Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECTD1_0024400
Sequence Length
493 nt
GC Content
0.4300
GUCAACUGCAACUUGGCCUCUUGAUCCACCAAAGGAUGAGAAACAAGGGUGGAGACAUGUGAGAAUUAAACAGAUGGGGAAAAAUGCCAGUGGACAAACACACUACCUCUCAUUAUCUGGAUUCGAACUUUAUGGCACUGUAAAUGGAGUAUGUGAAGAUCAGCUAGGGAAAGCAGCUAAAGAAGCAGAAGCUAAUCUUAGACGGCAGAGACGUCUAGUACGUUCCCAGGUUCUGAAAUACAUGGUUCCAGGAGCUCGUGUUAUCAGAGGCCUGGAUUGGAAAUGGCGAGAUCAGGAUGGCAGCCCACAGGGAGAAGGCACUGUCACAGGAGAACUACACAAUGAAGAGAUAGUUAAAUGUUGGUUCUUCAGAGAUUAUUUCAGCAUACAGAAAAAAAUAGAGGCAAUUGAAAAAUCUCAUCUAAGCUACUUAUGUAGAUUUGGGGCAGUCACUUUUCCUUUCAAAGAACACAUAUGCAGAUAAUCCCCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-125.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -134.95
Frequency: 0.0000
Diversity: 65.52
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(....(((((.....((((((((((((.(((...(((((((......(((((...(((.((.........)).)))((........)).(((......))).))))))))))))..........((.(((((((..(((........))).))))))).))((((.(......))))).....(((....)))....(((((((.......))))))).......(((((((((((...(((((((((...)))).)))))..))))).))))))........))).).)))))))).))).......(((((((((..((((((...(((((((((.(((.(((........)))..)))))))))))).((((((.(((((((..................))...)))))))))))..(((((((((....)))).)))))))))))..)))))))))..............))))).....)(.....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,...(((((...{,((((((((((((.(((...(((((({.....,(((((...(((.((.........)).)))((........)).(((......))).)))))))))))).,{{{{.,,.((.(((((((..(((......,.))).))))))).))|{||,|....,,},|||...,.|||....)))..,}|((((((.......)))))),...,.{,(((((((((((...(((((((((...)))).)))))..)))))}})))))...,....))).).)))))))).))).......{((((((((..((((((...(((((((((.(((.{.{........}}...)))))))))))).((((((.(((((({..................}}...)))))))))))..(((((((((....)))).)))))))))))..))))))))}..............)))))...,,|{.....)
Back