Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECTD1_0027300
Sequence Length
1094 nt
GC Content
0.3775
GUACGAACUAUGGCUCGAGAUUUAUACGAUGACCAUUUUAAAGCUGUUGAAAGCAUGCCUCGUGGAGUAGUGGUAACACUCAGAAACAUAGCAACUCAGUUAGAGUCAUCUUGGGAACUUCAUACAAAUAGACAAUGUAUUGAGAGUGAGAACACUUGGAGAGAUUUAAUGAAGACAGCUUUAGAAAACCUAAUUGUACUUUUGAAGGAUGAAAACACAAUUUCACCAUAUGAAAUGUGUAGCAGUGGCUUGGUACAAGCACUUCUUACUGUGUUAAACAAUGUAAGUUUAUCAAGUAGUAAAGAAAAAAAUACAGUUUUAAAAAUUAUUUCAACUGGUAGAAAGAAUGUUUUUAAAACUGCCUUUAGUGAAAAUGAAGAUGAUGAAAGUCGACCAGCAGUUGCGUUAAUUCGAAAGUUAAUAGCUGUACUAGAAUCUAUUGAACGUCUACCUCUCCAUUUGUAUGAUACACCAGGAUCCACAUAUAACCUCCAGAUACUUACAAGGAGAUUACGAUUUCGGUUGGAACGUGCACCUGGUGAAACUGCAUUGAUUGACAGGACUGGCAGAAUGUUGAAGAUGGAACCUUUGGCUACAGUUGAAUCUCUGGAACAGUACCUUUUGAAAAUGGUAGCAAAACAGUGGUAUGAUUUUGACCGAUCUUCAUUUGUUUUUGUUCGAAAAUUAAGAGAAGGACAAAAUUUUAUAUUUCGGCACCAGCAUGAUUUUGAUGAAAAUGGAAUCAUUUACUGGAUUGGAACAAAUGCAAAAACUGCUUAUGAAUGGGUAAAUCCAGCUGCCUAUGGACUUGUAGUAGUAACGUCAUCAGAAGGAAGAAAUCUACCUUAUGGCCGCUUAGAAGACAUACUAAGUCGUGAUAAUUCAGCUUUAAAUUGUCAUAGCAAUGAUGAUAAGAAUGCCUGGUUUGCCAUAGAUCUGGGUCUCUGGGUGAUACCAUCAGCAUAUACACUUCGUCAUGCUCGUGGUUAUGGAAGGUCUGCACUGAGAAAUUGGGUUUUCCAGGUAUCCAAAGAUGGACAGAACUGGACUUCUUUGUAUACCCAUGUUGAUGACUGCAGUCUCAAUGAACCAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-262.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -284.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 293.66
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..(((((..(((((..((((((.((..((((......(((......))).......)))).)).)).))))..))).))..)))))..((((.....)))).(((((((.....((((((((((..............(((((....)))))((((((.......((((((((..((((.....)))))))).))))....(((((...(((((.(((((.....))))))))))..((((((.((((((((.((..(((((((((((.(((((.......))))).))..)))).))))).......(((((((((((((..((((........))))....))))))))))))).(((((.......)))))..(((....))).....((....))(((((((....))))))).))))))))))...))))))..)))))..))))))))))))))))....)))))))...........((((............))))....((((....))))...))))).((((((((.((((((.(.(((((((.(((((((.(((.(((........))).))).))..)))))...((((.((..(((.(((((((.(((((.(((.((......)).))).)))))(((((.......(((((.(((((((((((..(((((...........)))))..))))....((((.((((((((.((....))))))))))...))))....))))))).))))).(((((......(((((((........)))))))......)))))......(((((...((((.((....)).))))))))).((((((........)))))).(((((((((........)))))))))((((.((((((.....((((.(((((((((.((((........))))))))).))))...)))).......))))))))))..)))))..))))))))))..))))))...(((.....)))(((((.((((((.(..((....))..).)))))).)))))..))))))).).)))))).)).....))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((..((((({,{((((,,(,,{{{.{{..{{{{......(((......))).,.....||}|.||,|||.,,,}}))).}}..}}}}}..((((.....)))).{((((((.....((((((((((...,.......,,.(((((....)))))((((((.,,,...,,{{(((({{{{{{.....}}}||||,{{{{(((({.{{{,...(((({,(((((.....)))))))))).,,(({,(((((,,.}}}}},}|((((((((((.(((((.......))))).))..))))}}})),.......(((((((((((((..((((........))))....))))))))))))).(((((.......))))).,({(....}))|||,,||.,|}})|||..|}}}}}))))))})))))).}|{{{.||,,}})}..,)))..))))))))))))))))....))))))),,,,...,,,.((((............)))).,,,.|}}}}}}}}})}..))))).((((((((.((((((.(.(((((((,({(((((.{({.(((........))).))).)),.}}))}...((((.({..(((.(((((({.{((((.(((.((......}).))).))))){|{{,,..,,|{((((({((((((({({{..{{{{{...........})})}..})))}},.((((.((((((((.{(....})})))))))...))))..,,))))))),)}},..(((((,.,...(((((((........))))))).....,)})))}}}...(((((...((((.((....)).))))})))){((((((..{{{...|||,||{((({((({(,{,,,,,.,||||||||,{{.|||||||,..|,|{|{.|||,|||{|}|{||}.,,,}})))))))))}.||||,.,||||...,...}}))}))))).}))))},,})))))))))..)}))))...{{({...,)))(((((.((((((.(..((....))..).)))))).))))),.))))))).).)))))).)),....})))))
Back