Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECTD1_0019800
Sequence Length
452 nt
GC Content
0.4004
CUUCUCCUCUUAUGGGUGCUCAGAGUUUCCCUAAUUUGACCACACCUGGUACUACAUCAACAGUGACUAUGUCAACAUCCAGUGUUACUAGCAGCAGCAAUGUAGCUACAGCAACAACAGUUUUAUCAGUUGGUCAAUCUUUAAGUAACACUUUAACCACCAGCCUCACAUCAACUUCCAGUGAGAGUGACACAGGUCAGGAAGCAGAAUAUUCCUUAUAUGGUAAGUUGUAAUUUAAAAUGAAAGUAUUUAGAUACUUUCAUAAUGAUGCUUUUAUUAUGUUUUCUCCUGAUAUUUUAAACUUUUGUUUAAAGAGAAUUAUUCUCUCUUCUUAUAAAUAUGAAAUCUUCGGGCCAGGCACAGUAGCUCACACCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGCAGGUGGAUCAGUUGAGGUCAGGAGUUCGAGACCAGCCUGACCAACAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-109.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -117.77
Frequency: 0.0000
Diversity: 103.10
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((((((.((((((((((.((.........(((((((...((((((..((......((((((..((........))..)))))).((.(.(((......))).).)).......))..)))))).)))))))..(((((((.((((((..((((...(((((((...........))))).))(((....)))(((((........)))))....))))))).))).)))))))((((((((((....))))))))))..(((.(((...(((.(((((...(((((.((((((....(((((...((((((.......))))))...)))))..))))))..)))))..))))).))))))))).))))).......))))))))))))))..))))((.((((.((((....((((..(....)..))))...)))))).)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.(((((((.(((((((.,({,,.........(((((((...((((((..((......((((((..((........))..)))))).((.{,({{..,}}.)))...}}.......))..)))))).)))))))..{((((((.((({({..{(((.,.{{(((((...........))))).}}{({....))}(((((........)))))....})))})).})).))))))}((((((((((....))))))))))..{((.{{,.,}|||,|{{{{...(((((.{{((((.,..{{(({..,{(((((.......)))))}...}}))}..}))))}..)))))..}}|}}.}},}))}},..,}})...,}..))))))})))))))..))))((,{(((.((((.,..((((..(....)..)))).,.))))))}.).))
Back