Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECW2_0007100
Sequence Length
646 nt
GC Content
0.5155
AUUUCCGACGGGAGAACAUCCUGCCUCACUCUACCUCCAGAUCCAGGAUCACGUUGCUGUUACAGUCUCCCCCCGUGAAGUUCCUCAUCAGCCCAGAGUUCUUCACCGUGCUGCAUUCUAACCCUAGUGCCUACCGCAUGUUUACAAACAACACGUGUUUGAAGCACAUGAUCACCAAAGUCCGGAGGGACACCCACCACUUUGAACGCUACCAGCAUAACCGCGACCUUGUGGGAUUCCUCAACAUGUUCGCGAACAAACAGCUAGAGCUGCCGCGGGGAUGGGAAAUGAAACAUGAUCACCAGGGCAAGGCAUUCUUUGUGGACCACAACUCCCGCACCACCACUUUCAUUGAUCCCCGGCUCCCACUUCAGAGCAGUAGACCCACAAGUGCGCUGGUUCAUCGGCAACACCUGACAAGGCAACGCAGCCACAGUGCGGGUGAGGUAGGAGAAGAUUCUCGACAUGCAGGACCACCAGUUCUUCCCAGGCCAUCCAGUACAUUCAAUACAGUCAGUAGGCCACAGUACCAGGACAUGGUUCCAGUGGCUUACAAUGACAAGAUUGUUGCAUUUCUACGUCAACCCAAUAUCUUUGAAAUUCUACAGGAGCGUCAACCUGAUCUUACCAGGAAUCACUCACUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-167.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -181.11
Frequency: 0.0000
Diversity: 159.06
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((...((((((((.((((((.((...(((((((..((((...))))..(((((((...............((((((...(((.........)))..)))))).(((..(((((........))))).)))..(((((((.((((((.....)))))).)).))))).....((((((..((.(((...))).))))))))...(((...)))..(((((((..((((((((...........((((....))))..((((....))))...(((((((.(...((((((..((.......(((........(((....)))........))).......)).))))))).)))))))((((........))))......))))))))..))).))))...)))))))(((((((..(((......)))...)).))))))))))))((((....))))))...))))))......))))))))..))..))(.(((............(((((((((((((...((((.....))))....)))))))))..))))....((((.(.(((((....................))))).).))))(((.(....((((.......))))...).))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.,..((((((((.((((((((((((({{{.{,..{{{{..,))}}..(((((((.....,.........((((((...(((.........)))..)))))).((({,(({{{........})}|}.....}|{(((((.((((((.....)))))),))})},}}.....((((((..((.(((...))).))))))))...(({...)))..{((((((..((((((((.....{{.,,.{(((,..,|},,..((((....))))...(((((((.{,..((((({..,{.......(((...{{...,|,,{{{||..,.,....})),......,,.))))))).)))))))((((........)))).},.}})))))))).,))).))))...})))))).{|||....||{...,,.}}}...}))}))))))))))))|,,...,}})},....|,||||...,,.))))}})),.||...,|}.{{,....,,.,...(((((((((((((.,.((((.....))))....)))))))))..)))),{{{||((((,.,......}.}},..,,,.,}}}},)))},,{{..,|(((.{....((((.......))))...}.))).,,.,)
Back