Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECTD1_0015300
Sequence Length
853 nt
GC Content
0.4572
CUUCUCCUCUUAUGGGUGCUCAGAGUUUCCCUAAUUUGACCACACCUGGUACUACAUCAACAGUGACUAUGUCAACAUCCAGUGUUACUAGCAGCAGCAAUGUAGCUACAGCAACAACAGUUUUAUCAGUUGGUCAAUCUUUAAGUAACACUUUAACCACCAGCCUCACAUCAACUUCCAGUGAGAGUGACACAGGUCAGGAAGCAGAAUAUUCCUUAUAUGAUUUCCUUGAUAGCUGCCGUGCCAGUACUCUAUUGGCUGAGCUCGAUGAUGAUGAGGACUUACCUGAGCCAGAUGAAGAAGAUGAUGAGAAUGAAGAUGACAAUCAGGAGGACCAAGAAUACGAGGAGAUUCUGAGACGCCCAUCCCUGCAACGUCGAGCUGGCUCCCGCUCUGAUGUAACGCAUCAUGCUGUUACCUCGCAGCUACCACAGGUACCUGCUGGAGCAGGGAGCCGACCUAUUGGGGAGCAGGAAGAAGAAGAGUACGAAACUAAAGGAGGACGCCGGAGAACAUGGGAUGAUGAUUAUGUGCUAAAGAGACAGUUUUCUGCAUUGGUUCCUGCUUUUGAUCCUAGACCUGGUCGUACUAAUGUCCAGCAGACAACUGAUCUAGAAAUACCACCCCCAGGGACCCCUCAUUCAGAGCUCUUGGAAGAAGUCGAAUGUACUCCGUCACCUCGAUUAGCUCUCACUUUGAAAGUAACAGGUCUUGGAACGACUCGUGAAGUUGAAUUACCACUCACCAAUUUCAGAUCAACCAUCUUUUACUAUGUACAAAAAUUGCUUCAAUUGUCCUGUAAUGGCAAUGUGAAAUCAGAUAAACUUAGGCGUAUUUGGGAGCCCACAUACAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-224.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -241.53
Frequency: 0.0000
Diversity: 187.98
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((.((((((((((((((((((((((((..((((..((...((((((....((((.....((((...))))......(((((((((.((.(.(((......))).).))..((((.(......).))))...........)))))))))........((..((((((((..((((..(((.......))).((((((((((........(((((((......((.((((..(((.....(((((((...)))))))..))))))).))..)))))))))).))))).))....))))..)))).))))..))..))))...)))))).)).....))))..).)))))))))))).))))))).(((((..(.((((..(((((((((((((((.((((((((...))).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))).....)))).).))))))))).))(((((..((..((((..((((....(((((.((((.((((((.(.....((((..((((.....))))..)))).((((((((....((...(((((.((((.(((....))).))))(((....))).)))))......))....))))))))).)))))).((..(((....)))..))..)))).)))))...))))..)))).))..)))))...(((((.(((...(((...((.((.((((((((.............))))))))))))..)))))).)))))...............((((((((.((......)))))).)))).............))(.((((.(((....))).)))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,{(,.((((((((((((((((((((((((..,((({.{(...((((((....((((...,{((((..,|}},.,...,|{{|||||{,((.(,({{..,,,.))).,.}}..({,{.|......,.)})),,........,|||}}})))........{{..((((((((..((((..(((.......))).((((((((((........(((((((.,..,,{{.((({.,(((.....(((((((...))))))).,))))))).)),.)))))))))).))))).))....))))..)))).))))..))..))))...)))))).)}..,,,)},)..).)))))))))))).))))))).(((((..(.((((,.(((((((((((((((.((((((({...})).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))).....)))),,.))))),,}},)}|||{{..{,..((((..((((..{.(((((.((((.,(((.........{{((..,{(({,,,,||}|||||,,.((((((((....,{,,.{{{{{.{(((.(((....))).))))|||....))).)))))......,,....}})))}}}.,|{,|||.||,.{||,,,.,}}.}))..)))).))))).,.))))..)))).}}|,|},|||,.(((((.(((,..{((...((.((.((((((((.............))))))))))))..)))))).)))))..,,,,......||.{(({((((.({......)))))).)))}...,.........))(.((((.(((....))).)))).)
Back