Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECTD1_0018000
Sequence Length
250 nt
GC Content
0.4080
GAGAAUCUCUUUAACCCGGGAGGUGUAGGUUACAGUGAGCCAAGAUUGUGCCAUUGCACUCCAGCCUGGGUGACAGAGCGAGACUCCAUCUCAAAAAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNUCUUUUUAUUUUUUUUGAGACAGAGCCUCACUCUGUCUCCCGGGGUGGAGUACAGAGUGUAGUGGCACGAUCUCGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-117.19 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -119.12
Frequency: 0.0434
Diversity: 8.66
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..((.....))..)(.((((((((.(((((.(((((((((.(((((((((((((((((((((.((((((.(((((((.(((.(((..((((((((((((..........................................................))))))))))))..))).))).))))))).)))))).)))).......))))))))))))))))).))))))))).))))).)))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.,(,....,}}..)(.((((((((.(((((.(((((((((.(((((((((((((((((((((.((((((.(((((((.(((.(((..((((((((((({..........................................................})))))))))))..))).))).))))))).)))))).)))),......})))))))))))))))).))))))))).))))).)))))))).)
Back