Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECTD1_0016400
Sequence Length
636 nt
GC Content
0.4701
CUUCUCCUCUUAUGGGUGCUCAGAGUUUCCCUAAUUUGACCACACCUGGUACUACAUCAACAGUGACUAUGUCAACAUCCAGUGUUACUAGCAGCAGCAAUGUAGCUACAGCAACAACAGUUUUAUCAGUUGGUCAAUCUUUAAGUAACACUUUAACCACCAGCCUCACAUCAACUUCCAGUGAGAGUGACACAGGUCAGGAAGCAGAAUAUUCCUUAUAUGAUUUCCUUGAUAGCUGCCGUGCCAGUACUCUAUUGGCUGAGCUCGAUGAUGAUGAGGACUUACCUGAGCCAGAUGAAGAAGAUGAUGAGAAUGAAGAUGACAAUCAGGAGGACCAAGAAUACGAGGAGGUUAUGAUUCUGAGACGCCCAUCCCUGCAACGUCGAGCUGGCUCCCGCUCUGAUGUAACGCAUCAUGCUGUUACCUCGCAGCUACCACAGGUACCUGCUGGAGCAGGGAGCCGACCUAUUGGGGAGCAGGAAGAAGAAGAGUACGAAACUAAAGGAGGACGCCGGAGAACAUGGGAUGAUGAUUAUGUGCUAAAGAGACAGUUUUCUGCAUUGGUUCCUGCUUUUGAUCCUAGACCUGGUCGUACUAAUGUCCAGCAGACAACUGAUCUAGAAAUACCACCCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-172.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -183.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 155.81
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((...((((((((((((((((.........((((((...((((((..((......((((((..((........))..)))))).((.(.(((......))).).)).......))..)))))).))))))((((((..(((...(((...((.((...((((((((..((((..(((.......))).((((((((((........(((((((......((.((((..(((.....(((((((...)))))))..))))))).))..)))))))))).))))).))....))))..)))).))))......(((....))).)).))...)))..)))..))))))...))))))))).))))))).(((((..(.((((..(((((((((((((((.((((((((...))).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))).....)))).).))))).........(((.....)))..))))))).)(.((((.((((((........)))))).))....((((((((.(((((..(((..........(((((........))))).........)))))))).))))).))).............)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((((((,,.((((((((((((((((.,{{,..,((({((,..{((((({..,(,,,...{(((((..{(,,......}},,||||||,((.(,({{..,},.))).,.}}..{,...}}..}}}}})}))}}},,...,.,{{|,..})),.......{{..((((((((..((((..{({.......}}}.({((((((((........(((((((,,.,{,{{.(((,.,(((..,..(((((((...))))))),}))))})).}),.)))))))))).))))}.))....))))..)))).))))..}}..|||,...)))}}).}}.}}..,..,.,,}))})),,,.))))))))).))))))).(((((..(.((((,.(((((((((((((((.((((((({...})).))))).))((((.((((...)))).)))).))))).)))))))).....)))),,.))))).........{({.....})}..}}})))}.}{.||||,|{{(((,.......}}}}}|.}|...,({{(((((.(((((..,((,,........,{{,{,......,||,||,....,,}.)))))))).))))).)))........,...,)),}
Back