Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECW2_0002400
Sequence Length
382 nt
GC Content
0.4215
GCUGGAUUACAGUGGGCCUUCUAGAGAGUUUUUCUUCCUGGUAUCCAGAGAACUCUUUAACCCAUAUUAUGGCUUAUUUGAAUAUUCAGCCAAUGACACAUACACAGUACAAAUAAGUCCUAUGUCUGCUUUUGUAGACAAUCACCAUGAAUGGUUCCGAUUCAGUGGUAGGAUCCUUGGUCUUGCACUAAUACACCAGUAUUUGUUGGAUGCCUUCUUCACACGGCCCUUUUAUAAGGCUCUUCUCAGAAUUCUAUGUGACCUGAGUGACCUAGAAUACCUUGAUGAAGAGUUCCAUCAGAGCCUGCAGUGGAUGAAAGACAAUGAUAUCCAUGACAUCCUAGACCUCACGUUCACUGUGAACGAAGAAGUAUUUGGGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-99.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -106.99
Frequency: 0.0000
Diversity: 86.40
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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