Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HECW2_0011800
Sequence Length
1415 nt
GC Content
0.4049
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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-541.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -568.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 301.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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