Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECTD1_0017900
Sequence Length
1434 nt
GC Content
0.3898
GUAAUAUCUUCAUGUUUAUCUUCCCUACCAUAUGUAUAUUUUUCCCUUUUAUAGUAAAGCACCAACCUAAAUGCCUACAAAAAUGUGCAGUGUGGAAGGGGUGAGAGGAGGGAGCUACCAAACAGUUACACAAAGAAACUUCCCCUACUGGUUGGGUUUCAUAUUCUAUAUAGAAUCCAUGAUUGCUGUGACAUAAUGCAUGCAGGAGUUUAAUGCUUGAAACCCCUUUACGUUGCUUUGGGUAAUAGUAAACAUACAUUAAAAUGGUUAAUAUAUGGUAUCUAAGAUUUGUAGUUUUAGUAGUAGUAGAAGUGGUAGUAGAUGCAGCAGUAGUAGUUUAUUAAUAGCUAACGCUUAAUGAUCACUAACUAAGUGCUAGAGUUGUUUUUGUUUUUGAGACAGGAUUUCGCUUCAUUGCCCAGGCUGUUCUUGAACUCUUGGGCUCAAGCAAUCUGCCUGCCUUGGCAUGAGCCACUGUGCCUUGCCAGCAUAGUUCUUAAUACUUUAUGUAUAUUAACUAAUUCUUUCCAACAAAACAACCUUUUUAGGGUUAUUGUUAGCCCUAAUUUUCAGAUGAAGUAAUUGCUAAAAGUCAUACAUGUAAUAGUAGUUUUGGUUCCAGGAUGCAAACCCAAACAUUCUGAAACCAGAGCUGUCAAAUGUCAGUUUGUUUCAGUUAAGUGUUUAAACCAAACUGUGGAUGUGCACGUGUGUACUUACAUGCUGUCUGCCUCAUAGUAAUUUAAAGCAACUCCCCAGCAUUUUAUUUGGUAUAUAAGUAAUUCAGUACAAAAUGUAAUUUACGUUUUAAAAACCAACUUAUUUUAAAAUAAUUAUAGGUUCAUAGGAGGUUGCGAAAAUACUCCAGAGAGGUCUUAUGUGCCCUUUACCUAAUUUUUGCCAUUGGCUAGUUUCAUAUUACCUAAUUUUAGUAUAGUAACAAAGCCAGGAAAUUGAGGAUGUUUGUGAAUGGUUAUCUUUUUAUUUUUUUUGAGACAGAGCCUCACUCUGUCUCCCGGGGUGGAGUACAGAGUGUAGUGGCACGAUCUCGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCCAGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGAUUACAGGCGCCUGCCACUAUGCCCAGCUAAUUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGACCUUGUGAUUCGCCUGCCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCUUCAGCCACCAUGUCUGGCCAUGAAUGGUUAUCAUUUGGUGAAAUGUGUAGAUUUGUAUAACCAUCACUGAUGCAACUUACUUUGGGUAAACUGAAAUGAUGAAGAAAUGUAUGUAUCUAUACAUGUUUAGGUUAGCUCAUUUUGGGUUUAAGAAAUAUGGCUAAGGAAAUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-387.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -415.52
Frequency: 0.0000
Diversity: 397.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((.(((((((.....((.(((((.((((((((((((((((..........(((..(((..........))).)))))))))))))).))))).))))).)).(((((((.((((((.(((.(((.((((((.(..(((......((((((((((((((.....(((.((((.(((.((..(((...........)))..))))).)))))))..))))))))..((((..((((((((((((((..((((.((......((((((........((((.((((((((...))))))))...((((...((((((.........(((..((((.(((....))).))))..))).....)))))).))))((((((.((((((((((((((((((.((.((((((..((((....(((((((..(((....))).)))))))..))))....((((......))))((((..(((((((.......))))))).))))((((.....)))).......)))))).))))..))))))......(((((((((....))))))))).((((....)))).((((((((..((.(((((((((((...(((((((((((.(((((((..........))))))).))))))))))).(((((....)))))...(((((..((......))..))))).....(((((....)))))))))))).))..)).))..)))))))).))))))))))...))))))......((((((((((...(((.....((((((((...)))))))).......(((((((..(......)..)))))))....((((..(......)..))))...)))..))))))))))...))))........))))))...))))))..))))))))))....))))..))))...))))))......)))..).))))))))).))).................(((((((((.....)))))))))..(((((((((.......(((((((((.((....)))).)))))))..)))))))))...)))...)))..)))))))...((((...((((((((((((((..((..(((....)))..))..)))))))).....(((((((...(((...(((((.((((((((....(((((((((((((.........((((.((((((((........((((((((.....)).))))))))))))))..))))..)))).))))))))).(((((.....))))))))))))).((((......)))).))))))))))))))).....))))))....))))....))))))).))...(((((((...(((((((.....((((((...))))))....))))))).....)))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...{{.(((((((,{{{.((,{((((.((((((((((((((((..........(({..(({..........})).)))))))))))))).))))).))))}.}},|{{{(({.{{{,||.,,{,(((,({(({,{({{(((,.{{..{{||,{|||||||{,{{{{{...,}))}|{{,||..{((,||,.......}}}.(((((((..,..{(((((|||{{,..((((.,((((((((((((((..((((.,,.,....,{((((.||..,..((((.((((((({...|)))))))...,,,{,,,{{{{{{{,|,{{|||{{{{,(((({((({{{{{,.{||,,..)))}}})}),}))),}))|{(((((.(((((((((((((({{((,((,(((({,..((((....(((((((..(((....})).)))))))..))))..,.{{||,,....|||}{{||,.{((((((.......))))))}.,,|,((((.....)))).......}}}))).}},},.}))))},.....(((((((((....))))))))).,{{{....))}},{(({(({{..((,{({(((((({,..,(((((((((((.(((((((..........))))))).))))))))))).|,.,,..{{|||||{{,{({,,..,|.....,)},}))))).,,,,{{{{|.|||})}))})})))),})}.)).)),,))))))),.})))))))))...)))))),.....((((((((((...(((.....((((((((...)))))))).......{((((((..,......}..)))))))....((((..(......)..))))...))}..))))))))))...))))..,,.,}.))))))|,,|.)))}..))))))))))....))))..))))...}}}}||{{{{,.|||{{{{,||,,,,,,,}.)}}}}}}..}}}}},...(((((((((.....)))))))))..(((((((((......,(((((((((.((....)))).))))))).,)))))))))...)))))))))}.,,))))))),{{||...{|{{{|((((((((..((..(((....)))..))..)))))))).....,{{({{,..||||,,.{{{||.{{(((((({...((((((((({(((,..{.....,.||,|..{{{{,..(((((.((((((((.....)).))))))....))))).}}}}..))}}.))))))))).,{||||...,}}}}})))))))}.{(((......)))}.}}}))})))))))}}..,,}}}})))}},.)))},,..))))))).}}...((({(((,..(((((((.....((((({...})))))....)))))))..,..)),.,))))
Back