Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECW2_0005200
Sequence Length
394 nt
GC Content
0.4848
GUAGGAGAAGAUUCUCGACAUGCAGGACCACCAGUUCUUCCCAGGCCAUCCAGUACAUUCAAUACAGUCAGUAGGCCACAGUACCAGGACAUGGUUCCAGUGGCUUACAAUGACAAGAUUGUUGCAUUUCUACGUCAACCCAAUAUCUUUGAAAUUCUACAGGAGCGUCAACCUGAUCUUACCAGGAAUCACUCACUCAGGGAGAAGAUCCAAUUUAUCCGAACUGAAGGGACUCCAGGAUUGGUGCGCCUUUCAAGCGAUGCAGACCUUGUUAUGUUGCUGAGCUUAUUUGAAGAAGAGAUAAUGUCGUAUGUGCCUCCACAUGCCUUACUCCACCCCAGCUACUGUCAGUCCCCACGUGGCUCUCCCGUGUCAUCUCCUCAGAACUCGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-92.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -100.50
Frequency: 0.0000
Diversity: 89.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((.((((....((((((.(((..((((((((((((((.(((..(((.(((..(((((....(((((((((((((...((((.....))))....)))))))))..))))......(((((........).)))).........)))))....))).)))..)))..((((.......))))..........(((((((..((((...)))).)))...)))).))))....))))))))))..)))....(((((((((.....)))...))))))((..((((((.......))))))..))(((((((....))))))).............((((((((........)).))))))....)))))))))).)))....((....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({,((((({({,....((((({.(((.,((((((((((((((.(((..(((.(((..{(((,....(((((((((((((.,.((((.....))))....)))))))))..)))),((({,((((,.,......}.,)},.}}},}))}))))}....))).))),.)))..((((.......))))..........{{{((({.,{,,,....}}}.)))...)))).))))....)))))))))).,))).{{,((((((((({....}))...))))))||,,{({(((.......)))}}).,))(((((((....))))))).,,.,,,,.....{((((({(........}},))))))....})}))).})),}}}.,.,},.....)
Back