Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HIPK2_0007900
Sequence Length
1478 nt
GC Content
0.5304
GUAUGGCCUCACAUGUGCAAGUUUUCUCCCCUCACACCCUUCAAUCAAGUGCCUUCUGUAGUGUGAAGAAACUGAAAAUAGAGCCGAGUUCCAACUGGGACAUGACUGGGUACGGCUCCCACAGCAAAGUGUAUAGCCAGAGCAAGAACAUCCCCCUGUCGCAGCCAGCCACCACAACCGUCAGCACCUCCUUGCCGGUCCCAAACCCAAGCCUACCUUACGAGCAGACCAUCGUCUUCCCAGGAAGCACCGGGCACAUCGUGGUCACCUCAGCAAGCAGCACUUCUGUCACCGGGCAAGUCCUCGGCGGACCACACAACCUAAUGCGUCGAAGCACUGUGAGCCUCCUUGAUACCUACCAAAAAUGUGGACUCAAGCGUAAGAGCGAGGAGAUCGAGAACACAAGCAGCGUGCAGAUCAUCGAGGAGCAUCCACCCAUGAUUCAGAAUAAUGCAAGCGGGGCCACUGUCGCCACUGCCACCACGUCUACUGCCACCUCCAAAAACAGCGGCUCCAACAGCGAGGGCGACUAUCAGCUGGUGCAGCAUGAGGUGCUGUGCUCCAUGACCAACACCUACGAGGUCUUAGAGUUCUUGGGCCGAGGGACGUUUGGGCAAGUGGUCAAGUGCUGGAAACGGGGCACCAAUGAGAUCGUAGCCAUCAAGAUCCUGAAGAACCACCCAUCCUAUGCCCGACAAGGUCAGAUUGAAGUGAGCAUCCUGGCCCGGUUGAGCACGGAGAGUGCCGAUGACUAUAACUUCGUCCGGGCCUACGAAUGCUUCCAGCACAAGAACCACACGUGCUUGGUCUUCGAGAUGUUGGAGCAGAACCUCUAUGACUUUCUGAAGCAAAACAAGUUUAGCCCCUUGCCCCUCAAAUACAUUCGCCCAGUUCUCCAGCAGGUAGCCACAGCCCUGAUGAAACUCAAAAGCCUAGGUCUUAUCCACGCUGACCUCAAACCAGAAAACAUCAUGCUGGUGGAUCCAUCUAGACAACCAUACAGAGUCAAGGUCAUCGACUUUGGUUCAGCCAGCCACGUCUCCAAGGCUGUGUGCUCCACCUACUUGCAGUCCAGAUAUUACAGGUAAGACCGUCCACAAGGAGACAGGAGCUGCUGAAUGCCCAGUGGCACUCACAGAGAAUGUGCCACCUUAGUCACUGUGGGGAGAUAAAAUUAUAUGUCUACAGUUCCUGCCUUCAAGUGAUCUUAAUGUACUUACGAAAUUAGGACAUGUGCACAUUGCGAUGUCAAUUAGAAGUCACAUUAGAACGGAGCCAGGUAAGAUCCGUGGCACAGGUGUUCAGCGUUGGAAGGGCUCCCUGGGACCUGGGGUGCAGAGCAGAAGAGUUCCGUCCUCCCGGAUGGGUAGGAUCCAGACAGGUGGUGGAGAGAGAGGGAUGUGCCAUCCACAGUCCGCAGUCACACUAGUGGGAAUUUACAGGAGACAAGAAGGACACCCGCCUGGCCAGAACAGUUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-446.14 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -474.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 475.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((......((((...((((((((.........((....(((.((..((((........))))..)))))....))....(((((((.(((((....((((((((.((((((..(((......)))...)))).........(((((((.((.((........(((((((....(((.(((((((......(((((((......(((((..((.(((((..(((((.((....(((.((.....))))).....)))))))..))).(((..(((((((((((((.((((((..(((...((.(((.((((((.(((..(((......))).((((.(((((((((((..((((.......)))).(((..((......)))))..((((....((.(.....).))...))))))))))))).(((((((((((((................((((((.((((...................................)))).))))))..((((((((((..(((((.(((((.(((((((...)))))))((((...((((...........))))...))))..((((((.(((((.((...((((..((((((..(((((((((.((((((.((.(((((...((((.((((...............(((.(.(((..(((.((((..((((((..((.......))..))))))..)))).))).)))).)))..)))).))))...)))))..)))))).....)).)))))))))..).)))))....(((((..((((((((.(((((((......))))..))))))).)))).....)))))...))))..)).)))))..........))))))....))))).))))).....)))))(((((.(((..........))).)))))..))))).................))))))..)))))))...................(((((((((((...))))))))))).....))))))......))).)))))).))).))((((((.(((......))).)))))).))).))))....)).)))))))).)))))..)))...(((((((...........)))))))....(((((((((((((((((........))))).....)))))).....))))))..((((((((((.(..((((..(((((.((((...))))))))))))).))))).))))))(((((..((((((......)).)))).....)))))...)).))..)))))...))))))).))))))).((((......)))).((((((((....))).)))))...)))..))))))).)).)).)))))))..........)))).))))))..))))).)))))))...))))).)))...).)))......)))))..))(...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((((......(({(...((,(((((.........,{....{{,{((..((((........))))..)))}}....,}.,..(((((((.(((((....(((((({(.((((((..(((......)))...)))).,.{,....(((((((.((.((........(((((((....(((.((((({(,.....(((((((......(((((..(,.{{(((..((((({,(,...(((.((.....)))))...,.,))))))..|}}.((,.,(({{{((((((((,{{((({..(({,{{((,({{.{{{{,,.,,...{{||||,,.),}|||{{,{{(((((((({.,{{,(,.....,,|}}.(((..{{......))}}}|,{|||,,|..{.{.....|.|||..||||||}|,||||{,|,{{|||{||},.,|,,....}}}..||||||{,.{,{,,|||.,|||,.....,|{,.,{({{.,{..,.....|||,|||{{{..,,|||,|||}|,|,....|||||||||||||},})))}|))||||,.,||{{..,,,,...|,))}),,.|||,.||{((((.((({{.(((,.((((..(((((...,(((((((({(.((((..,.,{({(.{{((((,{.(({,.{{{.|{{,{..,(({.{.(((..(((,({{{..||{{|{..{|....,,,||,.}}||||,,|}}|.|||,}}},.)))|,|||{{........)))))})))))},,),.}}})}|}|||||..|..|||,..},|||||}}|||||,||},||||{|,,,...,}}},.}),,)))}}}}|,....||||,...,,,,,})),,,,}}..........)))).)}}.))))))},,.,))))).)))),||||...}}}....}},,|||{|...,,,.,,,,)}}}},......|.....,}}},|||||||({,{,,....||...||.....{{{{{{{{{{{...))))))))})).}}}|||..,}}},}}..})}))}}}},}}}.}}{{|{||.|||......,}}.}))))).},}.}}}|....))})))})))),)))))..}}|...(((((((,,.....,...)))))))....{,{(((({(((.(,(((....,,,.),))),}}}},,))},}},,.,}}},|,{((((((((((.{..{(({..(((((.((({...})))))))),))).})))).)))))))|,,}},|{{{||,..,,,}},)))),..))))}})}}))).))..)))))...))))))).))))))).((((......)))).((((((((....))).)))))...))).}))))))).)).)).)))))))}}........))}).))))))..))))).)))))))...))))).}),..,},))}......)))))..)){...}
Back