Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HIPK2_0003000
Sequence Length
462 nt
GC Content
0.6017
AAAUACGCAUGCUCACGGAAGCCAUUAUAAUCCCAUCAUGCAGCAGCCUGCACUAUUGACCGGUCAUGUGACCCUUCCAGCAGCACAGCCCUUAAAUGUGGGUGUGGCCCACGUGAUGCGGCAGCAGCCAACCAGCACCACCUCCUCCCGGAAGAGUAAGCAGCACCAGUCAUCUGUGAGAAAUGUCUCCACCUGUGAGGUGUCCUCCUCUCAGGCCAUCAGCUCCCCACAGCGAUCCAAGCGUGUCAAGGAGAACACACCUCCCCGCUGUGCCAUGGUGCACAGUAGCCCGGCCUGCAGCACCUCGGUCACCUGUGGGUGGGGCGACGUGGCCUCCAGCACCACCCGGGAACGGCAGCGGCAGACAAUUGUCAUUCCCGACACUCCCAGCCCCACGGUCAGCGUCAUCACCAUCAGCAGUGACACGGACGAGGAGGAGGAACAGAAACACGCCCCCACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-144.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -151.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 127.87
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((.((((((((...................(((((....)))))....((((.(((..(((.((.(((((.((......))........((((((...))))))(((.((((((....))).....))).)))........))))).))..)))..))).))))))))))))..))))......(((((.(((((((((((((..((..(((.(((......))))))))...(((((((.((((.......))))..(((((((......))))))).((((.((((((((.((....))...)))))))).))))(((((((((....((......((((((.(((((..(....)..))))).)))))).........)).....))))).))))..............))))))).....))))))))).........))))..)).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
......((((.((((((((...................(((((....)))))....{(((.(((..(((.((.(((((.{,.|{,..|{{,.....,({(((|,,,})}}}}||{.{{{(({....))}.....))}.},}........))))).))..)))..))).)))}))))))))..))))......(((((.(((((((((((({{,(({,{({.(((....,,}||}},....}|{||{,..((((.......))))..(((((((...,,.))}}}}}.((((.((((((((.((....))...)))))))).)))){{{((((||....,,......((((((.(((((..,....)..))))).)))))).........}}.....))}|,|}|||.,,.,........})))),)}},}},)))))))),........,))))..)),,))
Back