Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_HIPK2_0008100
Sequence Length
1279 nt
GC Content
0.5231
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Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-364.24 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -389.62
Frequency: 0.0000
Diversity: 372.28
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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