Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HIPK2_0000600
Sequence Length
619 nt
GC Content
0.5283
UCGAGGCUUGAUGCCAGUUAAUACUGUGAAGUGGAGCGUGCGGUCAGUGGAAUUCAGAGGAAAAAGAAGGGUUGGAGCAAAGCGGCAUUCAUCUCCUGGACUGUUAGCCUUUCUAGUCUUCCUGGUGGCUGAGGUGUUCACGGGCUGGGGGAGCCAGCUGACCUUUGUCCUCUUCAACCUAGAAGACUCAGCCCGCCCAGACACCAACGUGUGAGACGGAUGGACAUCAGGAAGGGAAGGGGAGAUUAGCCCAACUGCUGACAGAACGAUUUCCCUUGGUUGGACCUUGGGAAUGGCAAACACUCAUAUUGGAACAAGCUUGGGGUGGAAGAUUUAGGCCGUGUGAGCAUGUGUGAGUGAGUGGAACAAACUUUCUUGGAAACUGGAGGGAGGAGAUGAGGAGGCUUCGGGAAGUAUUACUGAUGGCUCAUGGUUGAGAGAGCGACGUGGGGACCCAGCUCGCCCCAGCUUUUGUCCCAGGUUCUCUUUGUCUGAUGCUGAGGGCAGGGUGGGGUGUGGGACCACCACUCUUGUUGGCCUGUCAAGUAGACCCUAGGACAGAAAAUGGAAAGAAGGAAAUGGCUCGGUGCUCUCAACUAGCAGAGAGAAUUGAGGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-203.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -214.37
Frequency: 0.0000
Diversity: 165.76
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(.((((.((.(((((....)))).)..)).)))).)((.((((((((..(((.((((..........((((........)))).(((((((((((..((((((((..((((...((((((((((.((..((((((..((((((((((((...((.....))...)))(((((......))))))))))))))....))))))..(((.....)))...)).))))))))))))))(((........)))....))))))))..)...(((((..(((...)))..)))))...((..(((((((((((..(((.(((((((........)))))))..)))...)).)))))))))..)).......((((((.(....).))))))))))))))))....))))..)))...)))))))).))(((....)))....((((..(((....)))..)))).(((..((((((((.(((.(((.((((.(....(((((.(..((((((((((.....))).)))))))).)))))..).)))).))).))).))))))))..))).......)).....((((((.(((((........))))).)))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..(((..((({{((,..,|||}...,)),.})),.((.((((((((..(((.({{(..........{(((...,....)}}).{((((((((((..((((((((,{((({..,((((((((((,((,,((({((..{(((((((({{{..,||,.,,,,...}))}(((((......)))))))))))||}....}||}}}..{||.,...})),..}}.)))))))))))}})|(({.......)))....))))))))..}...(((((..(((...)))..))))),..{,..((((((((({{..(((.((((({(,,......}))}})),.)}).,,),.))))))))).,)).......((((((.{....}.)))))))))))))))}....))))..)))...)))))))).)).}.{(((((((((,{(((.{(((,,.,|||..}|||{(((.,((((((((,(({.(({.,,,{.,.},.{|||,,||||||{||||||,,,,,})).))))}}||,}}}}}|,|,|}}}.}}}.})).})))))}}..)))......,,......|}}|.}.)))))))))})))..)))..))))......
Back