Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_IARS_0007400
Sequence Length
309 nt
GC Content
0.4110
GCUCCCUACACACCUUUUCUCACUGAAUUGAUGUACCAGAAUCUAAAGGUGCUGAUUGACCCUGUUUCUGUUCAGGACAAGGACACACUCAGCAUUCACUACCUCAUGCUGCCCCGUGUUCGAGAAGAAUUGAUUGACAAGAAAACAGAGAGUGCAGUAUCUCAGAUGCAGUCUGUGAUUGAACUUGGAAGAGUGAUCAGAGACCGAAAAACUAUUCCCAUAAAGUAUCCUUUGAAAGAAAUUGUGGUUAUCCAUCAAGAUCCAGAAGCUCUUAAAGAUAUCAAGUCUUUGGAGAAGUAUAUCAUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-61.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -68.85
Frequency: 0.0000
Diversity: 59.77
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......................((.(((.(((((((....((((..(((((((((((....((((((((..((((..(((((((((...((((((..........))))))....))))))........))).))))..)).))))))..))).)))))))).))))...((((.(((((..((((....))))))))).)))).(((......)))............((((....((..((((((....))).)))..))..))))((((.((((((.....))))))))))..)))))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.................,...{{.{{,{(((((((..,.((((..((((((((,,{..{.(((((((({,((((..{,,((((((...((((((..........))))))....))))))........))).}}))}.))))))))).}.},.)))))))).)))).|.((((.(((((..((((....))))))))).)))).{,.......||}....,,{|....||||}...{{..(({(((....))).}}}..)),,,},.((({{((((((.....))))))))))..))))))))}),))
Back