Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_HOMER2_0001200

Sequence Length

1086 nt

GC Content

0.5304

AGAACAGCCCAUCUUCACCACCCGAGCGCAUGUCUUCCAGAUUGACCCCAACACCAAGAAGAACUGGAUGCCUGCGAGCAAGCAGGCGGUCACCGUUUCCUACUUCUAUGAUGUCACAAGGAACAGCUAUCGGAUCAUCAGUGUGGACGGAGCCAAGGUGAUCAUAAACAGCACAAUCACACCGAAUAUGACCUUCACCAAAACGUCACAGAAGUUUGGGCAGUGGGCCGACAGCAGAGCCAACACAGUGUUUGGUUUGGGGUUUUCCUCUGAGCAGCAGCUGACAAAGUUUGCAGAGAAAUUCCAGGAGGUGAAAGAAGCUGCCAAGAUAGCCAAAGACAAGACGCAGGAGAAAAUCGAGACCUCAAGUAAUCAUUCCCAAGAAUCUGGGCGUGAAACCCCAUCUUCUACUCAGGCAUCCAGUGUCAACGGGACGGACGAUGAAAAGGCCUCUCACGCCGGUCCAGCCAACACACACCUGAAGUCUGAGAAUGACAAGCUGAAGAUUGCCUUGACGCAGAGCGCAGCCAACGUGAAGAAGUGGGAGAUCGAGCUGCAGACCCUUCGGGAGAGCAAUGCACGGCUGACCACAGCACUGCAGGAGUCGGCAGCCAGUGUGGAGCAGUGGAAGAGGCAGUUCUCCAUCUGCCGUGAUGAGAAUGACCGGCUCCGCAACAAGAUUGAUGAGCUGGAAGAACAAUGCAGUGAGAUCAACAGAGAGAAGGAGAAGAACACGCAGCUGAAGAGGAGGAUCGAGGAGCUGGAGGCAGAGCUCCGAGAAAAGGAGACAGAGCUGAAAGAUCUCCGAAAACAAAGUGAAAUCAUACCUCAGCUCAUGUCAGAGUGCGAAUAUGUCUCUGAGAAGCUAGAGGCGGCAGAGAGAGACAAUCAAAACCUGGAAGACAAAGUGCGUUCCUUAAAGACAGACAUUGAGGAGAGCAAAUACCGACAGCGCCACCUGAAGGUGGAGUUGAAGAGCUUCCUGGAGGUGCUGGACGGGAAGAUUGACGACCUGCAUGACUUCCGCCGAGGGCUCUCCAAGCUGGGCACCGAUAACUAGGGCUGGCCGAGGCCCAGGCCCCGCCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-340.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -358.65

Frequency: 0.0000

Diversity: 268.45

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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