Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HIF1A_0000200
Sequence Length
250 nt
GC Content
0.3920
GAGAAUUGCUUGAACCUGGGAGGCGGAGGUUGCGGUGAGCCAAGAUCGCCCCAUUGCACUCCAGCCUGGGUGACAGAGCAAGACUGUGUUUCAAAAAAAUNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNUAGCACAAUACUUCUUUUUUUUGAAAUGGAGUUUUGCUCUUGUUGCCCAGGCUGGAGUGCAAUGGUGUAAUCUCAGCUCACCACAACCUCCAUCUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-126.25 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -127.43
Frequency: 0.1467
Diversity: 3.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.............)((((((((.((((((((.(((((((..((((.((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((..................................................................))))))))))))).)))))))))).))))))))))))))))))))))))).)).))))..))))))).)))))))).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.........,...)((((((((.((((((((.(((((((..((((.((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((..................................................................))))))))))))).))))))))))}})))))))))))))))))))))))).)).))))..))))))).)))))))).))))))))
Back