Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_HECW2_0005000

Sequence Length

2565 nt

GC Content

0.5497

AAAUGCUGUUUUCUCAUUCAGAUGCCUCUCCAGAAGCUGUUGGCACAAUACUUGGAGUCAAUUCUGUGAAUGGAGACUUAGGUAGCCCUUCCGAUGACGAGGACAUGCCAGGGAGCCAUCACGACAGCCAGGUGUGCUCUAAUGGGCCAGUUUCUGAGGACAGUGCUGCCGAUGGAACCCCCAAGCAUUCAUUCAGGACUAGCUCCACUCUGGAAAUAGACACAGAGGAAUUAACCUCUACGUCUUCAAGGACCUCACCUCCCAGAGGACGUCAGGAUUCACUCAAUGAUUACUUAGAUGCUAUCGAACACAAUGGCCACUCCAGGCCGGGGACAGCGACCUGCUCUGAGAGGUCCAUGGGUGCCUCUCCGAAACUGAGGAGUAGUUUUCCCACUGACACAAGACUCAAUGCCAUGCUUCAUAUUGAUUCAGAUGAAGAAGAUCACGAGUUCCAGCAAGACCUGGGUUACCCAUCUUCCUUGGAGGAGGAGGGAGGCCUGAUCAUGUUUAGCAGGGCAUCCAGAGCUGAUGAUGGAAGCCUGACAUCUCAGACAAAGCUGGAGGACAACCCUGUUGAGAAUGAGGAAGCCUCCACACACGAAGCUGCUUCCUUUGAGGAUAAGCCAGAAAAUCUUCCAGAGCUUGCAGAGAGCUCCUUACCUGCAGGCCCAGCCCCAGAGGAAGGUGAAGGCGGCCCAGAGCCUCAACCCAGUGCUGACCAGGGCAGUGCUGAACUGUGUGGCUCUCAAGAGGUAGAUCAGCCCACAAGUGGCGCAGACACAGGGACUUCCGAUGCAUCAGGAGGAAGCCGAAGAGCCGUCAGUGAGACCGAGUCUCUCGAUCAGGGCUCUGAGCCUUCCCAGGUGUCCUCUGAAACAGAACCCAGUGAUCCUGCCAGGACAGAGAGUGUGAGCGAAGCCAGCACCAGGCCUGAGGGAGAGAGUGACCUGGAAUGCGCUGACAGCUCCUGCAAUGAGAGUGUGACCACGCAGCUGUCCUCUGUGGACACACGGUGCUCCUCUCUUGAGAGCGCACGGUUUCCUGAAACCCCAGCCUUUUCUUCUCAGGAGGAGGAAGACGGAGCCUGUGCAGCAGAGCCCACCAGCAGUGGCCCUGCCGAAGGGUCGCAGGAAUCCGUGUGCACUGCUGGUUCUUUACCUGUGGUACAGGUGCCCAGUGGGGAGGAUGAAGGGCCAGGGGCAGAAUCGGCCACUGUACCUGACCAGGAGGAGCUGGGGGAGGUCUGGCAGCGGAGGGGGAGCCUGGAGGGAGCUGCAGCUGCUGCCGAGAGCCCACCGCAAGAAGAAGGCAGUGCUGGGGAGGCCCAAGGCACCUGUGAAGGGGCAACUGCCCAGGAGGAGGGCGCUACUGGAGGUUCUCAAGCCAACGGCCACCAGCCACUGCGAUCACUACCUUCAGUGCGCCAGGAUGUUAGCCGGUACCAGAGGGUGGACGAGGCUCUCCCACCAAACUGGGAGGCACGCAUUGACAGCCACGGCAGGAUCUUCUACGUGGAUCACGUAAACAGAACCACGACGUGGCAGCGACCGACAGCUCCCCCAGCCCCGCAGGUGCUGCAGAGAUCUAACUCCAUACAGCAAAUGGAGCAGCUGAACCGGCGAUAUCAGAGUAUCCGCAGAACCAUGACCAAUGAGAGGCCUGAGGAAAAUACCAAUGCUAUUGAUGGGGCAGGGGAGGAAGCUGACUUUCACCAAGCCAGUGCAGAUUUCCGACGGGAGAACAUCCUGCCUCACUCUACCUCCAGAUCCAGGAUCACGUUGCUGUUACAGUCUCCCCCCGUGAAGUUCCUCAUCAGCCCAGAGUUCUUCACCGUGCUGCAUUCUAACCCUAGUGCCUACCGCAUGUUUACAAACAACACGUGUUUGAAGCACAUGAUCACCAAAGUCCGGAGGGACACCCACCACUUUGAACGCUACCAGCAUAACCGCGACCUUGUGGGAUUCCUCAACAUGUUCGCGAACAAACAGCUAGAGCUGCCGCGGGGAUGGGAAAUGAAACAUGAUCACCAGGGCAAGGCAUUCUUUGUGGACCACAACUCCCGCACCACCACUUUCAUUGAUCCCCGGCUCCCACUUCAGAGCAGUAGACCCACAAGUGCGCUGGUUCAUCGGCAACACCUGACAAGGCAACGCAGCCACAGUGCGGGUGAGGUAGGAGAAGAUUCUCGACAUGCAGGACCACCAGUUCUUCCCAGGCCAUCCAGUACAUUCAAUACAGUCAGUAGGCCACAGUACCAGGACAUGGUUCCAGUGGCUUACAAUGACAAGAUUGUUGCAUUUCUACGUCAACCCAAUAUCUUUGAAAUUCUACAGGAGCGUCAACCUGAUCUUACCAGGAAUCACUCACUCAGGGAGAAGAUCCAAUUUAUCCGAACUGAAGGGACUCCAGGAUUGGUGCGCCUUUCAAGCGAUGCAGACCUUGUUAUGUUGCUGAGCUUAUUUGAAGAAGAGAUAAUGUCGUAUGUGCCUCCACAUGCCUUACUCCACCCCAGCUACUGUCAGUCCCCACGUGGCUCUCCCGUGUCAUCUCCUCAGAACUCGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-908.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -949.72

Frequency: 0.0000

Diversity: 510.46

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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