Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_HIPK2_0010300

Sequence Length

2637 nt

GC Content

0.4608

AAAAGCACAUUCUACCCUCAGAAAAUCUGCUGUCCAUUUGGAAUGAUAAGAUAAAUCAGAAAAUUACCCAUUGUUAGAGCUAAAAGAUUCCUUGGGGAUUAUCCAAUCCAUUAUUUUUCAAUCUCCUAUCCUGACAAAAAAGAGUAAGUGUUUUGUAUGGAGAAAAAAAAAAGAAGUUUCCCUUUGGUAAAUAAAUUUGGGCUUCAGAGCAUAUUGUAUAUCCCUCUUGGAGAUCCACGGUGUGCACUGCGAUAUUAAAGCCUCUGAGAAGUCCUGCAAAAAAGAAAACCGCUUUAUUUGAUUUAACCCAGCAUUUCUUAAACUGUUUUGACCUCAUUUUUUUCUUCUUUUUUCAUAAUAAAUAUUAGCACCUCACAGGACACUCAGCCCAGUUUGGUAAGCAUGGCCUCCUUCAUGGAAGAAGAAAUCUGUGUUCAGAAAUAUUAAGUGACUUGCUCAAAAUCAACACAAAGCCAGACUUGAAGCCAAAUUUUCUAACUCCCACUCCAUUGUUCUUUCUACAAUUUAUAACCAUGUCGUGGCUGAGUAAGGGUUUAUGACUUUUAAAGAUGUUGUCAUUUACAUUCCUAAUGGAAAAUGUAAAGGCAUUAGGGUCAUACUGACAUGUGUUUGAAUUCAGGUCCUCUGAUUUUACGAGCUCAUGACCUUGGGGGAGCGAAUCCUGCCAGUCUCUCUGGAUCUCUUUCUUCUGUAAGGUGAGGAUGAUAAUAAUGACCUCCCAGGGUUGCCGUGAGGCUUAGAUGAGAGAGUGUAUGUAAAGAUCAAGUUCACGUUCUUAUCUUUGUUUUCUCUGACAUUUUUCAUCAUACCAGGUUCUGUGCCACUUAUCUAUGAUUUCAAAAGACGAACCAUAUUACAAACAACAAAACGUGAAUGGUGGUGAUCAUACUGAGUAUUUAUUGAAUAGUGACUGAGAAAAUGAAUGCACAGGAGACAGGAGGAGUUACCUGUGAAAAUUCAGAGCUAUACUGAACUGAUCAACGUUCACGGAAUUGGAGAAAUAACAAAGGUGGGACAGGCUAGAGUGUGGAGAUUAAUGGGGGCUGAGGGAACAGGCUGUGCACUGGUAGGACAUAUUCAGGAUCUCAAGCUACCUGCCUGCCACUUCUGCAUCCCCACCGCGUCAAACUGUGGUUGAGCUUUCUUUAUUAAAUAUGUAGCAGUUUGCUUUUGAAAUACAAUAUCUUCAAAAACAAAAAUAAUGCCAGGCCUGCCAACAAAGUUUGUCCCGAGGGGGCAAAGGUGAAGGACAAGUGAAAUGUUGCAAGAGGACAGGACGAUACGAAGGAUGGGGUCCAGAGUGAAAGAAGAGGCCUAUGAGGCUCAGCACAGUGACUCUAAGAUGAAACCGAGUGUCUCCCCAGGGCGCACACAUGGAUGAAAAGUGAAGGGAAUGAAAGAGAGAGCCAGCCAUUCCAGGACUUCUGCUCUUCUCUGCAGAAAUCCUCCUUUCCUCACCAACUCUUCACCAACCCCCAAGCUUGCUUAACUAGCUUUGGAAUUUGUACUUUGUAUUUUUGAGAUAGAGUCUCACCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGCGAUCUCAGCUCACUGCAGCCUCUGCCUCCAGGGUUCAAGCAGUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGGACGACAGGCACCUGCCACCAUGUCCGGCUAAUUUUCGUAUUUUUAGUAGAGGUGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUUGAACUCCUGACCUCAAGUGAUCCGCCCAUCUCAGCCUCUCAAAGUGCUGGGAUUAUAGGCAUGAGCCACCGCGCCUGGCCGGAAUUUGUACUUUUGCCUGGUAAUUUAGUCCAGUGCCCAAACAUGAAGUGUGAGUGUUUGUUUACUGCCAGCUUGGAGGGGACACAUGCCUGAUACUGACUCACCAGUUGCAUUGGUGGUGGACUUGGCUCCUUCCCUGGGCUUCAGCCCAUGUGUGCACCAGUCUGAUCCCUUGCUCUGAAAUAUAUUAGGACUAACAGGUGUGCAGGCCUCGAAGGACCCGUCUCUUUUGAUAUCUUCCUUGUCUAGUUGCUCUCUGAUUUCUCAUGGUCCUCACUCCCUCCGGGUCUUCUCCCUGCCAGUUUCUGAGCAGGCACUUUCCGGAGCACAGUGUGUGGAUGACAGCAAAUAAGUCCUCCGAGGCUUUGACCAGGAGCACAGACAGCUUUGCCCUGGUGAGGGACGGUAGAGAGAGCACCAGUUUGCGUCCUGCUGCAGCUGCACUUUGCACAGAGCGCCUCUUCAUCUGGCAAGCAAGCAUGCAUUGUGCCAACCCUCGUCUGCCAUGCCAGGUGCUGGCUCUUUCUCCGGGGCGAUACCAGGCUAAGCAUGCUGCUGGCACUGAGCGAGUCACAGCUUCUCUAAUUUAUUUACCUCAAAUCAAACAAACCCUGACUCCUGCUUUGAAUUUAGGCUGGUAUUUUACCGAAGGACAGAAGGGCAGCAUCUCUGCAGAAGGGCCUUCUGUGCGCUUUGCCUGGGACCUCUGGGGGACUUUGCAUGACUCCUGGGGACUUCAGGAGGCCACUUUGGAAAACAAGUGUCAGGUCCUCAAAAGGUUAAACAUAGAGUCGCCACCUGACCUGGCAGUUCCACUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-799.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -851.45

Frequency: 0.0000

Diversity: 630.06

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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