Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HIPK2_0004600
Sequence Length
597 nt
GC Content
0.5494
GUGAACAUGACGACAGAUUUGGAAGGGAGCGACAUGUUGGUAGAAAAGGCUGACCGGCGGGAGUUCAUUGACCUGUUGAAGAAGAUGCUGACCAUUGAUGCUGACAAGAGAAUCACUCCAAUCGAAACCCUGAACCAUCCCUUUGUCACCAUGACACACUUACUCGAUUUUCCCCACAGCACACACGUCAAAUCAUGUUUCCAGAACAUGGAGAUCUGCAAGCGUCGGGUGAAUAUGUAUGACACGGUGAACCAGAGCAAAACCCCUUUCAUCACGCACGUGGCCCCCAGCACGUCCACCAACCUGACCAUGACCUUUAACAACCAGCUGACCACUGUCCACAACCAGCCCUCAGCGGCAUCCAUGGCUGCAGUGGCCCAGCGGAGCAUGCCCCUGCAGACAGGAACAGCCCAGAUUUGUGCCCGGCCUGACCCGUUCCAGCAAGCUCUCAUCGUGUGUCCCCCCGGCUUCCAAGGCUUGCAGGCCUCUCCCUCUAAGCACGCUGGCUACUCGGUGCGAAUGGAAAAUGCAGUUCCCAUCGUCACUCAAGCCCCAGGAGCUCAGCCUCUUCAGAUCCAACCAGGUCUGCUUGCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-161.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -170.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 137.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..............))((((..(.(((((((..(((((..(((.((((((..(((((((..........))))))).....(((..((((...((.(((((....(((((((.......(((......)))..........(((((...))))).........)))))))....)))))))...)))).)))((((((...))))))((((((((((((((((((((............(((((((((....((((.............(((.((.((.(((.....(((.(((..............................(((((...(((........)))...)))))(((.(((.((.((((((.(((...((...))..))).)))))).)))))...)))..))).)))))))))).))).............))))))))))))).....)))))).......)))))))))..))))).....(((.(.((((......(((((((..((((.......))))..))).))))......))))).))))))))).)))....)))))...))).)))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..............))((((..(.(((((((.,(((((..(((.((((((,.(((((((.,........))))))).....(((..((((...((.(((((....(((((((.......{{{......,)}..........(((({...})))).........)))))))....)))))))...)))).)))((((((...})))))(((({{((((((((((((((.{..........(((((((({...,((((.............,,,.{.{(({(,,.....,||}||,,......,}},,..,,..............(((({,,,(((........}}|,,.}}})}|||.{{{.||,{{||||,||{.,,||,,.||..|}}.}}|}}}.))))}...)))}.,.,,}}})},|)}},}}..,,,...,,},..))))))))))))),}...)))))).......))))))))}..))))).....{((.{.(((({,..,.(((((((.,((((.......)))),,))).))))..,},,,,}),.))))))))).)))....))))).,.))).)))).)))))
Back