Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECW2_0008600
Sequence Length
414 nt
GC Content
0.4686
AUCUUAGGGCAGUUGGGCUAAAGAAAGGGAUGUUCUUCAAUCCUGACCCUUAUCUUAAGAUGUCAAUUCAGCCAGGAAAGAAGAGCAGUUUCCCCACCUGUGCCCACCACGGGCAGGAGAGACGGUCUACUAUCAUCAGUAACACCACCAAUCCAAUUUGGCACCGAGAGAAAUAUUCCUUUUUUGCACUUCUUACUGAUGUCUUAGAAAUUGAAAUUAAAGACAAAUUUGCCAAGAGCCGUCCCAUCAUCAAGCGUUUUCUGGGGAAACUAACCAUUCCAGUCCAGAGGCUGCUGGAGCGACAAGCCAUCGGUGAUCAAAUGCUCAGCUACAACCUUGGCAGAAGGCUCCCAGCUGACCACGUGAGUGGGUACCUCCAGUUUAAAGUGGAGGUUACGUCUUCUGUUCAUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-115.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -124.16
Frequency: 0.0000
Diversity: 75.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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