Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HIF1A_0009500
Sequence Length
395 nt
GC Content
0.3848
GGAACAUUAUUACAGCAGCCAGACGAUCAUGCAGCUACUACAUCACUUUCUUGGAAACGUGUAAAAGGAUGCAAAUCUAGUGAACAGAAUGGAAUGGAGCAAAAGACAAUUAUUUUAAUACCCUCUGAUUUAGCAUGUAGACUGCUGGGGCAAUCAAUGGAUGAAAGUGGAUUACCACAGCUGACCAGUUAUGAUUGUGAAGUUAAUGCUCCUAUACAAGGCAGCAGAAACCUACUGCAGGGUGAAGAAUUACUCAGAGCUUUGGAUCAAGUUAACUGAGCUUUUUCUUAAUUUCAUUCCUUUUUUUGGACACUGGUGGCUCAUUACCUAAAGCAGUCUAUUUAUAUUUUCUACAUCUAAUUUUAGAAGCCUGGCUACAAUACUGCACAAACUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-77.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -86.73
Frequency: 0.0000
Diversity: 101.68
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((........((((((((...........(((.(((...........((((((.(((((((.((((((....((((((..(((((.(((((((((...................((((((........(((.((((.((((((..(((((((.(((......((((....))))......)))....)))))))..(((....)))(((.....)))))))))....)))))))))))))(((((..(((((((((((......)))))..))))).)..)))))..)))))))))...)))))..)))))).((.......))....))).))).)))))))))))))..........))).))))))))........))).......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((.,,{{...(.((((((..,,,..((({.{{..({{{{,.,((({..,}}}}.)))}}..,),.)))}.,}}.,{{{{,((((..((,,{{{{,.............}}}}..,.}},}))}.}}},|||.((((((((((,(((.,{((....},},...((((....))))((((.((((((.......((((((((({(((((((.....))).))))...((((......))))((((((...((((({((((......))))}..))))).)))))))))))))))){((.......))}.)))))))))).....)))..)))))))))}......,{{{{{.,........))))}}.)))))).,,,,,.)),.,.....})
Back