Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_IGSF11_0001000
Sequence Length
430 nt
GC Content
0.4698
UUCCCCCUUCUGCCCCACACUGCCAAAUCCAAGGAUCCCAGGAUAUUGGCAGCGAUGUCAUCCUGCUCUGUAGCUCAGAGGAAGGCAUUCCUCGACCAACUUACCUUUGGGAGAAGUUAGACAAUACCCUCAAACUACCUCCAACAGCUACUCAGGACCAGGUCCAGGGAACAGUCACCAUCCGGAACAUCAGUGCCCUGUCUUCAGGUUUGUACCAGUGCGUGGCUUCUAAUGCUAUUGGAACCAGCACCUGUCUUCUGGAUCUCCAGGUUAUUUCACCCCAGCCCAGGAACAUUGGACUAAUAGCUGGAGCCAUUGGCACUGGUGCAGUUAUUAUCAUUUUUUGCAUUGCACUAAUUUUAGGGGCAUUCUUUUACUGGAGAAGCAAAAAUAAAGAGGAGGAAGAAGAAGAAAUUCCUAAUGAAAUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-122.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -130.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 74.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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