Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_HIPK2_0001400

Sequence Length

1954 nt

GC Content

0.6121

CGUCAAAUCAUGUUUCCAGAACAUGGAGAUCUGCAAGCGUCGGGUGAAUAUGUAUGACACGGUGAACCAGAGCAAAACCCCUUUCAUCACGCACGUGGCCCCCAGCACGUCCACCAACCUGACCAUGACCUUUAACAACCAGCUGACCACUGUCCACAACCAGGCUCCCUCCUCUACCAGUGCCACUAUUUCCUUAGCCAAUCCCGAAGUCUCCAUACUAAACUACCCAUCUACACUCUACCAGCCCUCAGCGGCAUCCAUGGCUGCAGUGGCCCAGCGGAGCAUGCCCCUGCAGACAGGAACAGCCCAGAUUUGUGCCCGGCCUGACCCGUUCCAGCAAGCUCUCAUCGUGUGUCCCCCCGGCUUCCAAGGCUUGCAGGCCUCUCCCUCUAAGCACGCUGGCUACUCGGUGCGAAUGGAAAAUGCAGUUCCCAUCGUCACUCAAGCCCCAGGAGCUCAGCCUCUUCAGAUCCAACCAGGUCUGCUUGCCCAGCAGGCUUGGCCAAGUGGGACCCAGCAGAUCCUGCUUCCCCCAGCAUGGCAGCAACUGACUGGAGUGGCCACCCACACAUCAGUGCAGCAUGCCACCGUGAUUCCCGAGACCAUGGCAGGCACCCAGCAGCUGGCGGACUGGAGAAAUACGCAUGCUCACGGAAGCCAUUAUAAUCCCAUCAUGCAGCAGCCUGCACUAUUGACCGGUCAUGUGACCCUUCCAGCAGCACAGCCCUUAAAUGUGGGUGUGGCCCACGUGAUGCGGCAGCAGCCAACCAGCACCACCUCCUCCCGGAAGAGUAAGCAGCACCAGUCAUCUGUGAGAAAUGUCUCCACCUGUGAGGUGUCCUCCUCUCAGGCCAUCAGCUCCCCACAGCGAUCCAAGCGUGUCAAGGAGAACACACCUCCCCGCUGUGCCAUGGUGCACAGUAGCCCGGCCUGCAGCACCUCGGUCACCUGUGGGUGGGGCGACGUGGCCUCCAGCACCACCCGGGAACGGCAGCGGCAGACAAUUGUCAUUCCCGACACUCCCAGCCCCACGGUCAGCGUCAUCACCAUCAGCAGUGACACGGACGAGGAGGAGGAACAGAAACACGCCCCCACCAGCACUGUCUCCAAGCAAAGAAAAAACGUCAUCAGCUGUGUCACAGUCCACGACUCCCCCUACUCCGACUCCUCCAGCAACACCAGCCCCUACUCCGUGCAGCAGCGUGCUGGGCACAACAAUGCCAAUGCCUUUGACACCAAGGGGAGCCUGGAGAAUCACUGCACGGGGAACCCCCGAACCAUCAUCGUGCCACCCCUGAAAACCCAGGCCAGCGAAGUAUUGGUGGAGUGUGAUAGCCUGGUGCCAGUCAACACCAGUCACCACUCGUCCUCCUACAAGUCCAAGUCCUCCAGCAACGUGACCUCCACCAGCGGUCACUCUUCAGGGAGCUCAUCUGGAGCCAUCACCUACCGGCAGCAGCGGCCGGGCCCCCACUUCCAGCAGCAGCAGCCACUCAAUCUCAGCCAGGCUCAGCAGCACAUCACCACGGACCGCACUGGGAGCCACCGAAGGCAGCAGGCCUACAUCACUCCCACCAUGGCCCAGGCUCCGUACUCCUUCCCGCACAACAGCCCCAGCCACGGCACUGUGCACCCGCAUCUGGCUGCAGCCGCUGCCGCUGCCCACCUCCCCACCCAGCCCCACCUCUACACCUACACUGCGCCGGCGGCCCUGGGCUCCACCGGCACCGUGGCCCACCUGGUGGCCUCGCAAGGCUCUGCGCGCCACACCGUGCAGCACACUGCCUACCCAGCCAGCAUCGUCCACCAGGUCCCCGUGAGCAUGGGCCCCCGGGUCCUGCCCUCGCCCACCAUCCACCCGAGUCAGUAUCCAGCCCAAUUUGCCCACCAGACCUACAUCAGCGCCUCGCCAGCCUCCACCGUCUACACUGGAUACCCACUGAGCCCCGCCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-622.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -654.09

Frequency: 0.0000

Diversity: 515.95

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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