAGCAGCAGUUCUGUGUGUAGCGUGGCCAGUAGCAGCGACAUCAGCUUGGGUUCGACCAAAACGGAACGGAGAUCAGAAAUUGUAAUGGAACACAGUAUAGUUUCAGGAGCUGAUGUCCAUGAACCAAUUGUUGUUCUUUCAUCUGCUGAAAACGUCCCUCAAACAGAAGUAGGGUCAUCUUCCAGUGCAAGCACCAGCACCUUAACAGCGGAAACGGGAAGUGAAAAUGCUGAAAGGAAGUUAGGCCCUGAUAGUUCUGUUCGUACUCCUGGGGAGUCUAGUGCAAUAUCCAUGGGAAUUGUCAGUGUUAGUUCUCCUGAUGUUAGUUCAGUAUCUGAAUUAACUAAUAAAGAAGCAGCUUCACAACGACCUCUUAGCUCUUCAGCAAGUAACAGACUGUCAGUGAGUUCUUUGUUGGCUGCUGGGGCCCCUAUGAGCUCUAGUGCAAGUGUACCUAACCUGUCCUCAAGAGAAACAUCUAGCUUGGAGAGUUUUGUAAGGAGAGUGGCAAACAUAGCACGGACUAAUGCCACGAACAACAUGAAUCUAAGCCGAAGCAGCAGUGAUAACAACACUAAUACUUUGGGGAGGAAUGUGAUGAGCACAGCAACUUCUCCUCUUAUGGGUGCUCAGAGUUUCCCUAAUUUGACCACACCUGGUACUACAUCAACAGUGACUAUGUCAACAUCCAGUGUUACUAGCAGCAGCAAUGUAGCUACAGCAACAACAGUUUUAUCAGUUGGUCAAUCUUUAAGUAACACUUUAACCACCAGCCUCACAUCAACUUCCAGUGAGAGUGACACAGGUCAGGAAGCAGAAUAUUCCUUAUAUGAUUUCCUUGAUAGCUGCCGUGCCAGUACUCUAUUGGCUGAGCUCGAUGAUGAUGAGGACUUACCUGAGCCAGAUGAAGAAGAUGAUGAGAAUGAAGAUGACAAUCAGGAGGACCAAGAAUACGAGGAGGUUAUGAUUCUGAGACGCCCAUCCCUGCAACGUCGAGCUGGCUCCCGCUCUGAUGUAACGCAUCAUGCUGUUACCUCGCAGCUACCACAGGUACCUGCUGGAGCAGGGAGCCGACCUAUUGGGGAGCAGGAAGAAGAAGAGUACGAAACUAAAGGAGGACGCCGGAGAACAUGGGAUGAUGAUUAUGUGCUAAAGAGACAGUUUUCUGCAUUGGUUCCUGCUUUUGAUCCUAGACCUGGUCGUACUAAUGUCCAGCAGACAACUGAUCUAGAAAUACCACCCCCAGGGACCCCUCAUUCAGAGCUCUUGGAAGAAGUCGAAUGUACUCCGUCACCUCGAUUAGCUCUCACUUUGAAAGUAACAGGUCUUGGAACGACUCGUGAAGUUGAAUUACCACUCACCAAUUUCAGAUCAACCAUCUUUUACUAUGUACAAAAAUUGCUUCAAUUGUCCUGUAAUGGCAAUGUGAAAUCAGAUAAACUUAGGCGUAUUUGGGAGCCCACAUACACAAUCAUGUACAGAGAAAUGAAGGAUUCUGAUAAAGAAAAGGAAAAUGGAAAAAUGGGUUGCUGGUCUAUAGAGCAUGUGGAGCAGUACCUUGGCACUGAUGAAUUACCAAAGAAUGACUUGAUAACCUACCUGCAGAAGAAUGCAGACGCUGCUUUCCUGCGCCACUGGAAAUUAACUGGCACUAAUAAAAGUAUUAGGAAAAACAGAAAUUGUUCUCAGCUCAUAGCUGCAUAUAAGGAUUUUUGUGAGCAUGGAACAAAGUCUGGGUUAAACCAGGGGGCCAUUUCUACUCUUCAAAGUAGUGAUAUUCUUAAUUUAACAAAAGAACAACCUCAGGCCAAAGCAGGCAAUGGACAGAACUCUUGUGGAGUAGAAGAUGUCCUUCAGCUUCUGCGUAUUCUAUAUAUAGUUGCAAGUGACCCUUAUUCAAGAAUAUCCCAGGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-721.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -770.13

Frequency: 0.0000

Diversity: 554.06

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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