Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HIPK2_0000700
Sequence Length
331 nt
GC Content
0.5166
CAAACAUUAGUGCACAUUCUCCUAGUCCUCACCCAAUGGCCUCCUCUACCCCCAUGCAUGGAGCUGCCACAUCAGAAGCCCCAAGAGAAGCUCCCUGCAGGAGAGGCCAGCUCCCUGGAUGCCCAAUUGCAUACCUGGCCGAAUCUGCCAUUGAGUCACCUUAGCAAAUAGGCUGCUGUCACUAGGACCAAGCUCUCAAGCAGAGGGAUGCCAACCUAGUCCUUACUUAGCCCACGAAUCAUCUAGAGCAUCCUCUAGUCUUUUGUGGGCUCCCUCCUUCCCAUUUGAAGAGACAUUGUUCAGAGGAAGAGGGGAAGAUUUGAAAUGUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-99.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -105.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 73.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((........))((((((.((..((((.((......(((((((.(((.......((((.((((((.......................)))))).))))))))))))))....((.((((((......)))).)).)).....(((((....((((...(((((...((((....))))..))))).....))))....)))))(((((.........))))).....((((((((((....((((((....))))))...))))))))))(((((.((((..((((((.(.....).))))))))))))))))).)))).)))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
({........|}{(((((.((..((((.((...,,,(((((({{({{.......((((.((((((.......................)))))).)))))))))))|||{...,,.((((((......)))).))||||,....,.)))}}||{{|..,{{{{{,....}}}.}}}}},.{{{{{|.....,(({{{..,,.))}|},,.....}}}}))........((((((((((....((((((....))))))...))))))))))((((,{((((..((((((.(,...,).))))))))))))))))).)))).)))))))..)
Back