Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_HECTD1_0019200

Sequence Length

356 nt

GC Content

0.4354

CUUCUCCUCUUAUGGGUGCUCAGAGUUUCCCUAAUUUGACCACACCUGGUACUACAUCAACAGUGACUAUGUCAACAUCCAGUGUUACUAGCAGCAGCAAUGUAGCUACAGCAACAACAGUUUUAUCAGUUGGUCAAUCUUUAAGUAACACUUUAACCACCAGCCUCACAUCAACUUCCAGUGAGAGUGACACAGGUCAGGAAGCAGAAUAUUCCUUAUAUGAUUUCCUUGAUAGCUGCCGUGCCAGUACUCUAUUGGCUGAGCUCGAUGAUGAUGAGGACUUACCUGAGCCAGAUGAAGAAGAUGAUGAGAAUGAAGAUGACAAUCAGGAGGACCAAGAAUACGAGGAGGUUAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-79.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -86.18

Frequency: 0.0000

Diversity: 61.15

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((((((.(((.(((.(((...(((........(((((((...((((((..((......((((((..((........))..)))))).((.(.(((......))).).)).......))..)))))).))))))).........)))...........((..((((((((..((((..(((.......))).((((((((((........(((((((......((.((((..(((.....(((((((...)))))))..))))))).))..)))))))))).))))).))....))))..)))).))))..))..(((....)))..))).)))....))).))))))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

..(((((((.({,.(((.(((,{{({.....,,,.(((((((...((((((..((......((((((..((........))..)))))).((.{,({{..,}}.)))...}}.......))..)))))).)))))))...,,,,|....}))},......((..((((((((..((((..(((.......))).((((((((((........(((((((.,..,.{{.((({.,(((.....(((((((...))))))).,))))))).)),.)))))))))).))))).))....))))..)))).))))..))..(((....)))..))).)))....,}}.))))))).....