Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECTD1_0025900
Sequence Length
1303 nt
GC Content
0.3991
UGUAUUGAGAGUGAGAACACUUGGAGAGAUUUAAUGAAGACAGCUUUAGAAAACCUAAUUGUACUUUUGAAGGAUGAAAACACAAUUUCACCAUAUGAAAUGUGUAGCAGUGGCUUGGUACAAGCACUUCUUACUGUGUUAAACAAUGUAAGUUUAUCAAGUAGUAAAGAAAAAAAUACAGUUUUAAAAAUUAUUUCAACUGGUAGAAAGAAUGUUUUUAAAACUGCCUUUAGUGAAAAUGAAGAUGAUGAAAGUCGACCAGCAGUUGCGUUAAUUCGAAAGUUAAUAGCUGUACUAGAAUCUAUUGAACGUCUACCUCUCCAUUUGUAUGAUACACCAGGAUCCACAUAUAACCUCCAGAUACUUACAAGGAGAUUACGAUUUCGGUUGGAACGUGCACCUGGUGAAACUGCAUUGAUUGACAGGACUGGCAGAAUGUUGAAGAUGGAACCUUUGGCUACAGUUGAAUCUCUGGAACAGUACCUUUUGAAAAUGGUAGCAAAACAGUGGUAUGAUUUUGACCGAUCUUCAUUUGUUUUUGUUCGAAAAUUAAGAGAAGGACAAAAUUUUAUAUUUCGGCACCAGCAUGAUUUUGAUGAAAAUGGAAUCAUUUACUGGAUUGGAACAAAUGCAAAAACUGCUUAUGAAUGGGUAAAUCCAGCUGCCUAUGGACUUGUAGUAGUAACGUCAUCAGAAGGAAGAAAUCUACCUUAUGGCCGCUUAGAAGACAUACUAAGUCGUGAUAAUUCAGCUUUAAAUUGUCAUAGCAAUGAUGAUAAGAAUGCCUGGUUUGCCAUAGAUCUGGGUCUCUGGGUGAUACCAUCAGCAUAUACACUUCGUCAUGCUCGUGGUUAUGGAAGGUCUGCACUGAGAAAUUGGGUUUUCCAGGUAUCCAAAGAUGGACAGAACUGGACUUCUUUGUAUACCCAUGUUGAUGACUGCAGUCUCAAUGAACCAGGGUCAACUGCAACUUGGCCUCUUGAUCCACCAAAGGAUGAGAAACAAGGGUGGAGACAUGUGAGAAUUAAACAGAUGGGGAAAAAUGCCAGUGGACAAACACACUACCUCUCAUUAUCUGGAUUCGAACUUUAUGGCACUGUAAAUGGAGUAUGUGAAGAUCAGCUAGGGAAAGCAGCUAAAGAAGCAGAAGCUAAUCUUAGACGGCAGAGACGUCUAGUACGUUCCCAGGUUCUGAAAUACAUGGUUCCAGGAGCUCGUGUUAUCAGAGGCCUGGAUUGGAAAUGGCGAGAUCAGGAUGGCAGCCCACAGGGAGAAGGCACUGUCACAGGAGAACUACACAAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-326.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -355.40
Frequency: 0.0000
Diversity: 386.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((....(((((....)))))....((.(((..(((((....)))))..))).))....((.((((((..........(((((.(((((.....)))))))))).(((((((((((...))))).(((((..(((((.(((((.......)))))..(((((((.............(((((((((((((..((((........))))....)))))))))))))..........(((((((((((.(.(((((((((((....((((.....((((((((......(((((.(((((.((.((((...(((......(((((((........(((((((...(((...(((((((..(((.(((.....))))))..))....)))))....)))..)))))))...(((((.....)).)))....((((...))))..)))))))......)))..)))).))...))))).)))))..)))))))).......)))).....)))).))))))).).).))))))))))((.(((((((((((..(((((...........)))))..))))....((((.((((((((.((....))))))))))...))))....))))))).))....))))))).....(((......)))((((((.....(((......)))...(((((((.((((.((....)).))))......((((((........)))))).(((((((((........))))))))).....))))))).......(((((((((((((.(((((((((((((((.....(((((.(((((..((.....)).))))).)))))..((((((((((.............))))))))))(((((.((((((.(..((....))..).)))))).)))))...(((((.(((....))))))))(((((.(((..((((((..(((.(((.((((((((......))))......))))))).)))........(((((...((((((((((.....(..((((........))))..)))))..)))))))))))((.(((((((..(((........))).))))))).))((((.(......)))))..((((((....)))..)))((((((.......))))))))).)))))).)))))......(((((((((...)))).)))))..)))))))))))))))....))))).))))))))..)))))).)))))..))))).))))))..)))))).))))))(...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({{{..{{(({...,))|||,..,{{.{({..{({{({(({,,{(((.....))}},|||.||}}|||||,.{,...{{{{,,{{((|.....})))}}}||}.({{{{,{((((..,)))||.((((({.(((((.{{{{{.......}}|||{,(((((((.............(((((((((((((..((((........))))....)))))))))))))..,,,.....,{(((((((({.(.(((((((((((....((((.,,..((((((((.,..,,(((((,(((((.(({(((.{((((((.((..((({{,{{{{.,...(((((((.,.(((...((((((({............)))},,,.,|,,,,|)))))....))).,)))))))...|||||.....,,.,,)))..)).)),,))))...})))))...}}})),}}))))}},...}|||}.}}}}|,,}))))))}..,,},,)))}.....)))).))))))).}.}.))))))))||((.((((((({{{,..{{{{{...,.......}}}}}..}})}....((((.((((((((.{(....))})))))))...))))..,.)))}))).))},..))))))},}}},{(({....,))}((((((.,,.,(((,,,|,,,}|...((((({,.((((.((....)).))))}})}}.{{{{{{......,.))))))}|((({{,,|,,......,||||||||....,))))))).......(((((((((((({.(((((((((((((({,{{{{(({((.(((((..,,.,..,|}.}}}}}.}})}|,||{{,,,((((.({((,.,,...{||,,}}}))}(((((.((((((.(..((....))..).)))))).))))),,,{{{{|||{{{{,,|||||,,},,.,|,|||||||}}}},.{((|,,,{(((,((((......))))}))}..)}}})))),))}}..((..(((((...((((((((({.....,..((((........))))..,}})).,)))))))))))..)),,,{{{{|{{,|{...{{||}||||||,}}.||{({{.(((({.{,.{{{..,,,{{{....)))..}}}|(((((.......))))))},...))))),}}|,|||,..}||||||||})}.}}))..)))))))))))))))))))))....})))),))))))))..)))))).))))).,)))))})})))),.)),,,,,.}))))|,..)
Back