Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECTD1_0035600
Sequence Length
972 nt
GC Content
0.3930
GUGAUUGGAUGUGUCCAGUUAAUAAAGGAGAUGAUAAGAAAAAGAAAGAUACAAACAAAGAUGAAGAAGAAUGUAAUGAGCCCAAAGGAGAUCCGGAAAUGGCACCCAUAUACUUGAAAAGGUUAUUGCCAGUGUUUGCACAAACAUUUCAGCAAACUAUGCUGCCUUCAAUAAGGAAAGCAAGUCUUGCUCUAAUUCGAAAAAUGAUUCAUUUUUGCUCUGAAGCACUGUUAAAAGAAGUUUGUGAUUCUGAUGUUGGUCACAAUUUGCCUACAAUACUAGUGGAAAUCACUGCAACUGUCCUGGAUCAAGAGGAUGAUGAUGAUGGCCACUUGCUGGCUUUGCAGAUCAUAAGGGAUUUAGUAGAUAAAGGUGGUGAUAUAUUUUUGGAUCAGCUAGCCAGACUUGGUGUAAUUAGCAAAGUGUCAACGUUGGCAGGUCCUUCCUCUGAUGAUGAGAAUGAAGAGGAAUCAAAACCAGAAAAAGAAGAUGAACCACAGGAAGAUGCUAAAGAAUUGCAACAAGGUAAACCAUAUCAUUGGAGAGACUGGUCAAUCAUUAGGGGAAGGGACUGCUUAUAUAUUUGGAGUGAUGCAGCAGCCUUGGAAUUAUCUAAUGGCAGUAAUGGAUGGUUCAGAUUUAUCUUGGAUGGAAAACUUGCCACCAUGUAUUCAAGUGGUAGUCCGGAAGGUGGAUCUGACAGUUCAGAAAGCCGAAGUGAAUUCUUAGAGAAGUUACAAAGAGCUCGAGGCCAAGUAAAGCCAUCUACUUCAAGUCAACCUAUACUGUCAGCACCAGGACCCACUAAACUUACUGUAGGAAAUUGGUCACUGACAUGUUUGAAAGAAGGAGAAAUUGCUAUUCAUAAUUCAGAUGGUCAGCAAGCUACAAUAUUGAAAGAAGAUUUACCUGGUUUUGUAUUUGAAUCUAAUAGAGGAACCAAACAUUCAUUUACUGCAGAAACUUCCCUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-231.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -251.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 301.18
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((....))))))))....(((...........................((((((((((...((((.....((((......(((((.......(((((...(((..(((...)))..))))))))..((((((............))))))..((((.((((....))))..)))).)))))))))..)))).........))))))))))....((((..((((((((.((((((((.(.((((..((((((...((((((.((((((.((.((((((..((((((((...(((((((((((......(((((......(((((.....)))))......)))))....)))))))..))))...)))))))).....(((((.........)))))((((((((...((((((.((....)).)))((((..(((((((((((((((.........((....))...(((((........((((((((.......(((........))).......)))........))))).......)))))..)))))))))))))))..))))......((((((((((((((.((.(((((((((((..((..((((.....(((((.((.((((((((((((...((((....(((((((..((....)).))))))))))).)))))))))))))).)))))....)))).))..))))).......((((......))))))))))...))...).)))).))))))))).........)))...))))))))..))))))....)).))))))))))))....(((((..(((((((..(.(((..........))).)..))))))).)))))((((.(((((........................)))))))))...))))))..)))))))))).))).))))..))))...)))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((({(((({,,.|||}}}},....,||,.............,,,,...{{{{{{({{(((((((...{,,{,,...({(({,...((....}},,...{((((...(((.,(({....))}})))))))}{{((((,,..,}}}}},..{||||||{.((((.((((....})))..))))})).))))),..,}}}......,..))))))))}|{{....}}},{{.,....,|,,|||||}|.||||{{((((((.{{(,,((({({{(,,{(({((((((..((((.,.({..,(((((........))))}|.|}.})))..)))},..((((((..((.((((.,{{{{,,,{((.{{........)).)))....}))),,)))).)).)))))).{,||||||...,.|}}}}||}}}}}}}}}(((((..(((((((((((((((,........,,....))...{((((........{{(({.{{...,,..,.(((.........))}.,..{|,...||...})})).......)))))}.)))))))))))))))..))))}.....{{{{((((({{(((.({.(((((((({{{.|||,,{(((.,,..(((((.(,{((((((((((((...((((....(((((((..((....)).))))))))))).)))))))))))))}.}))))...,|||,..((({.{(({...}}}}.}}}}...},}})}}}|||...}}...)})}||.,||||}},|{{|...,,{|||{{{|,|||||,.,||||.........,)),)),,,)))}}..|||||},||||||,.}|}|,||,..,|,|}.}}|,|..}))}})))))}))}},},|.|,,.,,|,........,},...|||||||,||||,|...,,))))..))))))),))})))},))))|}|||...,,}}}))},
Back